Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这

在DGE分析中,用户只需要计算比对到转录本的reads数即可,故不需要对转录本片段的每个碱基都进行测序。例如,将“短”的50bp的单端测序与“长”的100bp的双端测序的DGE分析比较表明单端测序也可以获得一致的结果。这是因为单端测序足以确定大多数测序片段来源的基因。相同的研究还表明,短的单端测序会降低检测转录isofo...

新方法可索引和搜索拍碱基级核苷酸资源

研究人员通过创建八个数据库来说明Pebblescout的功能,这些数据库索引了超过3.7个拍碱基。Pebblescout的网络服务可通过httpspebblescout.ncbi.nlm.nih.gov访问。这些研究表明,对于各种查询长度,Pebblescout都能提供一种数据驱动的方法来查找大型核苷酸资源的相关子集,从而大大减少了下游分析的工作量。研究人员还表明,Pe...

仇子龙/程田林团队成功利用全脑单碱基编辑技术,改善孤独症小鼠...

图III:Mef2cL35P杂合小鼠表现出与孤独症相关的异常神经发育,突触密度降低,抑制性中间神经元数量下降及异常的电生理表型,且出现孤独症相关的行为学表型。图IV:基于CRISPR/Cas9系统开发的新型胞嘧啶单碱基编辑系统,通过体内及体外验证了其在目标靶点的碱基编辑效率以及脱靶事件,证明该系统是高效,准确且安全的。原文...

靶向DNA修复途径的肿瘤治疗

泛素化FANCD2-I为各种DNA内切酶招募支架蛋白,从而完成对交联处DNA的识别和核苷酸的切除,从而得到适合重组修复的DNA底物。O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶途径众所周知,DNA甲基化剂能够抑制DNA甲基化并产生广泛的DNA加合物,如O6-甲基鸟嘌呤(O6MeG)和O4-甲基胸腺嘧啶,这可能导致碱基错配和随后的点突变。其中,O6MeG被...

氨基酸行业专题报告:助益粮食安全,借力合成生物

过去数年，DNA合成技术在合成长度、合成通量等方面不断进步，目前寡核苷酸链合成通量可达到百万条级，合成成本降低约3个数量级。基因编辑技术方面，2012年开始科学家利用CRISPR/Cas可编程和精准切割等特点陆续发展了一系列基因组编辑工具，由于其方便、快捷、高效、成本低、难度小等特点，为动植物和微...

2023年世界科技进展100项|粒子|科学|量子|光子|光量子|原子_网易...

美国生物科技公司宣布成功从头合成出世界上最长的DNA寡核苷酸,该序列长达1005个碱基,编码了可用于基因治疗的AAV载体的一部分(www.e993.com)2024年11月12日。Ansa采用酶法DNA合成技术,技术由与单个脱氧核糖核苷三磷酸(dNTP)分子连接的独立于模板的末端脱氧核苷酸转移酶(TdT)实现。TdT-dNTP偶联物允许快速可控地将单核苷酸添加到延伸的DNA分子中。这种方...

人造合成DNA,离现实又近了一步

碱基:自然&人工1953年,沃森(JamesWatson)和克里克(FrancisCrick)揭示了DNA分子的双螺旋结构。在DNA分子中,每条长链都由核苷酸构成,每个核苷酸都具有三个组成部分,第一部分是脱氧核糖,第二部分则是由磷酸盐构成的,第三部是核苷酸碱基——也是我们今天要谈论的重点。

新型降脂药物“崭露头角”:六大治疗靶点,十余种降脂药物,一文打尽!

Volanesorsen是第一种获批的靶向apoCIII的药物,可用于家族性乳糜微粒血症综合征的治疗。Volanesorsen是一种反义核苷酸药物,能够干扰mRNA到蛋白质的翻译,抑制ApoC-III的产生,调节甘油三酯水平(图2)。目前,三项III期试验已评估了volanesorsen降低甘油三酯的疗效。APPROACH随机试验显示,每1-2周用一次volanesorsen,即可使...

科创前沿 | 基因工程更加精准编辑生物体

近日,基因组所绘制端粒到端粒无间断的小立碗藓参考基因组,对新版参考基因组进行从头注释,证明了小立碗藓的染色体数目为26条,经过评估单碱基正确率高达99.9989%。该研究为以小立碗藓为底盘异源合成紫杉醇等重要天然产物奠定遗传学基础。不久前,基因组所绿色轻简超级稻遗传解析与分子育种创新团队鉴定得到小麦赤霉病致...

补齐近2亿碱基的遗传信息,迄今为止最完整的人类基因组测序结果...

该基因组包含22条常染色体和X染色体的无缝组装,共含有30.55亿对碱基。比之前的人类模版基因组(GRCh38)增加了近2亿碱基的遗传信息,约等于整个基因组的8%的序列信息。该增加的碱基数目近乎相当于一条人类染色体能够包含的遗传信息,其中大部分序列是重复序列或复杂区域的序列。