诺贝尔化学奖:人工智能终结了蛋白质研究吗?| 追问观察
计算生物学家与实验学家不同,他们编写计算机算法,试图证明Anfinsen的假设,即他们可以向一个程序输入一串氨基酸,从而生成正确的蛋白质结构。??JohnMoult与人共同创立了“结构预测关键评估”(CASP)实验,迫使他自己和其他计算生物学家根据实验确定的蛋白质结构,来测试他们的蛋白质计算机模型。图源:UmitGulsen/Quan...
2024年诺贝尔化学奖官方解读:他们通过计算和AI揭示 “蛋白质奥秘”
研究小组绘制了一种具有全新结构的蛋白质,然后让Rosetta计算哪种氨基酸序列可以生成所需的蛋白质。为此,Rosetta搜索了所有已知蛋白质结构的数据库,并寻找与所需结构相似的蛋白质短片段。利用蛋白质能量分布的基础知识,Rosetta对这些片段进行了优化,并提出了氨基酸序列。为了研究软件的成功程度,Baker的研究小组将建...
为何诺贝尔化学奖又颁给AI?万字专题详解:计算和人工智能颠覆我们...
之后,江珀在美国生物化学研究公司D.E.ShawResearch担任了3年科学助理,利用计算机模拟进行分子动力学研究,并开发了一种从这些模拟中提取关键数据的算法。2017年,江珀在美国芝加哥大学取得理论化学博士学位,利用机器学习模拟蛋白质折叠和动力学研究。之后,他又在芝加哥大学完成了博士后研究,继续从事蛋白质预测深度...
2024年诺贝尔化学奖再颁AI,到底是诺奖“水”了还是AI“杀死”了...
2003年,贝克又成功利用这些基石设计出一种与其他蛋白质不同的新蛋白质Top7。此后,他的研究小组不断创造出一个又一个富有想象力的蛋白质,包括可用作药物、疫苗、纳米材料和微型传感器的蛋白质技术,其开发的蛋白质Top7几乎与他们设计的结构完全一致。如今,贝克在华盛顿大学任职教授职位。与此同时,AI技术也被认为...
天文学家利用人工智能揭示宇宙的真实形状
在对超级计算机模拟产生的大型模拟数据进行了大量训练和测试之后,日本天文学家将这种新工具应用于日本斯巴鲁望远镜的实际数据中,并发现使用这种方法得到的宇宙质量分布与目前公认的宇宙模型是一致的。这有望成为一种新型的强大工具,用于分析天文观测大数据。广域观测数据可以通过测量引力透镜模式来研究宇宙的大尺度结构。在...
特斯拉研究报告:如何理解特斯拉的当下与未来?
虽历史上Dojo量产进度出现明显延迟,但在技术维度上,Dojo集中展现了特斯拉在AI领域的多种技术探索:(1)提效:Dojo最初设想的目标是解决海量驾驶视频数据的模型训练(www.e993.com)2024年10月17日。早期特斯拉部署了基于英伟达GPU的用于云端计算的超级计算机,但随视频数据指数级增长,其GPU数量从早期的1500个倍数增长到1万个+,...
诺奖之后的复杂科学:18位学者勾勒未来20年复杂系统研究图景
我们可能不愿意谈论的一个方面是:许多复杂性研究是由世界各地应用数学和计算部门的物理学家完成的。也许2021年的诺贝尔奖将扩大此类话题在物理学界中的作用?复杂性的预测许多结果表明复杂系统可以很容易地用通用计算机模拟仿真。不过,许多研究人员认为相变点极难建模计算。我认为成功源于不试图解决看起来不可能解决的...
周报| 中国实现量子计算核心高密度连接模块国产化;美国众议院...
光子盒研究院中国实现量子计算核心高密度连接模块国产化5月16日,媒体报道中国自主研发的量子计算机“本源悟空”核心部件实现了国产化,打破了外资垄断,进一步巩固了中国在全球量子计算研发领域的领先地位。本源悟空是今年1月推出的第三代超导量子计算机。它基于中国第一条量子芯片生产线、第一条量子计算机操作系统和第一...
不只是 AlphaFold!一文读懂蛋白质折叠的前世今生
他破解了几种蛋白质的结构,包括一种能破坏青霉素的细菌酶——β-内酰胺酶,并于1970年在牛津大学获得分子生物物理学博士学位。但在开始博士后研究时,他厌倦了实验主义者的方法,开始转向不断发展的蛋白质计算领域。与实验主义者不同,计算生物学家编写计算机算法,试图证明Anfinsen是正确的:他们可以向一个程序输入...
不只是 AlphaFold,一文读懂蛋白质折叠的前世今生:从“不可能”到...
Anfinsen假设,应该有一种方法可以根据氨基酸序列预测蛋白质的形状。这就是后来广为人知的蛋白质折叠问题。一旦多肽链组装完成,蛋白质就可以在千分之一秒内折叠成自己的结构——这让分子生物学家CyrusLevinthal感到困惑。在他于1969年发表的论文HowtoFoldGraciously中,他计算出,如果一个蛋白质要尝试每一种...