【科技自立自强】西安交大杨铁林教授团队开发可分析脑细胞异质性...
此外,体脂率则可能通过少突胶质细胞和少突胶质前体细胞影响关节炎等疾病的发生,而BMI则未发现与关节炎有细胞特异性因果关联,提示不同肥胖表型存在不同的分子调控途径以及不同的脑效应细胞。近日,该研究成果以《利用遗传变异对基因表达的细胞类型特异性影响揭示脑细胞异质性因果效应》(Revealingbraincell-stratifiedca...
【Nature子刊】军事医学科学院伯晓晨团队开发新一代深度学习框架...
主动驱动模块可以触发癌症的标志,并赋予癌细胞适应性优势。癌症基因模块的阐明,可以大大加深科学界对癌症发展的理解,并为最佳治疗方法的设计,提供信息。自高通量测序技术发展以来,基因模块检测方法,一直是大型基因药典生物学解释的基石。目前使用的方法,主要有两个缺点。(1)最近的染色体构象捕获技术,揭示了三维(3D)基因...
西交团队研发TDEseq生物测序法,能揭示存在特定表达模式的基因
原因在于:它们在保持足够灵活性的同时,对于特定表达模式的表征更为精准。同时,它们对于单细胞数据中较大的噪声具有较好的耐受性。确定拟合函数之后,该团队在实际数据测试中又遇到了新难题:当数据集包含多个样本时,样本层面的异质性会极大地干扰分析结果。后来,他们集中精力解决样本异质性带来的干扰问题,尽管尝试了多...
华山医院程忻团队揭示脑小血管病血脑屏障功能障碍潜在机制的异质性
团队根据既往病理研究和动物模型的证据,对各脑小血管病亚型中血脑屏障功能障碍潜在的病理生理机制做出推测(图6)。本研究揭示了脑小血管病中血脑屏障功能障碍的异质性,为进一步理解脑小血管病血脑屏障功能障碍的病理生理机制,及未来开展精准治疗提供见解。图6各cSVD亚型中BBB功能障碍相关机制的推测通讯作者简介程...
...室沈宁团队发布实现单细胞水平肿瘤细胞群突变与表达异质性的...
近年来,单细胞转录组(scRNA-seq)技术得到了飞速发展与广泛应用,在肿瘤组织转录表达谱的异质性与耐药进化方面取得了一系列进展。然而,单细胞基因组水平体细胞突变(somaticmutation)等基因组突变方面的检测分析,受单细胞基因组测序技术的发展限制依然存在重重困难。由于scRNA-seq实验本身在单细胞水平所覆盖的基因组区域较...
《科学》子刊:复旦大学团队开发无创预测肿瘤异质性方法,并发现...
肿瘤异质性(ITH)的组成和成因都非常复杂,有不同的评估方法,比如说遗传学异质性(GITH)基于多区域活检样本的全基因组测序,组织学ITH和表型ITH则通过组织病理学切片中观察到的细胞形态改变评估(www.e993.com)2024年7月27日。这些方法都依赖于对肿瘤组织的多区域活组织采样,而采样是否足够全面、高质量直接影响对ITH的分析。
Nat Commun | 高见/周涛团队合作发现跟成绩好的人做室友更容易...
回归模型的一个优点是能够通过利用纵向数据和控制混杂因素来解决反向因果关系问题,如学生未来的表现不仅会受到室友之前平均表现的影响,还受到他们自己之前表现的影响。此外,室友的构成可能会产生独立的影响。但室友之间的表现差异是否鼓励学生追赶成绩优异的室友,或者室友的不一致表现、带来的负面影响是否会阻碍学生向上发展的...
Cell Reports | 西湖大学马仙珏团队揭示Ire1在肿瘤起始过程中决定...
团队在诱导产生GFP阴性的scrib突变克隆的同时,在其周围GFP阳性WT细胞中敲低或过表达Ire1/Xbp1s,发现均可显著抑制scrib克隆的清除,提高loser细胞的适应性(图3A-B),提示可能Ire1在不同细胞中的差异表达是决定细胞适应性的关键。进一步团队利用果蝇的优势,诱导了更为复杂的体内遗传模型:在loser细胞内敲低Ire1...
Nature子刊:浙江大学祝赛勇团队实现迄今最快的细胞化学重编程
相较于转录因子,小分子具有简单方便、易于操控、不插入基因组、处理可逆等优点;因此,使用纯粹小分子组合的化学重编程,不仅可将分化细胞重编程为诱导多能干细胞(iPSC),而且是一种研究细胞命运可塑性的重要体系。然而,之前已报道的化学重编程体系在速率上与传统转录因子重编程仍存在差距;化学重编程在分子轨迹上与转录...
吕坚院士团队:多材料3D、4D生物打印异质结构用于组织工程
增材制造(AM)基于离散材料逐层成型和堆叠的原理,在制造用于组织工程(TE)的复杂植入物方面已显示出显着的优势。然而,许多天然组织表现出具有不同成分和功能的各向异性异质结构。目前,多材料3D和4D生物打印(以时间为第四维)已成为构建具有异质结构的多功能植入物的有前途的解决方案,特别是具有仿生异质结构的4D打印多材...