NC|进化信息机器学习增强了预测基因与表型关系的能力

在表型分析中,将NUE量化为将供应的氮转化为生物量/谷物产量的效率。对于拟南芥,NUE的计算方法为每株植物将供能氮素转化为茎部生物量的效率(NUE=地上干重/施氮量),拟南芥NUE变异系数(CV=0.58)(图2a)。性状相关性分析表明,抽薹前NUE与NUpE高度相关(r=0.88),与NUtE相关性较低(r=0.39)(图2b),在拟南...

易科泰植物表型成像技术在植保领域的应用

研究团队通过高光谱成像、叶绿素荧光成像和高通量表型平台等技术,收集了小麦穗在赤霉病从无症状到有赤霉病症状期间的数据。并使用Boruta方法筛选出对疾病敏感的特征,并通过方差膨胀因子分析和ML-SFFS算法对这些特征进行融合,开发出一种识别小麦赤霉病和评估病情严重程度的方法。研究发现,生化参数、光谱反射、叶绿素荧光...

Science丨跨脑半球如何介导负性情绪产生?复旦大学刘星、马兰团队...

方差分析显示两组神经元之间的基因表达存在显著差异:与同侧NAc投射BLA神经元相比,对侧NAc投射BLA神经元中有2107个基因的表达水平较高,有2336个基因的表达水平较低。KEGG对差异表达基因的注释显示与几种通路相关的基因表达显著增加,特别是对侧NAc投射BLA神经元中的催产素信号通路、同侧NAc...

...多组学数据库的无创可视化新方法,揭示乳腺癌肿瘤内异质性表型...

计算的中位绝对偏差(MAD)以评估样本间影像学特征的差异,MAD>1的特征被视为高度可变。在发现队列(FUSCC队列)中,选择了203个高度可变与异质性相关的特征,其中包括40个一阶特征和163个纹理特征。一阶特征和纹理特征分别用于相似性网络融合(SNF)以生成两种不同的表型(图3A)。同样的标准和流程被应用于验证队列,以确定...

结直肠癌类器官平台:揭示Atg16l1在肿瘤生长与免疫中的双重角色

P值由prop.testR函数中实现的两配对皮尔逊卡方检验计算得出。f.使用MSigDBHallmark基因集对每个簇中的Atg16l1KO与WT进行对比的GSEA分析。仅显示至少四个对比中有显著结果的基因集(clusterProfiler,通过排列测试获得P值,FDR校正后P值<0.05)(MF巨噬细胞,MONO单核细胞,DC树突状细胞,pDC浆细胞样树突状细胞,NEUT...

第二届光谱技术及应用大会日程安排公布

导读:为进一步推动光谱技术的应用与融合,探讨我国光谱技术的发展趋势和远景目标,促进光谱技术和仪器的进步与创新,中国光学工程学会将于2024年5月在大连举办“第二届光谱技术及应用大会”(www.e993.com)2024年11月20日。第二届光谱技术及应用大会2024年5月9-11日大连凯宾斯基饭店光谱技术是近代光学计量的重要分支,通过对物质光谱的探测、分析来获...

“青春痘”疫苗来了?!Nature:突破痤疮预防难关,可以从这个基因...

条形表示中位数。数据来自两个(a,b,f,i-k)或三个(c-e)独立实验,每个数据点代表一个鼠标。h中的数据表示为一个独立实验的三个重复的平均值±SD,该实验重复三次。a-e采用非参数双尾Mann-WhitneyU检验,f、i-k采用非参数Kruskal-Wallis单因素方差分析。源数据以源数据文件的形式提供。

BBI:功能失调的肠道菌群激活小胶质细胞会损害海马神经发生

Iba1+小胶质细胞呈红色,CD68+呈绿色,细胞核用DAPI染色(蓝色)。比例尺,50μm。(F-H)定量DG中Iba1+细胞面积、阿米巴样小胶质细胞的比例和CD68染色面积。(I)LPS给药后Ctrl-FMT和CUMS-FMT小鼠海马中IL-1β的水平(n=4)。数据显示为均值±SEM。使用双因素方差分析和Tukey多重比较检验,*P...

北航李春燕团队全面总结组学技术在增强子研究中的应用

不同组学数据之间的准确性差异、缺失值、模型性能的评价标准、模型可解释性、计算和储存成本。1)来自不同来源的多组学数据信噪比和准确性存在差异。增加样本数量和改进实验设计可以提高不同组学分析的统计能力。然而根据MultiPower软件的统计,DNA-seq和ChIP-seq需要接近RNA-seq样本量的两倍以上才能达到相同的统计效果。

如何让自己在“输”的时候仍然获益?|宇宙|押注|巴菲特|期望值...

该概率权按照期望值计算价值40万美元(假设胜率是80%)。2、赌场开价15万买主角手中的“概率权”,应该只是一个套利行为。肯定是有另外的买家愿意出价20万,所以赌场当了二道贩子。当然,这些开价是以赔率差的形式出现的。例如赌场给主角的15万开价,相当于是300比1的赔率,但一定有买家愿意以更高的赔率(例如...