AI精准预测蛋白质结构,结构生物学何去何从?颜宁等人点评

第一,在剪接体结构出来之前,有很多剪接体的组分甚至是未知的。不同于传统的结构生物学,先知道你要研究对象是啥,再吭哧吭哧地去把它们的结构解出来——剪接体的电镜分析是看到了密度图之后,完全不晓得这是啥,需要通过质谱等手段去鉴定组分。我从2015年就预测:电镜与质谱组合,将会变成一个重要的生物学研究发现手段。

前进,而不是后退

正如生物学家迈克尔·莱文(MichaelLevin)和哲学家丹尼尔·丹尼特(DanielDennett)在他们的Aeon文章中指出的那样:“巨大的进步主要在于深入到分子水平,但更高层次的人实际上并不富裕...我们知道如何从干细胞中确定单个细胞的命运,但我们仍然远未能够按需制造复杂的器官。尽管几十年来人们对分子生物学和遗传学充满热情,...

体育中的复杂性和系统思维

一、体育的复杂性与传统研究方法的局限(一)体育的复杂性体育是复杂且动态的,由众多相互作用和相互依赖的部分组成,例如运动员的生理、心理和技术部分,以及更广泛地塑造体育产业的社会、经济和政治影响。在任何复杂系统中,这些部分之间的相互作用不是线性或简单直接的,并且可能产生难以预料或管理的突发行为。(二)确定...

为何诺贝尔化学奖又颁给AI?万字详解:AI重塑结构生物学

也许AlphaFold2最大的影响力是让生物学家注意到了AI的威力。它启发了新的算法,例如设计出自然界中并不存在的全新蛋白质,也催生了新的生物技术公司以及实践科学的新方法。它的新版本AlphaFold3在2024年5月上线,引领生物学预测技术进入下一阶段:构建蛋白质与其他分子(诸如DNA或者RNA)结合的复合体结构。“这是迄今为止...

Science重磅综述:二十年的微塑料污染研究——我们学到什么?

微塑料种类和丰度与摄入之间关系复杂多样。随着塑料分裂成越来越小的碎片,它们数量的增加导致对广泛生物的更多可获取性,从食物链底端的无脊椎动物到顶级捕食者(图3),其中一些将这些微粒误认为是食物。微塑料的大小、形状、颜色和化学成分的多样性,以及微生物表面定居,影响生物对有机物的有效利用率以及不良效应的潜力...

想象难以设想的事物:艺术视角下的“深时”

例如,在教室或教科书中使用线条或箭头来创建事件的时间顺序图(www.e993.com)2024年11月15日。我们在脑海中通过特定时期内发生的事件来标记时间,并相应地在时间线和图表上把它们描绘出来。周期是经验性的,以月相、日相或季节更替的形式存在。以莎朗·哈珀的两幅作品为例,它们的标题都是(尝试通过望远镜观察的)《太阳/月亮》。通过摄影的方式呈现的...

学人专栏丨刘晓峰:春节研究——新年节日群的内在结构与演变

即初吉(从初一到初七、初八)、既生霸(从初八到十五、十六)、既望(从十五、十六到二十三)、既死霸(二十四以后至于晦日)。月相变化这四个阶段的划分对我们深入思考古人制定阴阳历的规则非常重要。月亮古称“太阴”,是中国古代阴阳历中“阴历”的重要组成部分,以月相划分的时间单位构成了一个非常重要的基本框架。

Claude CEO最新万字长文,值得每一个关注AI的人读一读

如果我们对AI进展的核心假设是正确的,那么思考AI的正确方式不是作为一种数据分析方法,而是作为一个虚拟生物学家,执行生物学家做的《所有》任务,包括设计和在现实世界中运行实验(通过控制实验室机器人或简单地告诉人类应该运行哪些实验——就像主要研究者对他们的研究生一样),发明新的生物学方法或测量技术等。正是...

诺奖之后的复杂科学:18位学者勾勒未来20年复杂系统研究图景

这一巨大的复杂性挑战将需要一种真正的跨学科方法,结合网络科学、机器学习和人工智能与分子生物学和神经科学。事实上,虽然在过去几十年中,生物学一直广泛地使用单分子方法或严重依赖于分子生物学的中心法则,但现在人们已经充分认识到,大多数疾病是复杂的,为了理解这些疾病,重要的是要理解细胞相互作用网络的复杂性和...

CELL文献速递:了解微生物如何在社会中传播并塑造健康

这些其实都与微生物的社会传播有关。社会互动对微生物组成的影响可以从出生延伸到成年。比如说同一家庭内的个体通常共享12%的肠道微生物菌株。我们知道社会互动会推动病原体的传播,比如说,狩猎和食用森林猎物会增加感染人畜共患病毒的风险,从而将病原体引入人类社交;但与宿主相关的互惠共生体和共生微生物通过社会传播...