怎样用磷酸化蛋白质组学研究癌症?盘点AACR前沿研究
2)不同癌症或癌旁组织的蛋白磷酸化水平或相对该蛋白总量的磷酸化水平对比3)两个蛋白的表达水平,磷酸化水平或相对磷酸化水平的相关性分析4)蛋白组学数据与转录数据的相关性分析。目前,它收录了11种癌症的数据。cProSite源代码可于github上公开查看。开发记录显示它正在活跃开发中。4014号摘要来自美国哥伦比亚大学L...
《食品科学》:湖北工业大学王志教授等:苹果酸补料策略提高枯草...
citZ(编码柠檬酸合酶)表达上调了2.10倍,ppaC(编码锰依赖型焦磷酸酶)催化ADP的合成,其表达水平上调了1.46倍,说明TCA循环碳流量通路增加,电子传递链末端磷酸化底物(ADP)供应加强,促进了能量代谢。此外,22h的poxL(编码丙酮酸氧化酶)下调了72.9%,说明经由丙酮酸氧化酶生成H2O2的效率下降,降低了H2O2积累,这与发...
《食品科学》:哈尔滨工业大学王振宇教授等:食源性蛋白酪氨酸磷酸...
通过化学修饰活性位点Cys215,PTP1B活性经历氧化或S-亚硝基化而失活。PTP1B的B位点是由Arg24、Arg254、Met258和Gln262等组成的非保守结合位点,对底物特异性识别具有重要作用,其中Arg24和Arg254与磷酸化底物间的相互作用至关重要。变构位点由一些独特的α-螺旋(α3、α6和α7等)组成,当PTP1B分子的C端结构域影...
Cell Research丨林圣彩课题组揭示机体碳源利用转换的新机制
与AMPK-PDZD8-GLS1直接作用于线粒体的谷氨酰胺氧化不同,AMPK-ACC对脂肪酸氧化的促进是间接的:需要AMPK磷酸化并抑制ACC足够长的时间才能使得ACC的产物malonyl-CoA的水平下降到一定的水平,才能解除malonyl-CoA对线粒体脂肪酸氧化的抑制作用,才能够提升脂肪酸氧化的水平。而这一点在低糖条件下,溶酶体通路所介导的AMPK...
填补生命体系人工催化剂空白:上海交大团队研发人工蛋白调节剂,可...
具体机理为:表面氧空穴周边的铈离子,能够分别吸附亲核试剂和磷酸化底物的磷酸基团,进而促进亲核试剂针对磷酸基团亲核发起进攻,从而让磷酸化的蛋白质分子发生去磷酸化反应。基于此,受到天然蛋白磷酸酶催化结构的启发,他们设计了一种表面氧空穴驱动的阳离子交换策略。
做肿瘤糖酵解研究,这个检测少不了|atp|介导|磷酸化|糖酵解|线粒体...
因为有氧呼吸是在第三阶段(氧化磷酸化阶段)才消耗氧分子,所以测定氧消耗速率反映的是有氧呼吸的水平以及潜力的变化(www.e993.com)2024年9月15日。既然XF技术是实时检测氧气含量变化,那么我们肯定是需要细胞耗氧能力发生变化的,所以我们可以将呼吸链上的不同蛋白逐个抑制掉。1.1ATP合成酶抑制剂——Oligomycin(寡霉素)...
山东中医药大学: 黄芪-葛根药对治疗糖尿病心肌病的理论探讨
心肌细胞长期缺氧缺血状态会诱导Ca2+超载激活钙蛋白酶1,进一步激活NF-κB,最终导致下游TNF-α、IL-1β等表达增加,产生心肌炎症反应及心肌纤维化,黄芪多糖可显著抑制钙蛋白酶1表达及NF-κB磷酸化水平,发挥抗炎、抗纤维化功效[21]。
解析R848结合流感疫苗的偶联剂依赖效应:对APC激活及体内免疫原性...
选择刺激后135分钟的时间点,计算磷酸化IκBα/总IκBα的比值。实验结果:-IPR8-GMBS-R848疫苗刺激的细胞中磷酸化IκBα/总IκBα比率显著增加,与其他疫苗相比。-不同疫苗刺激组的总IκBα水平相似,支持在IPR8-GMBS-R848刺激的MODC中NF-κB的激活增加。
中国药科大:丹参生物活性化合物的心脏保护机制
基于激酶底物富集分析,我们发现不同变化的磷酸位点集中在35种激酶上(补充数据S6)。11种激酶与IR数据集中富集的激酶重叠(图S3D),PKC、PKA和CaMKII按FDR值排名前三。在DHT(2??M,10??M)和TSI(10??M)处理中,这三个底物的磷酸化水平显示出更显著的变化(图3E)。蛋白质印迹证实了磷酸化蛋白质组学分析中出现的...
...| 施裕丰/江赐忠/房静远/陈菊祥发现癌细胞对氧化磷酸化抑制的...
模式图:肿瘤细胞线粒体抑制剂敏感株和耐药株具有不同的基因表达特征小檗碱(Berberine)可以抑制线粒体氧化磷酸化通路。通过服用小檗碱的结直肠腺瘤病人进行回顾性研究,作者发现肿瘤不复发的病人的肿瘤样本中DNMT1高表达且NNMT低表达,表明服用小檗碱的药物起到了作用,肿瘤对线粒体氧化磷酸化的抑制剂比较敏感,使用氧化...