阿斯利康基因组学研究中心基于近50万份组学样本发布疾病预测AI...
以67种数量性状(包括血液化学、尿液分析、肺量计、血压、体型、性别、年龄和禁食时间等指标)训练模型,在484,230份基因组测序样本以及46,327个蛋白质组学样本中进行全表型组关联分析验证(未来也可扩展到转录组和代谢组学数据上)。
谷歌DeepMind再放大招!AlphaProteo直接设计全新结合蛋白,加速药物...
2、结构生物学预测:通过对结构生物学数据进行深度学习,可以预测蛋白质结构、功能和互动。3、生物信息学数据集预处理:通过对生物信息学数据集进行深度学习,可以提高数据质量、减少噪声和缺失值,从而提高预测模型的准确性。八大最火课程01、深度学习蛋白质设计02、CADD计算机辅助药物设计03、AIDD人工智能药物发现与...
Nature Medicine | 利用血浆蛋白质组学提升疾病早期诊断:从多发性...
样本和数据收集:研究从UKBiobank的随机子集中选择了41,931名参与者,收集了他们的EDTA血浆样本并进行了蛋白质组学分析。数据分析流程:研究采用了LASSO回归和正则化Cox模型,通过200次子样本化选择特征,并最终建立了稀疏预测模型。模型的性能通过1,000次自助法进行估计。性能比较:研究将包含5至20种蛋白质的模型与仅...
...腾讯AI Lab姚建华、杨帆:腾讯 AI Lab 为何瞄准单细胞蛋白质组学?
论文一中建立的SPDB数据库,通过标准化处理不同来源的单细胞蛋白质组学数据,使得数据易于比较和分析,是目前全球数据量最大、覆盖技术和数据集最为广泛的单细胞蛋白质数据库。论文二中的scPROTEIN框架,针对单细胞蛋白组数据的特殊性提出了解决方案,能够处理数据中的不确定性、缺失值、批次效应和噪声问题。为基...
临床样本+代谢组学2区案例!河南中医大揭示中药治疗慢性阻塞性肺...
在常规药物治疗的基础上,用中药(清热化痰或燥湿化痰颗粒)治疗7天;在治疗前后收集临床症状和体征评分、改良版英国医学研究委员会(mMRC)呼吸问卷得分、COPD评估测试(CAT)和炎症指标的数据,包括白细胞(WBC)计数、中性粒细胞计数百分比(NEU%)和C反应蛋白(CRP),以评估治疗效果;在治疗前后收集血清样本进行代谢组学分析,以...
专访姚建华、杨帆:腾讯 AI Lab 为何瞄准单细胞蛋白质组学
对于临床医学专家而言,他们可以利用我们的反卷积算法分析公开的TCGA或CPTAC等蛋白质组数据库,或者基于自己收集的临床组织样本,以深入理解肿瘤微环境,辅助疾病机制的研究和诊断预测(www.e993.com)2024年10月17日。此外,我们的数据库允许生物学家和医学工作者在线探索他们感兴趣的蛋白质或细胞类型,观察这些蛋白质在不同细胞类型中的变化规律,从而支持他...
Seer 公司 Max Mahoney:高深度无偏蛋白质组学新技术,开启肿瘤早筛...
MAX:首先,无论是对于单一样本还是组群样本,5,000这个数字都是一个巨大的成就。但这还只是刚刚起步。Seer平台潜力无限。通过Seer与应脉的合作,无偏发现蛋白质组学领域的样本数量将持续提升。也许几年之后再回看现在,5,000都显得微不足道。通过赋能以Seer为代表的核心技术,结合后端的质谱检测设备,样本数量会持续增长...
Cell重磅:章冰/高强团队等利用泛癌蛋白基因组学分析,绘制癌症治疗...
1、靶向蛋白的系统分类和定量研究团队系统收集了2863个潜在的小分子靶点蛋白和膜蛋白,并将其分类为五个等级,以便于患者选择、药物再利用和新疗法开发等不同应用。在CPTAC蛋白质组学数据中,超过80%的这些蛋白得到了量化。其中超过半数的蛋白在一种或多种癌症类型中显示出较差的mRNA-蛋白质相关性,揭示了用蛋白质组...
Cell | 突破癌症治疗瓶颈:跨癌种蛋白基因组学揭示新靶点
数据收集和处理:研究首先整合了来自CPTAC的蛋白基因组学数据,这些数据涵盖了10种癌症类型的1043个肿瘤样本和524个正常组织样本。数据整合还包括来自GTEx、TCGA、DepMap等公共资源的数据,这些数据提供了广泛的基因组和蛋白质组信息。蛋白质表达和活性分析:研究通过质谱(massspectrometry,MS)数据,识别出在肿瘤中过表达或...
Cell:中国科学家绘制小细胞肺癌蛋白基因组学图谱揭示其分子特征并...
“ProteogenomicCharacterizationofSmallCellLungCancerIdentifiesBiologicalInsightsandSubtype-SpecificTherapeuticStrategies”的最新成果,在国际上首次大规模对小细胞肺癌临床队列开展蛋白质组和磷酸化蛋白质组表征,全面绘制了小细胞肺癌蛋白基因组学图谱,系统揭示了小细胞肺癌的分子特征,提出新的分子分型及其...