最新热点:使用铜死亡相关基因进行肿瘤预后分型!
其他9个基因(FDX1、LIPT1、LIAS、DLD、DLAT、PDHA1、PDHB、MTF1和GLS)的高表达与ccRCC中更高的存活率显著相关,显示出肿瘤抑制因子的特征。然后,作者构建了ccRCC患者中OS和PFS的铜死亡预后特征。对于ccRCC患者的OS结果,选择三个基因使用它们的回归系数构建预后评分:Scoreos=-0.44×FDX1-0.28×DLAT+0....
8+!利用铜死亡相关特征来预测皮肤黑色素瘤的预后和药物敏感性~
接下来,本研究分析了来自CM患者的10个CRG的体细胞突变和CNV模式(图1B),在467个CM样本中的162个(34.69%)的CRG中发现了体细胞突变或CNV;这些主要是由染色体缺失变异引起的。图1此外,本研究通过使用GeneMANIA网站进行的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析,发现PDHB、DLAT、PDHA1...
王雅杰教授:感染性疾病与肿瘤致病机制及生物标志物研究前沿
结果发现,在肝癌组织中ATP7A、SLC25A3、SCO2、COA6、TMEM199、ATP6AP1、LIPT1、DLAT、PDHA1、MTF1、ACP1、FDX2、NUBP2、CIAPIN1、ISCA2和NDOR1表达升高,AOC1、FDX1、MT-CO1和ACO1表达下降,与HCC生存率低下显著相关。筛选出的铜死亡相关基因表达与临床特征显著相关。GSEA分析发现,许多关键信号通路如NK细胞介...
iMeta|湘雅医院刘庆组-泛癌分析揭示铜死亡调节子的临床和分子特征
其中,有7个铜死亡调节子参与了铜死亡的正向调控,即铁氧还蛋白1(FDX1),硫辛酸合成酶(LIAS),脂质转移酶1(LIPT1),二氢脂酰胺脱氢酶(DLD),二氢硫辛酰胺S-乙酰转移酶(DLAT),丙酮酸脱氢酶E1亚基α1(PDHA1),以及丙酮酸脱氢酶E1亚基β(PDHB)。同时,其中三个被发现参与了铜死亡的负向调节,即金属调节转录因子...
...神经节瘤|PPGL|儿茶酚胺|肾上腺素|转移性|腹部|肿瘤|基因|症状...
这些基因包括VHL,EPAS1/HIF2-α,PDH1/EGLN2和PDH2/EGLN1。这些基因中的体细胞和种系变异也激活了HIF,但不会像TCA周期基因变异那样影响表观遗传机制。因此,TCA循环非异常聚集性聚类1PPGL的转移电位通常低于同一群集中TCA循环异常病例的转移电位,但EPAS1除外[90]。簇2PPGL主要由调控激酶驱动途径的基因...