AlphaFold为什么能精准预测蛋白质结构? | 返朴
蛋白质是美食的代名词,更是生命功能的物质基础,处处发挥作用:负责运送氧气的血红蛋白是蛋白质;帮助我们消化食物的消化酶是蛋白质;胰岛素、甲状腺素等激素是蛋白质;参加免疫反应的抗体也是蛋白质……据估计,人体内至少存在2万种不同类型的蛋白质,这些蛋白质的结构和功能千差万别,但构成它们的基本元素是一样的——由...
不只是 AlphaFold!一文读懂蛋白质折叠的前世今生:从“不可能”到...
蛋白质的结构决定了它如何与其他分子结合或相互作用,因此也决定了它在细胞中的作用。图|蛋白质结构水平(来源:MarkBelan)地球上已知的蛋白质有数亿种,未知的也有很多。它们承担着各种各样的功能:血红蛋白和肌红蛋白将氧气运输到肌肉和全身;角蛋白为头发、指甲和皮肤提供结构;胰岛素使葡萄糖进入细胞,转化为能量。
ACL 2024 | 基于知识指令的人类语言-蛋白质语言对齐模型
Mol-Instructions没有在蛋白质语料上进行预训练,难以分辨蛋白质的细微差异,导致性能不佳。这些结果验证了我们模型在遵循设计指令方面的出色能力,强调了针对特定任务进行预训练和数据集优化的重要性,以提升模型在蛋白质设计方面的性能。文章还探讨了结构相关指令和功能相关指令的蛋白质生成:InstructProtein的研究展示了其...
追问weekly | 过去一周,脑科学领域有哪些新发现?
这些蛋白质的结构非常复杂,其中β-淀粉样蛋白形成的斑块包含了多种纤维结构,显示出明显的空间异质性。Tau蛋白则形成了平行的未分枝纤维簇,通过亚断层平均技术,进一步揭示了纤维的多样性和结构特征。这些发现为发现新的治疗靶点和诊断方法提供了可能。研究发表在《自然》。??左Aβ(蓝绿色),右tau(橙红色)。#大脑...
美籍华人演员郑佩佩患的是个啥病?武侠动作拍多了惹的祸?
研究显示,tau蛋白是一种广泛存在于正常神经细胞内用来维持微管系统结构和功能的蛋白质,称为微管相关蛋白(microtubule-associatedprotein,MAP)。在某些情况下,tau蛋白出现一些异常改变,就会引起神经原纤维缠结,导致系列神经退行性疾病的发生。研究已知,tau蛋白异常不仅见于阿尔茨海默病,异常tau蛋白沉积在脑内不同部位...
谈生命科学等领域原创性基础研究成果的获得与评价 | 科技导报
作者简介:昌增益,北京大学生命科学学院教授(www.e993.com)2024年7月24日。现任中国生物化学与分子生物学会副理事长,国际生物化学与分子生物学联盟(IUBMB)执委,《ProteinScience》副主编。曾任《中国科学:生命科学》常务副主编。研究方向为蛋白质结构与功能关系,特别关注活细胞中蛋白质分子的行为。
第五届食品科学与人类健康国际研讨会-刘红芝教授:酿酒酵母短肽
酿酒酵母短肽与细胞壁多糖结构设计、高效制备与功能活性研究我国酿酒酵母资源丰富,但多作为饲料或当做废水排放,造成了资源浪费与环境污染。酵母的主要营养成分包括蛋白质和碳水化合物,酵母蛋白、β-葡聚糖均为新资源食品,因具有多种功效而备受关注。本研究通过蛋白组学分析技术结合计算机模拟、分子对接等生物信息学方法筛...
揭秘英伟达A100、A800、H100、H800 GPU如何实现高性能大模型的...
大语言模型的关键特征之一是展现出预训练语言模型所不具备的涌现能力,即只有模型达到一定规模后才出现的全新能力。当涌现能力出现时,性能会突然显著提升,超过随机水平,类似于物理学中的相变现象。涌现能力可以与复杂任务相关,需要关注那些能广泛解决任务的通用能力。下面简要介绍大语言模型的三种典型涌现能力和相关的代表性...
他,博士毕业五年就获“国家杰青”资助,玩转核酸材料!
结果表明,LHG的构象和跨膜模式在FGA过程中起主导作用。FGA脂质体的形成具有良好的稳定性,这可能进一步为细胞骨架-膜蛋白-脂质双层模型提供证据。作者相信,该系统提供了进一步的证据,证明细胞骨架-膜蛋白-脂质双层结构有助于细胞膜的稳定性,这提高了我们对细胞骨架结构和功能的理解,并有利于设计新型药物递送载体。
除了下围棋,AI还能预测“难缠“的蛋白质结构,它是怎么做到的?
Alpha-Fold从中找寻氨基酸分子之间的相互作用、蛋白质片段之间的演化关系,从而获得了预测蛋白质结构的强大能力。最终,只要知道蛋白质的氨基酸序列,就能迅速而准确地预测出它的结构,相当于通过精妙的算法,将蛋白质的一级结构和三级结构准确地联系了起来。在2018年的蛋白质结构预测竞赛中,AlphaFold在所有参赛团队中排名...