清华大学张数一团队开发EvoAI系统,实现对蛋白质序列-功能空间的的...

其结果显示,尽管绝大多数突变对于蛋白功能都有不同程度的提升,但不同的单点突变对于不同的突变组合而言,产生的功能效应并非都是提升,一些突变位点能够提升蛋白功能,但会干扰其他的突变位点的效应,这反映了蛋白质序列空间的高复杂度。图一.EvoScan系统构成和蛋白质序列-功能空间压缩为了理解和重构这个高纬度复杂空...

为什么说想了解AI+合成生物学,必须先搞懂蛋白质?

这种方法需要先根据蛋白质实际3D结构对蛋白质进行建模,再识别出可能影响蛋白质功能的氨基酸,解析水平严重受限于相对稀缺而难于得到的可分辨3D蛋白质结构。为了获得更多可分辨的3D蛋白质结构,蛋白质结构生物学应运而生。1959年,佩鲁茨和肯德鲁对血红蛋白和肌红蛋白进行结构分析,解决了三维空间结构,并因此获得1962...

中国血制品行业发展现状研究与投资前景预测报告(2024-2031年)

免疫球蛋白(Ig)指具有抗体(Ab)活性或化学结构,与抗体分子相似的球蛋白。人免疫球蛋白是人体对细菌、病毒等外来抗原进行免疫应答的主要物质,也称为抗体。所以给人体补充外源性的人免疫球蛋白制剂具有免疫替代和免疫调节的功能,是一种快速提升受者抵抗力的手段,一般应用于自身免疫性疾病以及对部分重症患者的辅助治疗上。

上海交大周冰心博士:锚定稀缺生物数据挑战,图神经网络重塑蛋白质...

第一个工作,在突变任务预测上,如下图所示,我们曾使用等变图神经网络去刻画蛋白质氨基酸的内部空间关系,其中每个节点代表一个氨基酸,在点位上表示该氨基酸的类型、理化性质等特征,图上的边连接体现氨基酸之间的相互关系,比如共同进化潜力与互相作用力影响。随后,我们使用预测模型给不同的突变体打分,并识别出最有可能优...

Nature: 一种基于宏基因组序列空间生成无参考的蛋白质家族的计算...

我们根据这些家族的分类学、栖息地、地理分布和基因邻近分布对其进行了注释,并在有足够序列多样性的情况下预测了蛋白质的三维模型,揭示了新的结构。总之,我们的研究结果揭示了一个极其多样化的功能空间,突出了进一步探索微生物功能暗物质的重要性。-正文-...

人人可及的空间蛋白质组

空间多组学结合了组学研究(如基因组学、转录组学、蛋白质组学等)和空间生物学的概念,其主要目标是确定细胞和组织在空间上的组织结构,以及这种空间结构如何影响基因表达、细胞功能和细胞间的相互作用(www.e993.com)2024年11月28日。已经被大家所熟知的空间转录组基于转录组信息推测细胞功能和细胞之间的互作仍存在一定局限性,虽然mRNA及其同源蛋白之间有...

...资本寒冬逆势火热、近3年吸金443亿,万物偶联最具想象空间?

此外,ADC药物是一类系统集成性很高的产品,研发工作需要广泛的生物学、化学和生产方面的专有技术及能力,在设计和开发上面临诸多挑战。其未来改进与创新方向包括:低毒、高效,降低生产成本,增加患者可及性,临床上和其他药物联合,泛肿瘤化方向。从结构上来看,ADC主要包括抗体(靶向端)、连接子、小分子毒素(载荷)三个结构...

从首单货物到首批企业,中关村综保区打造“研发创新”特色综保区

科研人员利用冷冻透射电子显微镜做蛋白质结构解析时,需要将冷冻处理的蛋白原液滴到“电镜载网”上。陆伟俊解释,“电镜载网”起到支撑样品并提供导电性的作用。通俗地理解,冷冻透射电子显微镜与电镜载网的关系,就像打印机与墨粉。“德国是高端冷冻电镜载网的主要生产国,全球每年消耗约200万片电镜载网,中国市场占比约15...

2024年贵州医科大学硕士研究生招生考试生物化学(自命题)考试大纲

级结构。3.蛋白质结构与功能的关系:蛋白质一级结构是高级结构和功能的基础,蛋白质的空间结构与功能的关系。4.蛋白质的理化性质:蛋白质的两性电离性质,胶体性质,蛋白质的变性、复性与沉淀,蛋白质的紫外吸收性质,蛋白质的呈色反应。5.蛋白质的分离纯化:透析及超滤法、有机溶剂沉淀法、盐...

追问weekly | 过去一周,脑科学领域有哪些新发现?

研究团队利用果蝇模型,探讨了休眠神经干细胞向神经节延伸的富含肌动蛋白(actin)的突起的功能。通过扩展和超分辨率显微镜,科学家们揭示了这些突起中的精细肌动蛋白丝(F-actin)结构,并发现F-actin的聚合能够促进心肌相关转录因子的核转位,这一过程对于神经干细胞的再激活和大脑发育至关重要。