Nature Plants | 戴俊彪与钱文峰课题组等提出了小立碗藓基因组...
结合以往合成基因组学研究的经验和小立碗藓自身基因组的特性,该研究提出了5条具体的基因组设计规则:1)去除所有转座子序列;2)保留每个基因上、下游3Kb、2Kb作为启动子和终止子区域,删除剩余的基因间区;3)针对每个基因设计一对PCRmark,用于区分野生型和合成型序列;4)将全部的终止密码子替换为TAA;5)在每个基因...
【一些概念】关于启动子
启动子主要由三个部分组成:核心启动子、近端启动子和远端启动子,以下以真核启动子为例介绍。核心启动子——引发转录的必要部分及转录起始点。位于靠近起始密码子的位置大约-35bp,包含RNA聚合酶结合位点、TATAbox和转录起始位点(TSS),一般转录因子蛋白和组蛋白可以在该区域结合。核心启动子区域也含有其他元件,但是...
MESB-TJU战队:基于机器学习的枯草芽孢杆菌RBS序列设计与分析丨...
在基因表达过程中,存在很多调控元件,如启动子、RBS、增强子、终止子;同样地,我们在驾驶汽车的时候,操纵汽车前进的过程中也存在很多的控制系统,如挂挡、离合器、油门和刹车,启动子就像挂挡,RBS就像离合器,增强子就像油门,终止子就像刹车。就像汽车挂一档还是二档,离合器放的快还是慢,油门踩得深还是浅,都对汽车的行进...
新年“开门红” 上海科学家合作揭示基因转录终止的机制
新民晚报讯(记者郜阳)DNA是遗传信息的载体,遗传信息通过转录从DNA传递到RNA,随后通过翻译解码成蛋白质。基因是DNA遗传信息的编码单元,基因的正确解码需要执行基因转录的RNA聚合酶严谨识别基因的起始序列(启动子)和终止序列(终止子)。转录终止过程发生异常会干扰下游基因的表达,影响DNA复制,破坏基因组稳定性等。北京时...
基因转录如何“踩刹车”?科学家揭示转录终止机制
如果转录终止过程发生异常,就会干扰下游基因表达,影响DNA复制,破坏基因组稳定性等。细菌转录终止序列示意图。据张余研究员介绍,基因的正确解码需要执行基因转录的RNA聚合酶,严谨识别基因的的起始序列(启动子)和终止序列(终止子)
《食品科学》:吉林农业大学闵伟红教授等:合成生物学构建微生物...
侯建屾等利用生长依赖启动子和去电子构建了动态分子开关,这种动态分子开关将细胞生长与莽草酸合成分开,发酵72h后生成莽草酸14.33g/L(www.e993.com)2024年10月17日。LiuChang等根据大肠杆菌和谷氨酸棒杆菌遗传密码子使用偏好性,构建适配性增强的3-脱氢奎宁酸脱水酶元件库,为合成生物学应用定制了新DNA序列,并获得可用于设计代谢工程和合成生物学...
Nature子刊:张勇团队揭示多态性重复基因的基因组演化机制
最后,研究人员以提前终止密码子(受负选择)和同义突变(受中性选择)为参照物开展分析,发现物种中完整重复基因和部分重复基因均受到强烈的负选择,暗示它们带来的剂量上升或新的嵌合结构通常都是有害的(图4)。值得注意的是,果蝇里内含子重复也受负选择,而人类内含子重复其选择压力更接近中性;这可能是因为后者其内含子长...
充电课 | 顺式作用元件分析(基础知识及预测)
按功能特性分为:通用调节元件如启动子、增强子及沉默子、绝缘子和专一性元件:如激素反应元件,cAMP反应元件等。1.增强子位于结构基因附近,能够增强该基因转录活性的一段DNA顺序称为增强子(enhancer)。2.终止子位于基因编码区下游,能够终止RNA转录合成的特殊DNA序列称为终止子(terminator)。
高考预测题:新冠奥密克戎50题
B.新冠病毒增殖过程中产生的-RNA上具有多种反密码子C.德尔塔毒株的致病性较强,可以在人体的内环境中快速繁殖D.T2噬菌体与奥密克戎的遗传物质化学组成上的区别是碱基种类和五碳糖答案D8.(2022·黑龙江·大庆四中高三阶段练习)新冠病毒是一种RNA病毒。2021年11月26日,世界卫生组织将变异毒株奥密克戎列为...
转基因和基因编辑产业化应在玉米上首先实现
有多达27214个突变位点,分布在14101个基因的起始密码子、终止密码子的突变或错误拼接位置,这些类型的突变一定能导致基因编码蛋白的功能的丧失。利用该突变体库,研究人员还开发了结合正向遗传学和反向遗传学,快速的、低成本的鉴定基因功能的新方法,并通过鉴定在赤霉素的生物合成途径中编码内根贝壳杉烯合成酶这种关键酶...