Nat Cell Biol | 单细胞新RNA测序在单次转录爆发层面上揭示了转录...

研究团队开发了NASC-seq2,这是一种改进的新RNA测序方法。该方法通过4-硫代尿苷(4sU)标记新合成的RNA5,并结合计算分析来区分新RNA和已有RNA。在实验中,研究者对10,000个原代小鼠成纤维细胞进行了单细胞新RNA测序,以推断转录爆发的动力学参数。NASC-seq2方法显著提高了检测敏感性和细胞处理通量,使得在每个细胞...

肺发育的奥秘,快来了解下吧!Cell Research,单细胞RNA测序解锁肺...

单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术的问世改变了这一局面,它使研究人员得以前所未有的精度观察细胞内部活动,尤其是那些在早期发育阶段发生的变化。此外,空间转录组技术进一步增强了研究能力,它能够在保持细胞空间位置的同时分析其基因表达情况,这对于理解器官发育过程中细胞间的相互作用至关重要。值得注意的是,此前对于早...

用单细胞与空间转录组测序技术解析膝关节骨性关节炎软骨细胞异质

WB)与非承重区(轻度磨损区域,NWB),以及3例正常对照个体膝关节软骨进行了scRNA-seq单细胞转录组测序(10XGenomics)分析,研究发现前肥大软骨细胞(preHTC)、纤维软骨性软骨细胞(FC)、稳态性软骨细胞(HomC)在患者与正常软骨中存在丰度差异性。

准确性媲美人类专家,华人学者用ChatGPT对单细胞RNA测序细胞类型...

细胞类型注释是单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析中的基础步骤,这个过程通常是费力且耗时的,需要人类专家将每个细胞簇中高表达的基因与标准的细胞类型标记基因进行比较,这一过程往往需要花费数月之久。虽然已经开发出了自动化的细胞类型注释方法,但使用标记基因的手动注释仍然被广泛使用。作为专为学习语言、理解语言和生成...

Sci Adv:单细胞RNA测序和空间转录组学绘制金鱼端脑细胞类型图谱

单细胞RNA测序(scRNA-seq)能够完全基于全基因组基因表达谱(转录组)来比较不同物种间特定组织细胞类型的分子相似性和差异。而空间转录组(ST)可以保留mRNA分子在组织中的位置信息,并实现基因谱的空间定位。本研究结合这两种技术,生成了金鱼端脑的空间注释细胞类型图谱(图1A)。

5位嘉宾共话单细胞技术前沿|第七届细胞分析大会iCCA2024 开播倒计时

导读:近些年单细胞研究前沿发展得非常迅速,单细胞分析技术也随之迅速发展,包括单细胞测序技术、单细胞微流控技术分析、单细胞质谱技术、单细胞电化学分析等领域也取得了一系列发展和突破(www.e993.com)2024年11月14日。近年来,单细胞研究前沿发展得非常迅速,单细胞分析技术也随之迅速发展,包括单细胞测序技术、单细胞微流控技术分析、单细胞质谱技术...

Cell子刊:韩敬东团队开发机器学习程序,在单细胞水平识别衰老细胞

随着单细胞转录组测序技术的进步,识别和量化单细胞干性的计算工具对于描绘分化树、层次结构及其规则变得至关重要。同样,在单细胞水平上建立一个稳健的衰老识别和量化指标,克服高drop-out率和异质性,将有助于重建细胞衰老轨迹和调控层次,从而更深入地理解衰老。

专访腾讯AI Lab姚建华、杨帆:腾讯 AI Lab 为何瞄准单细胞蛋白质组...

单细胞蛋白质组测序技术也在不断进步，技术革新层出不穷，并受到了国际顶级期刊如NatureMethods的关注和报道。特别是以SCOPE-MS（Single-CellProteomicsbyMassSpectrometry）、nanoPOTS(nanodropletprocessinginonepotfortracesamples)为代表的基于质谱的蛋白质测序技术，能够检测到单细胞中数千种...

【科技自立自强】西安交大科研团队开发多阶段单细胞转录数据的...

得益于单细胞测序技术的革新,科研人员现今能够实时捕获并深入解析细胞在不同时间节点的内在状态与行为特征,从而在分子水平上实现对细胞动态变化轨迹的精准追踪。这一技术突破为生物医学研究领域带来了颠覆性的变革,使得多阶段scRNA-seq数据分析成为当前研究实践中的主流手段。

“寒冬”不冷,2023年国产基因测序仪企业融资超10亿!

2023年中国基因测序仪市场11起融资中5项投给二代测序仪公司、3项投给纳米孔测序仪公司、2项投给单细胞测序公司、1项投给一代测序仪公司。接下来,我们一起看看钱从哪来,去向哪家,用来做啥。1、德运康瑞,A+轮,近亿元2月初,苏州德运康瑞生物科技有限公司(以下简称“德运康瑞”)宣布完成近亿元人民币A+轮融...