AI精准预测蛋白质结构,结构生物学何去何从?颜宁等人点评
帮助解析了竞赛中涉及到的、实验多年没拿到的X射线晶体和cryo-EM冷冻电镜结构,比如T1058的膜蛋白是用了Alphafold2的预测模型之后,才跟原有晶体学数据综合成功解析了结构。AlphaFold2团队的JohnJumper报告表明,他们使用了基于注意机制的神经网络,动态调整网络中节点的顺序和链接;依靠的是端到端的优化整体构建结构,而不...
诺奖2024|专家解读:颁给蛋白质预测和AI实至名归,化学家还不会...
不同氨基酸的区别在于它们的侧链基团不同,这影响了它们在蛋白质结构中的相互作用和功能。当两个氨基酸相遇时,其中一个的羧基结构会和另一个的氨基发生反应,形成肽键将它们连接在一起,如此形成多肽链。这便是蛋白质的“一级结构”。多肽链会以螺旋或折叠的方式形成特定的“二级结构”,这些二级结构又能通过连接结构...
科普|人工智能助力破解蛋白质神奇结构密码——2024年诺贝尔化学奖...
蛋白质结构预测真正凸显了人工智能的力量,使人们得以将人工智能方法应用于蛋白质设计,大大提高了设计的能力和准确性。
2024化学诺奖接力青睐AI,蛋白质结构预测新工具获一半奖项
蛋白质拥有广泛的生物学功能,包括结构组分(胶原蛋白)、催化功能(酶)、调节作用(激素)、物质运输(血红蛋白)、机械收缩(肌动蛋白)、机体免疫(抗体)等,进而参与几乎所有生命过程,如分子水平的DNA复制和转录、蛋白质翻译、物质与能量代谢等,以及细胞层面的精卵融合、细胞增殖和分化、细胞凋亡和坏死、细胞衰老和细胞通信等...
...了,专家解读:2024诺贝尔化学奖为何颁给蛋白质的AI计算和结构预测
然而,其神奇之处在于这串‘珍珠项链’可以根据氨基酸的类型和排列顺序自发地折叠成特定形状的结构,从而决定其在生物体内独特的生物学功能。蛋白质序列的决定了它的结构和功能,就像一把钥匙只有对应形状的锁才能打开一样。”“蛋白质结构预测,实际上是个古老的问题,大家一直在破译的路上,而这次获奖成果解决了一个...
AI再问鼎诺贝尔化学奖!48岁DeepMind创始人因蛋白质结构预测摘桂冠
蛋白质可由十几个到几千个氨基酸组成,氨基酸链会折叠成特定的三维结构,而这种结构决定了蛋白质的功能有些蛋白质成为生命体的基本单元,可以构建肌肉、角或羽毛,而其他的则可能成为激素或抗体(www.e993.com)2024年10月17日。其中许多蛋白质会形成酶,以惊人的精确度驱动生命的各种化学反应。位于细胞表面的蛋白质同样重要,它们充当细胞与其周围环境之...
他们用AI破译蛋白质结构“密码”——三位科学家分享2024年诺贝尔...
精准预测蛋白质结构在蛋白质的世界里,氨基酸以长链的形式相连,折叠成复杂的三维结构,赋予蛋白质重要功能。自20世纪70年代以来,科学家一直致力于根据氨基酸序列预测蛋白质结构,但这是一项极其艰巨的任务。因为有些氨基酸和其他氨基酸相互作用,有些氨基酸则具有疏水性。而且氨基酸链形成了复杂的形状,使精准确定蛋白质结构...
面对蛋白质难题,这次有了空前强大的新工具——透视2024年诺贝尔...
这就使得相关的研究者们,可以用比之前快得多的速度,去解析各种蛋白质的结构,进而搞清楚各种蛋白质的功能与特性。更进一步地,通过计算蛋白质设计,科学家们可以去人为地构建具有某种特性的蛋白质分子。例如在RoseTTAFold的研究中,研究人员利用ProteinMPNN和RoseTTAFold方法,设计出了自然界中原本不存在的蛋白质。在未来,这...
蛋白质设计师David Baker:我喜欢做那些“魔法”般的事
蛋白质是生命活动的直接执行者,其结构与功能由氨基酸一级序列所决定。由Baker研究组开发的Rosetta软件包可以对蛋白质结构进行计算预测与设计。能够从零开始设计蛋白质结构和功能,意味着我们可以创造出具有各种功能的全新的生命活动执行者,并将其应用于生物医学研究的方方面面。
关注2024诺奖|借助计算机模拟“上帝之手”,蛋白质设计不负众望...
我们现在可以预测蛋白质结构并设计自己的蛋白质,这给人类带来了极大的益处。郑鹏教授科普道,蛋白质是生命执行各类生理功能最重要生物大分子,例如维持身体结构、促进代谢、支持免疫系统等方面发挥着至关重要的作用。“比如用于消化的酶、抵御病毒的抗体、人体的肌肉都是由蛋白组成的。”郑鹏表示,蛋白质设计与人类可以说息...