Nat Method | 张数一团队提出蛋白质序列-功能空间压缩的概念

总之,受限于蛋白质序列空间的高维度与复杂性(例如,100个氨基酸的蛋白质设计空间达到10130,远超宇宙中的原子数目~1080),我们对这个空间及其映射规律的理解尚浅,亟待丰富与完善。2024年11月11日,来自清华大学的张数一团队在NatureMethods上发表了名为EvoAIenablesextremecompressionandreconstructionofthep...

诺奖得主大卫·贝克:AI设计蛋白质承诺解决人类社会新问题

蛋白质由20种简单的氨基酸经过排列组合拼接而成,一条氨基酸序列包含它能形成蛋白质的所有结构和活性信息。一条氨基酸序列可以自发折叠成唯一的三维结构,然后在细胞内发挥特定的功能——有的可以结合DNA,控制基因的开关;有的可以识别病原体,启动免疫反应。当地时间2024年10月9日,美国华盛顿特区,美国生物化学家、2024年...

诺贝尔化学奖揭晓!国际象棋AI大师破解了蛋白质的密码

答案是蛋白质的存在,蛋白质可以说是一种出色的化学工具。它们通常由20种氨基酸组成,可以以无数种方式组合。利用DNA中存储的信息作为蓝图,氨基酸在我们的细胞中连接在一起形成长链。然后,蛋白质的神奇之处就出现了:氨基酸链扭曲并折叠成独特的(有时是独一无二的)三维结构。正是这种结构赋予蛋白质功能。一些蛋白质...

基因突变影响蛋白质稳定性有新解

GRB2-SH3是一种含有34个氨基酸的蛋白质,每种氨基酸都可以突变成19种不同的氨基酸。如果每个位置只允许一个变化,那么就可以产生170亿种不同的蛋白质组合。图片来源:威康桑格研究所人体蛋白质由20种不同的氨基酸组成。单个突变会将一种氨基酸替换为另一种,从而改变蛋白质的形状。这种变化可能是健康与疾病之间的分水...

【中国科技网】深度学习助力蛋白质序列从头设计

经过实验验证,ABACUS-R的设计成功率和设计精度超过了原有统计能量模型ABACUS。研究成果北京时间7月21日发表于《自然-计算科学》。刘海燕、陈泉团队长期致力于发展数据驱动的蛋白质设计方法,先后建立并实验验证了对给定主链结构设计氨基酸序列的统计能量函数ABACUS模型,以及利用神经网络能量函数从头设计主链结构的SCUBA模型...

基因突变影响蛋白质稳定性有新解—新闻—科学网

GRB2-SH3是一种含有34个氨基酸的蛋白质,每种氨基酸都可以突变成19种不同的氨基酸(www.e993.com)2024年11月15日。如果每个位置只允许一个变化,那么就可以产生170亿种不同的蛋白质组合。图片来源:威康桑格研究所特别声明:本文转载仅仅是出于传播信息的需要,并不意味着代表本网站观点或证实其内容的真实性;如其他媒体、网站或个人从本网站转载使用...

水产品肌肉组织中氨基酸含量检测

对虾肌肉组织以其高蛋白质含量而著称,这些蛋白质由多种氨基酸按特定序列组成。通过现代生物技术手段,如高效液相色谱法(HPLC)、氨基酸分析仪等精密仪器,科学家们能够精确测定对虾肌肉中各种氨基酸的具体含量。研究发现,对虾肌肉富含人体必需的多种氨基酸,如赖氨酸、色氨酸、缬氨酸等,这些氨基酸在人体内不能自行合成,必须从...

了解一下身体蛋白质的基本构件:氨基酸

氨基酸是蛋白质的组成部分,蛋白质是长链氨基酸。您的身体有数千种不同的蛋白质,每种蛋白质都有各自特别而重要的作用,所以每种蛋白质都有自己的氨基酸序列。类似于字母表中的字母,当你以不同的方式组合字母时,你会组成不同的单词。氨基酸也一样。

对人体有益的蛋白质也分“三六九等”?

蛋白质中的中等生——半完全蛋白,表现为必需氨基酸种类齐全,但有的数量不足,比例不适当。这类蛋白质说白了可以“保命”,但不能促进生长发育,如小麦中的麦胶蛋白。蛋白质中的差等生——不完全蛋白,表现为所含必需氨基酸种类不全,光靠不完全蛋白作为膳食蛋白质来源时,既不能维持生命,也不能促进生长发育,妥妥的...

氨基酸深度研究:助益粮食安全,借力合成生物

氨基酸替代豆粕需求持续增长,转基因玉米推广或进一步推升氨基酸性价比粮食安全背景下,全球氨基酸(主要以玉米为原料)替代豆粕用于养殖需求持续增长,尤其我国大豆自给率低(进口依赖度常年高于80%),据博亚和讯,11-23年全球赖/苏/蛋氨酸需求CAGR达7%/12%/7%,未来伴随低蛋白日粮饲料技术持续推广,氨基酸需求仍有望快速增长...