AI因“破坏性创新”获诺贝尔化学奖:摧毁了冷冻电镜测定蛋白质结构...
在DNA、RNA基因的作用下,氨基酸经肽键形成肽链,并折叠成具有复杂三维结构的蛋白质。蛋白质折叠形成的独特的分子结构,决定了蛋白质的功能。搞明白了蛋白质的结构,就能搞明白蛋白质的功能,所以,蛋白质结构一直是生命科学、医学、制药的热门方向。传统的研究蛋白质结构的方法,需要通过繁杂的实验来完成。用X射线去照射蛋...
2024年诺贝尔化学奖揭晓!揭开蛋白质折叠的秘密
1912年,波兰化学家弗雷德里克·桑格(FrederickSanger)完成了第一个蛋白质的完整氨基酸序列测定,即胰岛素的B链,这标志着蛋白质序列分析的诞生。他于1958年被授予诺贝尔化学奖。20世纪50年代末,英国生物物理学家约翰·肯德鲁(JohnKendrew)和马克斯·佩鲁茨(MaxPerutz)成功地使用了一种称为X射线晶体学的方法,展示了蛋白质...
2024化学诺奖专家解读:颁给蛋白质预测和AI实至名归,化学家还不会...
组成蛋白质的基本单元氨基酸是由一个氨基、一个羧基、一个氢原子和一个侧链基团组成。不同氨基酸的区别在于它们的侧链基团不同,这影响了它们在蛋白质结构中的相互作用和功能。当两个氨基酸相遇时,其中一个的羧基结构会和另一个的氨基发生反应,形成肽键将它们连接在一起,如此形成多肽链。这便是蛋白质的“一级结构”...
诺贝尔化学奖:人工智能终结了蛋白质研究吗?| 追问观察
基于这一发现,Anfinsen提出了一个假设:应该有一种方法可以根据氨基酸序列预测蛋白质的结构——这就是后来广为人知的蛋白质折叠问题。一旦多肽链组装完成,它们就能在千分之一秒内折叠成正确的结构,速度之快令分子生物学家CyrusLevinthal咋舌。在1969年发表的论文《如何优雅地折叠》(HowtoFoldGraciously)中,Levintha...
GPT-4无师自通预测蛋白质结构登Nature子刊!LLM全面进军生物学...
α-螺旋是蛋白质中最常见且被广泛研究的二级结构。研究人员表示,虽然使用各种prompt进行了多次尝试,GPT-4和GPT-3.5都无法像模拟氨基酸一样准确地生成α-螺旋多肽链的结构。有趣的一点是,GPT-4习惯于用数学公式描述α-螺旋的空间结构参数:由于单独使用GPT-4效果不佳,实验人员尝试整合Wolfram插件,这是由Wolfram-Alp...
两项诺奖“花落AI” “AI辅助创新”将如何改变科学研究?
一切生命活动都离不开蛋白质(www.e993.com)2024年10月17日。蛋白质通常由20种天然氨基酸经肽键形成肽链,并折叠成三维形状。正是这种结构赋予了蛋白质特异的生物功能,使其成为生命的基本单元。武汉大学化学与分子科学学院教授付磊介绍,有些蛋白质可以构建肌肉,有些则可能成为激素或抗体,还有蛋白质会形成酶或在细胞表面充当其与其周围环境间的信号及...
??研究蛋白质热稳定性的几种方法
天然蛋白质的空间结构是通过氢键等次级键维持的,而变性后次级键被破坏,蛋白质分子就从原来有序的卷曲的紧密结构变为无序的松散的伸展状结构(但一级结构并未改变)。热变性是蛋白质变性中最常见的一类现象。蛋白质的热稳定性是指蛋白质多肽链在温度影响下的形变能力,主要体现在温度改变时多肽链独特的化学特性和...
专家解读诺贝尔化学奖,化学家还不会“失业”
以蛋白质为例。组成蛋白质的基本单元氨基酸是由一个氨基、一个羧基、一个氢原子和一个侧链基团组成。不同氨基酸的区别在于它们的侧链基团不同,这影响了它们在蛋白质结构中的相互作用和功能。当两个氨基酸相遇时,其中一个的羧基结构会和另一个的氨基发生反应,形成肽键将它们连接在一起,如此形成多肽链。这便是蛋白质...
小分子大作用,原生液体胶原肽是抗衰黄金
胶原蛋白≠胶原蛋白肽我们平时所说的胶原其实就是胶原蛋白,它是皮肤和骨骼中含量最多的有机蛋白质,约占人体总蛋白质的30%,由三条多肽链构成,以特定的方式缠绕形成一个稳定的三螺旋结构。它属于大分子蛋白,分子量一般在300kDa左右,因结构非常稳定,导致人体吸收率很低。
不只是AlphaFold!一文读懂蛋白质折叠的前世今生:从“不可能”到...
一旦多肽链组装完成,蛋白质就可以在千分之一秒内折叠成自己的结构——这让分子生物学家CyrusLevinthal感到困惑。在他于1969年发表的论文HowtoFoldGraciously中,他计算出,如果一个蛋白质要尝试每一种可能的折叠方案,其组装时间将长得不可想像。他认为,显然有某种机制可以更直接地引导蛋白质走向正确的折...