想改造蛋白质?交给人工智能吧
洪亮介绍,在此过程中,模型完成了两轮筛选,一是在众多有可能的改造方案中选出符合自然规律的,类似于将筛选范围从“大海”缩小到了“水盆”;二是以热稳定性、活性、亲和力、衰减耐受性等功能为指标,对“水盆”里的方案进行蛋白质功能打分,进而根据功能需求将范围缩小到“水杯”。模型能发挥以上两大核心作用,要从数...
因为一个“很难,很重要的问题”,我从计算机转向研究蛋白质
最右边的蛋白(朊蛋白)跟疯牛病有关系,这里显示了朊蛋白两种不同构型,左边的构型是正常的折叠状态,右边的是不正常的折叠状态。如果朊蛋白的折叠是右边这个形状的话,就会引起疯牛病。所以,蛋白质结构是个非常重要的问题。蛋白质由很多氨基酸通过化学键串在一起。这里我用一些小球去表示这些氨基酸,每种颜色的小球表示...
他开创了AI蛋白质结构领域,现在要做比诺奖更大的事
第二,它很困难,这是个被清晰定义的问题——已知蛋白质的序列,也就是氨基酸在一维上的排列顺序,要预测出整个蛋白质里面每个原子的三维坐标。这个问题横亘六十年,进展始终不大,许锦波好奇,自己能不能把这个问题的边界,向前推进一点点。许锦波演讲《AI预测蛋白质结构,但这只是一个开始》丨我是科学家蛋白质是什么?
...颁给AI?万字专题详解:计算和人工智能颠覆我们对蛋白质的理解方式
蛋白质可以呈现无数形状结构,以匹配生命活动过程中无数的“工作需求”。“从原子到生态系统,(蛋白质结构)就像是一种通用语。”库雷希打比方道,“万物源自此处。”细胞让名为氨基酸的小分子像雏菊花环一样连起来形成多肽长链,制造出蛋白质。它所选择的氨基酸取决于DNA提供的一连串指令。在这个创造过程中,多肽链一瞬...
从实验室到餐桌,如何把科技成果变成受欢迎的产品?
我今天非常高兴能够以科学家或研究员的视角和大家探讨在“从实验室到餐桌”过程中可以做些什么。(二)制造商视角:解决成本问题是规模化生产的关键ChristopheF.Maire:下面一个问题我想问Tatjana,拥有创新成果的初创公司常常面临的一个关键挑战是如何确保这些成果能够大规模生产。对于设计新蛋白质或在从事精密发酵的...
诺贝尔化学奖颁给DeepMind,AI是如何终结蛋白质研究的?
??20世纪50年代,生物化学家ChristianAnfinsen进行的实验表明,氨基酸串内部含有一种内在的代码,指示它如何折叠成蛋白质——并且应该有一种方法可以从这一代码中预测蛋白质的结构(www.e993.com)2024年11月8日。这个假设被称为安芬森教条(Anfinsen’sdogma)。图源:PBHImages/Alamy早在20世纪30年代,科学家们就开始探究这个问题。但真正取得突破要...
诺贝尔化学奖:人工智能终结了蛋白质研究吗?_腾讯新闻
01谷歌DeepMind的AlphaFold2在2020年CASP竞赛中预测蛋白质结构,准确度高达90分以上,引发科学界关注。02然而,AlphaFold2在预测某些点突变和蛋白质与环境相互作用方面仍有局限,需要实验验证。03为此,研究人员正在开发更先进的算法,如AlphaFold3和RoseTTAFoldAll-Atom,以提高预测准确性。
百普赛斯:目前公司已将AI技术应用到蛋白质的改造过程中,通过协同...
目前公司已将AI技术应用到蛋白质的改造过程中,通过协同AI计算和模拟的“干实验”与高通量的“湿实验”,将AI技术与基于力场的计算机虚拟筛选方法结合,不断闭环迭代,从而最终得到具有特异性的蛋白质。比如全能核酸酶本质是一种蛋白质,为满足高盐环境对全能核酸酶的活性要求,公司协同AI模拟计算和高通量筛选,开发出在0-...
未来实验室丨食用蛋白、可降解生物塑料……这些都是合成生物制造的!
让微生物成为富含蛋白的原材料,科研人员首先要寻找到适合的微生物菌株。但天然的菌株生产蛋白的能力有限,要在实验室里对种子选手进行不断诱导、筛选和培育,这就仿佛是人工育种的过程,通过不断迭代,新的微生物菌株生产蛋白的能力被大大提升。通过发酵工艺,这些生产蛋白能力强的菌株,就被大批量生产出来,从而提取...
不打价格战,从上千健康品牌脱颖而出斩获行业金奖,安琪纽特是怎么...
从实验室到餐桌,酵母蛋白重塑蛋白营养新版图面对蛋白质摄入不足的现状,该如何通过饮食可以补充足够的蛋白质?中国营养学会曾发布过优质蛋白质十佳食物,列出了十种富含优质蛋白质的食物及其每100克中的蛋白质含量和氨基酸评分。表格中,鸡蛋以每100克含13.1克蛋白质和106分的氨基酸评分位居榜首,紧随其后的是牛奶(液态)...