九合报告:不朽的计算——比特连接世界,词元生成未来

所有生命都使用相同的DNA编码,所有的基因在编码蛋白质时,都使用同一套密码系统来编码氨基酸;所有的生命都使用同一套“能量货币”,叫作三磷酸腺苷ATP。从人类到变形虫,从蘑菇到细菌,只有少数病毒例外。生命本身被生物学家看作是一段大自然谱写的程序代码,生命的繁殖,发育和死亡都是被预先编码的程序代码。随着人类掌握...

东北农业大学刘飞教授等:益生菌及其代谢产物调控胰高血糖素样肽-1

它们在肠道中可与矿物质结合形成脂肪酸盐;而丙酸盐和丁酸盐通过连接肠肝门静脉系统和大脑的神经回路发出信号,使自身氧化产生较高水平的ATP,进而导致宿主体内环磷酸腺苷(cAMP)水平较高,激活游离脂肪酸受体(FFAR)2、FFAR3并诱导肠道糖异生基因IGN表达,可增强肠道糖异生作用,防止饮食引起的葡萄糖稳态失调,对血糖稳态调...

从诺贝尔化学奖看AI与游戏的无限可能

2008年,基于罗塞塔构建的功能游戏Foldit应运而生,允许用户以闯关形式,将氨基酸的“链”折叠成适当的三维形状,再由科学家检验结果。它富有趣味,简洁易懂,很快吸引了全球几十万没有科学背景的普通用户加入。Foldit通过在线平台将科学问题和普通人连接起来并聚合智慧很快,人类在模式识别上的优势就显现出来,不仅准确度...

微源实验室针对胰高血糖素样肽1GLP-1类似物的杂质研究

司美格鲁肽是基于利拉鲁肽的下一代GLP-1RA,司美格鲁肽在第8位的Ala氨基酸被非天然的α氨基丁酸(Aib)氨基酸取代,以避免DPP-4降解。一个更长的十八碳硬脂酸二酸脂肪链被引入司美格鲁肽,脂肪二酸链通过一个谷氨酸和两个8-氨基-3,6-二氧辛酸(ADO)部分连接到Lys26上,以实现对白蛋白的更高亲和力。更长的...

《食品科学》:东北农业大学孟祥晨教授等:长双歧杆菌婴儿亚种利用...

B.longumsubsp.infantisATCC15697产生的3种β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶(Blon_0459、Blon_0732和Blon_2355)对LNTriII的水解能力很强。研究证明Blon_0459和Blon_0732可以利用去掉末端Gal残基后的LNH,且对LNH中β-1,6键连接的GlcNAc残基也有活性。2.1.5GNB/LNB磷酸化酶...

上海交大周冰心博士:锚定稀缺生物数据挑战,图神经网络重塑蛋白质...

第一个工作,在突变任务预测上,如下图所示,我们曾使用等变图神经网络去刻画蛋白质氨基酸的内部空间关系,其中每个节点代表一个氨基酸,在点位上表示该氨基酸的类型、理化性质等特征,图上的边连接体现氨基酸之间的相互关系,比如共同进化潜力与互相作用力影响(www.e993.com)2024年11月16日。

博简科学:人工胰岛素的前世今生,糖尿病人在新生

牛胰岛素是当时唯一被阐明化学结构的蛋白质,也是分子量最小的具有生物功能的蛋白质。把牛胰岛素想象为一串珍珠项链,它由17种、51个氨基酸构成。这些氨基酸通过形成肽键按一定顺序连接成A、B两条链,其中A链有21个氨基酸、B链有30个氨基酸,而两条链之间通过两个二硫键相连,A链内部还有一个二硫键。

不只是 AlphaFold!一文读懂蛋白质折叠的前世今生

如果两个氨基酸同时发生了变化,那么它们之间很可能存在某种联系。“你开始能够说,‘嗯,这两个东西在空间上可能靠得很近,’”伯克利实验室结构生物学家Adams说道。图|蛋白质协同进化揭示结构。(MarkBelan)但直到21世纪10年代,预测哪些氨基酸会发生接触的准确率都很低,仅在20%-24%之间。后来,科学家...

不只是 AlphaFold,一文读懂蛋白质折叠的前世今生:从“不可能”到...

这种方法既笨重,又有局限性。1971年,LouiseJohnson正在为磷酸化酶建模,当时,磷酸化酶是任何人研究过的最大蛋白质,包含842个氨基酸。为了建立模型,Johnson不得不爬上一个两层楼高的Richards盒,这是牛津为她的项目特别建造的。模型完成后,科学家们用尺子测量原子之间的距离,从而得出蛋白质结构的坐标。“...

不只是AlphaFold!一文读懂蛋白质折叠的前世今生:从“不可能”到...

这种方法既笨重,又有局限性。1971年,LouiseJohnson正在为磷酸化酶建模,当时,磷酸化酶是任何人研究过的最大蛋白质,包含842个氨基酸。为了建立模型,Johnson不得不爬上一个两层楼高的Richards盒,这是牛津为她的项目特别建造的。模型完成后,科学家们用尺子测量原子之间的距离,从而得出蛋白质结构的坐标。“...