...Sci | 北京大学现代农业研究院宋宝兴课题组发表植物基因组序列...
通常使用两个基因组共有的k-mer或者保守的序列片段作为锚点或者节点构建图模型,使用动态规划算法计算图模型的最优路径。这些方法在长indel比对方面表现良好,并且具有较高的灵敏度。得益于最新全局序列比对算法计算效率的提升,minimap2和AnchorWave采用了该策略。多基因组比对许多进化分析是基于多个物种样本进行的。多序...
在细胞培养的过程中,出现支原体污染怎么办?
根据支原体基因组内的保守序列设计特异引物,对待检样品的核酸进行扩增,通过对扩增产物的大小分析作出诊断。PCR检测技术用于支原体污染的检测,周期短、灵敏度高、特异性好、操作简单且一次可检测大量样品。04酶联免疫吸附试验(ELISA)ELISA用于支原体污染的检测中,有着良好的特异性和敏感性,一次可以完成大量样品的检测。
siRNA筛选技术精准打击HIV耐药毒株,开辟治疗新途径
1.高效siRNA的潜力:siRNA治疗策略在抑制耐药性病毒发展方面展现出巨大潜力。2.保守序列的识别:研究成功识别了HIV-1病毒vpr基因中的保守序列。3.综合性筛选策略:通过综合性策略设计并筛选了多种针对HIV的siRNA。4.分子对接模拟技术:在精准找出最具疗效的siRNA方面发挥了关键作用。研究团队提出了一个全新的s...
Nature子刊:何川团队开发超快速精准检测微量DNA与RNA中5-甲基胞...
研究人员用UBS-seq对HeLa和HEK293T的mRNA进行了测序,发现了近两千多具有保守序列模式的位点(图2d)。随着NSUN2基因敲除,绝大多数m5C位点的修饰比例下降(图2e)。当把NSUN2的基因再转入敲除的细胞后,m5C位点的修饰比例又回升了(图2f)。这些结果证明了m5CUBS-seq方法不仅非常灵敏高效,而且非常准确。为研究m5C的生...
科学家在人类身上发现155个新基因,都是“从0出现”
根据长期对比观察微蛋白,科学家们找到了一些sORF序列,这些序列具有高度保守性,被称为高度保守序列(highlyconserved)。高度保守序列,指在不同类型生物体中非常相似的DNA序列。研究认为这些跨物种的相似性,可以证明某个基因完成了不同生物中的共同基本功能,因此在进化过程中保留了这些序列。
基因突变不是随机的?!Nature最新论文挑战进化论
有不少评论也提出了相似的观点,认为论文所说的的突变率更低的基因组区域,或许本来就是保守的,不易变异的区域(www.e993.com)2024年9月17日。比如说保守序列(ConservedSequences)就是一种在进化过程中保留下来的特定序列,不易变异,一般可以上推到物种进化初期。而由于作者自己提出:我们的发现似乎与现有的“最早的突变随机”的理论相悖,有人还...
我折腾了半个月的基因编辑实验,师兄只用三步就轻松搞定了
(Fig1),在天然情况下其引导RNA分子有2个,一个是决定靶点序列特异性的crRNA,其5’端的20个碱基负责与基因组的目标位置结合,而其3’端的保守序列则与另一个CRISPRRNA分子tracrRNA进行结合,形成RNA复合体,这一复合体可以帮助Cas9核酸内切酶定位到基因组上的目标区域,产生双链断裂...
NAR | antiSMASH 7.0:新的和改进的检测、调节、化学结构和可视化...
传统上,新化合物是通过从天然来源中提取、化学分离、纯化和测试化合物的“查找和研磨”工作流程发现的。这种方法现在通常通过测序和随后的基因组和宏基因组数据挖掘来补充,以确定天然产物生物合成途径。用于“基因组挖掘”的软件工具,即在基因组中搜索二级/特殊代谢物(secondary/specialisedmetabolite,SM)生物合成基因...
中金:核酸药物,时代已至
mRNA-1273是全球首个进入临床试验的新冠疫苗之一,从公布基因序列到制成首批样品仅花了27天,其III期临床的最终分析数据显示对COVID-19的保护效力为94%,对重症COVID-19的保护效力为100%。BioNTech的mRNA疫苗BNT162b2是全球第一个公布III期临床结果的新冠疫苗,其最终分析数据显示对COVID-19的保护效力为95%,对65岁...
新冠病毒检测工具,除了核酸试剂盒还有什么?
该方法通过对病毒RNA进行提取、逆转录、PCR扩增病毒保守序列(RdRP基因(特异性靶点)、E蛋白基因、N蛋白基因以及一个鉴定保守基因S区位点;可以只检测RdRP基因或者选择RdRP基因和其他多个基因确认),扩增体系中的荧光蛋白会结合扩增出的双链DNA序列从而发出荧光,根据检测到的荧光值判断是否有病毒存在并定量。