田长麟教授研究组与合作者提出离子通道动态双构象转换的离子选择...
田长麟课题组以非选择性通道NaK为研究对象,将其重组装到磷脂双分子膜内(还原离子通道所存在的细胞膜环境),并与AdamLange组合作,通过魔角旋转固体核磁方法获得高分辨固体NMR谱图,并获得了不同金属阳离子条件下谱峰归属。NMR谱图数据表明,NaK在生理环境下通道存在两种构象,钾离子选择结合其中一种,而钠离子选择另一种。
访菲鹏数辉马步勇|AI与分子模拟引领创新,“构象选择机制”开辟...
近日,在上海举行的AIBC大会上,菲鹏数辉首度亮相AI蛋白质动态构象预测新品——DeepConformer,引来现场热议,菲鹏数辉创始人兼首席科学家马步勇教授也做了关于AI蛋白质动态构象预测这一前沿课题的主题演讲。后续的演讲者,也在分享中引用到马步勇教授的一些研究发现和思考。此次有幸邀约到马步勇教授接受专访,近距离聆听智...
AI药物设计新突破 | 菲鹏数辉发布AI蛋白质动态构象模型Deep...
以动态构象为核心的AI蛋白质工程平台,创新地将AI蛋白质动态构象预测与分子模拟结合形成互补的双引擎模式,通过更精准的算法和模型,解决单一依靠分子模拟“准,不够快”的问题,同时充分发挥AI蛋白质动态构象快、又能探索到分子模拟难以探索到的构象空间的优势,突破性实现AI辅助蛋白质预测“又快又准”的技术目标。AI抗体...
哈工大潘钦敏教授CEJ:丁二腈构象翻转实现长寿命固态锂电池
但是丁二腈本身是存在两个氰基的,如果只络合一端,那么裸露的氰基会继续腐蚀锂负极,所以锚定丁二腈,丁二腈的构象问题是不可以被忽视的。鉴于此,哈尔滨工业大学潘钦敏教授通过在丁二腈基电解质中引入聚(2-丙烯酰胺基-2-甲基丙磺酸锂)(PAMPSLi)分子刷来实现丁二腈的构象反转来稳定阳极/电解质界面。PAMPSLi刷通...
数据变为声音,聆听氢键“奏鸣”,科学家揭示蛋白质折叠构象过程
据发表在20日《美国国家科学院院刊》上的一项最新研究,美国科学家通过将数据转换为声音,揭示了氢键是如何在极短时间内促成蛋白质构象,并将氨基酸转化为功能性折叠蛋白质的过程,为研究蛋白质从未折叠状态到折叠状态时发生的氢键事件序列提供了独特视角。为更好了解蛋白质折叠是如何进行的,科学家必须首先确定一串氨基酸...
研究揭示人类内在无序蛋白质组的构象组合
丹麦哥本哈根大学KrestenLindorff-Larsen等研究人员合作揭示人类内在无序蛋白质组的构象组合(www.e993.com)2024年10月17日。2024年1月31日,《自然》杂志在线发表了这项成果。研究人员表示,内在无序蛋白质和区域(统称为“IDR”)普遍存在于各生命界的蛋白质组中,有助于形成生物功能,并与多种疾病有关。IDR具有多种瞬时形成的结构,并打破了传统的...
Nature:新研究揭示HIV-1包膜蛋白异源三聚体与CD4结合时的中间构象
Dam说,“从结构上描述位于中间状态的HIV包膜蛋白构象对于从根本上了解HIV蛋白的工作原理非常有价值。”但对这些结构进行成像是一项挑战:由于生化原因,在试管中制造“异源三聚体”或只与一个或两个CD4受体结合的包膜蛋白并不容易。通过一种创新的工程方法,这些作者设计出了一种构建稳定异源三聚体的方案。然后,他们...
科学家解析了与CD4结合的HIV-1Env异源三聚体的中间构象
据介绍,HIV-1包膜(Env)对宿主受体(CD4)的结合表现出明显的构象变化。Env是gp120和gp41异二聚体的三聚体,其结构特征为封闭的预融合构象,与紧密相关的gp120和被V1V2环隐藏的gp120V3上的共感受器结合位点,以及完全饱和的CD4结合的开放Env构象,其变化包括向外旋转的gp120和移位的V1V2环。
...侧基间光二聚实现温敏树枝化聚苯乙炔螺旋构象的高度稳定
动态螺旋聚合物由于较低的构象势垒,主链螺旋构象可被外界刺激所操纵,然而稳定的手性对于实现螺旋聚合物手性功能与应用至关重要。精准调控并稳定螺旋构象一直是螺旋聚合物领域的重大挑战之一。图1树枝化螺旋聚苯乙炔通过相邻侧基间分子内光环加成稳定螺旋构象近期,上海大
文心生物计算大模型重磅升级,构象预测准确度全面提升!
文心生物计算大模型家族又迎来了重磅的升级:蛋白质-小分子对接构象预测模型HelixDock,以及蛋白-蛋白复合物结构预测模型HelixFold-Multimer准确度全面提升。这两项新技术可以大幅提升蛋白质-小分子的对接构象及蛋白-蛋白复合物结构预测的精度,为基于结构的药物设计奠定了扎实的基础。蛋白质-小分子对接构象预测模型Helix...