单细胞蛋白质组测序原理
一、细胞分离首先,需要获得单一细胞。这通常通过流式细胞仪或微流控设备完成,这两种设备都可以对单一细胞进行排序并分离出来。二、蛋白质提取随后,从单一细胞中提取蛋白质。这通常通过裂解细胞并使用蛋白酶进行消化来完成。消化后的蛋白质样本然后进行洗涤和浓缩,以准备进行质谱分析。三、质谱分析将样本引入质谱...
Nat Commun | 结合机器学习与血浆蛋白质组质谱分析可提前7年预测...
结果显示,共确定了三个主要通路簇,包括1)丝氨酸蛋白酶抑制剂或丝氨酸蛋白酶以及补体和凝血成分的表达;2)内质网(ER)应激/热休克相关蛋白;3)VCAM1、SELE和PPP3CB的表达。参与炎症反应的通路富集分数最高,如急性期反应信号通路、凝血系统和补体系统等。炎症相关通路、蛋白质折叠调节和ER应激途径表现出最高显著性;蛋白...
Nature子刊:尹鹏团队发明质谱流式信号放大技术,大幅提高单细胞及...
但当分析极低丰度蛋白的单细胞信号或微生物单细胞蛋白信号需要更强信号时,可在线型ACE基础上应用分支ACE(branchingACE)以达到对抗原信号的500倍以上的放大。为配合质谱流式多维度蛋白表位分析特点,该团队通过设计正交DNA探针序列实现了对33种蛋白表位互不干扰的同时信号放大。图1.ACE技术流程示意图图2.应用ACE...
动态追踪蛋白质结构:深入了解氢氘交换质谱的原理与应用
氢氘交换质谱是一种测量蛋白质中氢和氘交换的技术。当蛋白质暴露在含有氘化物的缓冲液中时,氢原子会被氘原子取代。交换速率取决于蛋白质的结构和溶液条件。通过质谱仪测量交换后的蛋白质样品,可以得到关于蛋白质结构的信息。交换速率较快的区域通常对应于蛋白质表面暴露的区域,而交换速率较慢的区域则对应于蛋白质...
探秘蛋白质质谱检测技术:解析生物药物品质与有效性的关键
蛋白质质谱检测是利用质谱仪器对生物样品中的蛋白质进行分析和检测的技术。它通过将蛋白质样品离子化并在质谱仪中进行分析,得到蛋白质的质量、结构和功能等信息。蛋白质质谱检测的主要步骤包括样品制备、离子化、分离和检测等。2.蛋白质质谱检测技术的原理与方法...
Nature | 大脑生化地图:深度学习加速的高通量质谱成像新视角
数据预处理:对原始质谱数据进行标准化处理,包括噪声去除、基线校正等,为深度学习模型提供干净的输入数据(www.e993.com)2024年9月7日。模型训练:使用高分辨率的质谱图像作为训练数据,训练深度学习模型识别和学习分子分布的模式。特征提取:深度学习模型通过学习质谱数据中的特征,能够识别出不同分子的特定信号,实现更精确的分子定位和鉴定。
热点剖析:RNA 修饰-m7G 发生机制及研究方法
i)原理:使用特异性抗体对m7G修饰的RNA进行免疫共沉淀,然后进行RNA测序。ii)应用:适用于研究m7G修饰与特定蛋白质的相互作用,分析修饰对RNA功能的影响。MeRIP-seq(甲基化RNA免疫共沉淀测序):i)原理:使用抗m7G抗体进行甲基化RNA的富集,然后进行高通量测序。
分子互作|蛋白与蛋白、核酸、小分子互作检测技术介绍、应用及资料...
原理GSTpulldown技术基于GST标签和谷胱甘肽(GSH)的特异性高亲和力,将带有GST标签的目标蛋白固定于GSH琼脂糖珠上,当细胞裂解液经过该基质时,与目标蛋白有相互作用的蛋白或者大分子会被吸附,而没有被吸附的杂质则随缓冲液流出。??技术特点实验步骤相对简单,不需要用到特殊的仪器设备。实验条件温和。可以证明两...
当单细胞携手质谱,生命科学研究有哪些新突破?——第十四届质谱...
在金纳米粒子上修饰特定适配体,选择性结合循环肿瘤细胞(CTCs)表面表达的标志蛋白,在微流控通道中高效捕获血液中的CTCs,ICP-MS检测Au同位素,分析单个CTC上肿瘤标志蛋白的表达水平。在此基础上,发展了单细胞二维分析系统。在微通道中,于极端温和流速条件下,实现单细胞聚焦。激光诱导荧光(LIF)和ICP-MS二维检测,分别...
超声波细胞粉碎机进行蛋白质提取实验的6个步骤
在选择超声波细胞粉碎机参数时,需要根据样品的特点和实验要求进行选择。一般来说,超声波的功率、频率、时间和脉冲等参数都会影响破碎效果和蛋白质提取量。需要根据具体情况进行调整和优化。三、样品破碎将待破碎的细胞样品放入超声波细胞粉碎机中,根据设定的参数进行破碎。在破碎过程中,超声波的高强度振动能够使细胞壁...