iMeta | 北大深圳医院桂耀庭组揭示弱精子症患者精浆微生态的动态...
(C)物种组成和丰度表现:图例提供了关于每个群落中物种相对频率(%)信息。(D)不同群体的α多样性分析:(1)Observed:计算给定群落中观察到独特物种的数量。(2)Chao1:用于估算单个群落内物种真实丰富度的估计值。(3)ACE:用来评价群落内物种丰富度的估计值。(4)Shannon:衡量群落内部的多样性,同时考虑物种丰富度和均匀...
《食品科学》:西北农林科技大学赵善廷教授等:元宝枫油对衰老果蝇...
采用3种方法比较10日龄年轻果蝇、30日龄老年果蝇和元宝枫油饲喂的30日龄老年果蝇的肠道菌群α多样性,Chao1指数主要显示肠道菌群种类的多少,Shannon指数和Simpson指数两者算法不同,但都是综合肠道菌群中细菌物种多寡和丰度均匀性的指标,物种越多、均匀度越一致,则Shannon指数和Simpson指数越高。如图7所示,与10日...
中国科技期刊卓越行动计划推介:《生物多样性》2024年第6期
(2)对林麝的行为数据进行统计并计算行为多样性指数,分析不同季节、性别、年龄组和生境间的差异。结果显示:(1)通过野生林麝845张有效照片和133段视频辨识了林麝7种姿势、65种动作和32种行为,基本涵盖了林麝的主要日常行为;(2)不同季节的行为多样性指数存在差异,春季(H春=0.8922,r春=0.3850)>夏...
中科院1区-中国中医科学院:发酵杜仲叶水提物通过维持肠道稳态和...
FELE组乳杆菌、Rombousia、罗氏菌的丰度明显高于HFD组(p<0.05)。此外,HFD组瘤胃球菌、Clostridiales_unclassified和阿克曼菌的丰度高于ND组,FELE干预后下降。这些结果表明,FELE可以显著影响HFD大鼠肠道微生物群的组成。6.大鼠肠道菌群与高脂血症表型的相关性分析我们计算了丰度变化显著的前15个属与高脂血症相关指数...
【专家视点】袁吉伟:金融机构需加强生物多样性风险评估和测量
该指标主要比较受到外部压力后的物种丰度与未受影响时物种丰度变化情况,指标数值为0至1之间。该指标越高表示生物多样性保持得较好,该指标越低表示生物多样性完成性较低。计算MSA时,只考虑未受干扰区域的最初物种,不考虑新增物种,避免夸大该指数,获得错误信息。
美国商务部长称将加大力度限制尖端芯片对华出口
该模型可在每种微生物之间提供“景观相互作用值”,该值基本上表征了每种微生物对另一种微生物的丰度和微生物组结果的影响程度,从而直接预测微生物的组装方式及相互作用,克服了评估各微生物物种间相互作用所需的指数级实验数据无法建模的障碍(www.e993.com)2024年11月29日。该模型未来或可用于帮助预测患者与其他病原体是否存在共建风险,有助于...
科研丨北大&清华: 养分供应控制海洋细菌群落中物种丰度与生态相互...
2群落水平的rrn拷贝数如先前的研究所述,我们将群落水平rrn拷贝数计算为每个群落成员的丰度加权平均rrn拷贝数。全球沿海沉积物群落水平的rrn拷贝数平均为2.74±0.06,范围为1.59-7.61。使命湾(3.52±0.25)、杭州湾(3.18±0.17)和墨西哥湾(2.79±0.06)高于其他沉积物。全球海水中群落水平的rrn拷贝数在深海中高于表层海水...
一作解读丨内大: 堆肥过程中低丰度微生物类群驱动微生物共现性...
Shannon指数反映堆肥不同温度阶段的微生物alpha多样性,16SrRNA和18SrRNA获得的基因数量分别代表细菌和真菌群落丰度,基于Bury-Curtis距离估算堆肥不同温度阶段微生物群落beta多样性差异。细菌alpha和beta多样性都呈现出升高的趋势,由于堆肥初期营养物质充足,适宜的温度、水分等条件使细菌迅速生长繁殖(图3a和c)。相反,由于...
益生菌剂调整肠道疾病人群菌群结构丰度水平的研究
1.1多样性指数分析随着样品测序深度的增加,观测物种指数曲线趋于平缓,说明当前测序深度足以发现各样本生境中的大部分物种。此外,随着OTU等级的增加,曲线愈加平坦并且在横轴的跨度也越来越大,说明样品中物种的均匀度和相对丰度都达到了很高的水平。1.2益生菌剂干预下的肠道菌群多样性的变化...
颠覆常识!物种其实很难真正灭绝,但人类绝不能因此而无所作为
全球生物多样性最简单的描述指标是“物种丰度”,指地球现有物种的数量,目前估计数目在200万至1000万之间(不包括细菌和古生菌)。与丰度相伴的另一个指标是“灭绝率”,“我认为,全球灭绝率是生物多样性丧失的最基本测量指标。地球上的现存物种有多少?随着时间的推移有多少物种消失?”伦敦大学学院生物学家乔治娜...