中国科大在蛋白质设计领域取得重要进展

图1从头设计蛋白质的实际空间结构(黄色)与目标结构(红色)比较。作为生命功能的主要执行者,蛋白质氨基酸序列和空间结构之间的关系是科学界悬而未决的课题。如何在广袤的序列空间中选择合适的序列,使之折叠成特定的结构,不但有助于认识这一科学问题,而且能够为按需创造人工功能蛋白打下基础。近十年来,国际上蛋白质设...

...杨茂君破译线粒体超大分子量多酶复合物的全景空间结构及组装机制

二者同属α-酮酸脱氢酶复合体家族(OADHcfamily)1,该家族成员主要由三个种类的酶单元多聚构成:(E1)α-酮酸脱氢酶家族蛋白;(E2)酰基转移酶家族蛋白;(E3)黄素蛋白;其分子量在4到10兆道尔顿(MDa)之间。长期研究表明,OADHc在线粒体内多条能量代谢通路上均发挥重要作用。其中,PDHc作为糖代谢过程中的门...

同时生成蛋白序列和结构,David Baker团队序列空间扩散新模型

蛋白质去噪扩散概率模型用于从头生成蛋白质骨架,但其在引导生成具有序列特异性属性和功能特性的蛋白质方面存在局限。为了克服这一限制,华盛顿大学DavidBaker团队,开发了一种基于RoseTTAFold的序列空间扩散模型ProteinGenerator(PG),可同时生成蛋白质序列和结构。从噪声序列表示开始,PG通过迭代去噪生成序列和结构对...

...Methods | 揭示糖基化奥秘:GlycoShape工具助力精准糖蛋白结构...

GlycoShape的开发补足了实验结构生物学和蛋白质结构预测技术在捕捉糖链结构方面的不足,为生命科学领域的研究者提供了更精确的蛋白质功能信息。此外,通过广泛的分子动力学模拟,GlycoShape能够对糖蛋白的三维(3D)结构进行全面分析,帮助研究人员更好地理解糖链在生物学中的多种功能。此工具不仅支持直接从开放数据源中获取蛋...

AI蛋白质折叠:在生命宇宙中漫游,远眺生物经济的流光

从生命科学的角度来说,蛋白质是生命体内四种主要大分子之一(另外三种分别是核酸、多糖和脂质)。在生命体内,DNA作为生命信息的载体,负责遗传信息的存储。围绕它的研究、技术及应用,构成了20世纪人类生命科学领域最重大的进步之一。而关于它的故事,从20世纪50年代双螺旋结构的发现,到当下各种新兴医疗技术的诞生,人们已经...

AI又一突破!填补蛋白质设计一大空白,或揭秘癌症、痴呆症发病机制

02IDPs是一种无法折叠成稳定或有序三维结构的蛋白质,被认为在健康系统和各种疾病的病理生理学中都具有重要的生物学意义(www.e993.com)2024年11月10日。03该算法利用粗粒度模拟和自由能计算,结合蒙特卡洛采样方法,在序列空间中进行搜索,生成具有目标结构特征的蛋白质序列。04通过实验验证了设计的IDPs变体,并使用机器学习模型来预测IDPs的集合属性,...

诺贝尔化学奖是AI for Science,物理奖是Science for AI

右侧展示了从氨基酸到蛋白质的形成过程:氨基酸首先以“串珠子”的方式连接成一条链(STRINGOFAMINOACIDS);这条氨基酸链最终会折叠成特定的三维结构,形成功能性蛋白质(PROTEIN);这张图很好地诠释了2024年诺贝尔化学奖的两个核心发现:如何利用这20种氨基酸设计新的蛋白质(DavidBaker的工作);...

AI从业者怎么做Science?清华大学AIR周浩:从文本生成到蛋白质设计...

第三,分子数据顺序缺失。文本对自左至右的依赖非常少,所以它可以通过GPT自左至右生成新的文本。但蛋白质的双向依赖性非常强,其前后左右顺序又不易确定,如果直接使用文本或图像模型来生成分子结构,将面临极大的困难。为了应对上述挑战,周浩教授团队在数据结构、生成算法以及基座构建等方面进行了深入研究。

31.5公斤 空间科学实验样品顺利返回并交付科学家

据央视新闻客户端消息,4月30日,中国空间站第六批空间科学实验样品随神舟十七号飞船顺利返回。本次下行返回的科学实验样品涉及23项科学实验项目,包括人成骨细胞、骨髓间充质干细胞、蛋白质晶体、生命有机分子、种子等32种生命实验样品以及无容器材料、高温材料和舱外暴露材料等18种材料样品,总重量约31.5公斤。

...基础化学#》形考作业1|辅酶|氢键|酪氨酸|丙氨酸|蛋白质_网易订阅

E.使蛋白质溶液的pH值等于蛋白质等电点2.蛋白质的一级结构和空间结构决定于()A.分子中氢键B.分子中次级键C.氨基酸组成和顺序D.分子内部疏水键E.分子中二硫键的数量3.患有口腔炎应服用()A.维生素B1B.维生素B2C.维生素CD.维生素PP...