...探秘系列2--免费序列优化,提升载体构建成功率 解锁高效基因表达
密码子适应指数CAI是指异源mRNA序列中密码子和宿主细胞最佳密码子使用频率相符合的程度,理论上此值越接近1,外源mRNA在宿主细胞中的蛋白表达越高,通常CAI<0.8时,被认为需要进行密码子优化。使用宿主细胞中使用频率高的同义密码子替换外源mRNA序列中的密码子,例如,在大肠杆菌中,某些密码子如TAA和TAG可能很少使用,而GCA(...
2024重组胶原蛋白行业白皮书:从美业革新先锋到精准医疗动力源
他们从人体胶原蛋白基因组中截取了I型胶原蛋白的有效片段(COL1A1部分,截取I型胶原蛋白498-788基因序列),并将其与纤连蛋白(Fn)的氨基酸序列片段融合。这种融合技术不仅充分发挥了两者的优势表达效果,同时还确保了胶原蛋白的生物活性,显著提升了其在皮肤中的渗透性和稳定性。随着后续的公司研发升级,已经把I型胶原蛋白...
生物计算:超越图灵模型的细胞计算机
[50](这里是用AlphaFold生成蛋白质结构httpsalphafold.ebi.ac.uk))另一个值得注意的例子是推开-推关开关,如图2B所示,也在大肠杆菌细胞中实现。[34]这种状态机只需要一个输入信号就能在不同状态之间转换,尽管通过添加额外的控制信号增加了实现的复杂性。因此,细胞对一个外部刺激做出了开关响应。更具冒险精神...
中科院深圳先进院傅雄飞团队开发基于蛋白质分配约束的动态流平衡...
他们以番茄红素(lycopene)为例,模拟预测了在大肠杆菌中外源诱导表达番茄红素合成基因后细胞生长动力学的变化。该成果为设计实时调节关键酶表达的遗传回路以及提高代谢产物产量提供了重要的模型工具。该研究揭示了微生物如何精巧地调控其内部代谢网络和蛋白质合成这一耦合系统,以适应不断变化的环境条件。研究中开发的dCAF...
...biotechnology】大语言模型生成跨不同家族的功能性蛋白质序列
在100个人工蛋白中,L056(maxID为69.6%)和L070(maxID为89.2%)两种蛋白对大肠杆菌BL21菌株在16℃过夜诱导时表达良好,并具有杀菌活性。通过测量纯化的表观低分子量物种的KM值,其中L056和L070都具有高活性,并且具有与HEWL相当的Michaelis-Menten参数(图3d)。总的来说,L056和L070具有与HEWL相当的催化活性和杀菌能力...
QB期刊 | 天津大学宋浩教授团队综述基于导电蛋白质的电活性微生物...
图1.细胞电子生成和电子传递的动力学计算细胞色素的结构、功能、导电机制及过表达导电色素蛋白是电活性微生物进行胞外电子传递的关键成分(www.e993.com)2024年10月16日。这些细胞色素从内膜开始,跨越周质和外膜,延伸到细胞外环境形成了一条特殊的电子传递途径。在这里,我们首先根据细胞色素在细胞膜上的位置和电子传递途径将其分为三种类型:细胞膜内...
生物计算:超越图灵模型的细胞计算机 | 智能渐近线
在这一背景下,一个值得注意的例子是将这样一个酶催化装置概念化为能够执行逻辑可逆函数的计算系统[10],这一方法最近已经经历了实验分析。[50](这里是用AlphaFold生成蛋白质结构httpsalphafold.ebi.ac.uk))另一个值得注意的例子是推开-推关开关,如图2B所示,也在大肠杆菌细胞中实现。[34]这种状态机只需要一...
《食品科学》:南京师范大学江芸教授等:肉源大肠杆菌与假单胞菌...
4大肠杆菌和假单胞菌混合被膜形成过程中EPS的变化EPS蛋白含量如图4所示,与72h相比,168h单菌生物被膜、混合生物被膜中L-EPS、B-EPS、T-EPS的蛋白含量均显著增加(P<0.05),表明随着成膜时间延长3种EPS的蛋白质分泌增多。混合生物被膜中3种EPS的蛋白含量并非都高于两种单菌生物被膜,但均显著低于两单...
胶原蛋白纯化工艺开发及优化
大肠杆菌重组胶原蛋白两步层析纯化第一步层析纯化参数层析填料TA-NiFF(NTA)平衡缓冲液20mMTris-HCl,200mMNaClpH=7.5洗脱缓冲液20mMTris-HCl,200mMNaCl500mM咪唑pH=7.5清洗缓冲液0.5MNaOH图3:重组胶原蛋白TA-NiFF(NTA)纯化曲线...
亲和层析填料的种类及其应用
3.MBP-tag亲和层析介质麦芽糖结合蛋白(MBP)有42.5KD大小,不含半胱氨酸(Cys),作为融合蛋白的标签,通常放在N端在大肠杆菌中进行表达。MBP能促进融合蛋白的可溶性表达[9],尤其对于难表达的真核细胞蛋白,膜蛋白病毒蛋白有很好的促溶表达能力,MBP融合蛋白的纯化在生理条件下进行,使用麦芽糖进行温和...