...科学与人类健康国际研讨会-李士明教授:海参皂苷的结构与活性功能
海参皂苷的结构与活性功能因为海参营养价值很高,它又是传统的食用和药用海洋资源。海参含有丰富的皂苷、蛋白质、多肽、糖类、脂肪酸、维生素和多种微量元素。具有抗癌、抗凝血、抗细菌和真菌、防止氧化等生理活性。海参皂苷是海参的主要活性物质之一。海参皂苷是海参特有的三萜化合物,其结构复杂性在于其苷元环上的取代...
中科院计算所团队提出CarbonNovo,基于AI进行蛋白质结构从头设计
一是蛋白质结构预测领域的AlphaFold2模型,它为蛋白质计算领域包括蛋白质设计领域,提供了基础的神经网络模型架构、蛋白质序列表示和结构表示方法、以及先进的训练策略(蒸馏训练、端到端训练)等技术;二是AIGC在文字、图像、视频生成领域的快速发展,为蛋白质设计提供了成熟的生成模型,例如DDPM,SDE,FlowMatching...
叶绿体蛋白转运“马达”之谜揭开
研究人员还进一步探索了“马达”在不同光合生物中的进化多样性。他们发现Ycf2-FtsHi复合体在绿色植物谱系中高度保守,且在不同物种中存在一定的差异性。“掌握这些机理,意味着人类有望调控叶绿体蛋白转运效率,从而优化光合作用效率。”闫浈说。(刘园园)
颠覆教科书!张锋最新Science论文:发现“隐藏基因”,揭开全新遗传...
另一种解释是,裂解性噬菌体在感染早期往往会降解宿主的基因组,部分原因是为了关闭细胞通过免疫蛋白的转录和翻译来应对感染的能力。而DRT2系统巧妙地克服了这一挑战,它依赖于一种在感染前已被转录的非编码RNA(ncRNA),一旦噬菌体的DNA降解活性停止,就可以将这种ncRNA转换回DNA。目前尚不清楚DRT2系统如何感知噬菌体的存...
探究普洱茶生物多样性:原因、保护现状与物质来源
普洱茶中最常见的微生物是青霉菌和曲霉菌。这两种微生物都是发酵普洱茶的关键因素之一。青霉菌主要存在于普洱茶制作的最早阶,它吸收茶叶的水分,并通过释放酶来转化茶叶中的有机物质。曲霉菌在茶叶发酵的后期扮演关键角色,它通过分解茶叶中的多糖和蛋白质,形成多有益的物质,如氨基酸和茶多酚。
诺奖剑指AI?谷歌蛋白质结构预测模型获2023年拉斯克奖
蛋白质在细胞内扮演关键角色,其功能与三维结构紧密相关(www.e993.com)2024年9月7日。虽然60多年前科学家确定氨基酸序列编码蛋白质结构,但由于构象多样性,尝试所有可能的结构排列几乎不可能。为克服挑战,科学家采用多种方法,包括使用蛋白质数据库片段来预测局部结构,但存在限制。2018年,科学家开始引入机器学习到蛋白质结构预测,不同于传统方法,机器...
模拟5亿年自然进化史,全新蛋白质大模型ESM3诞生!前Meta老将力作Le...
正如LLM在规模扩展中「涌现」出了语言理解、推理等能力,在解决有挑战性的蛋白质设计任务时,ESM3也随规模增加逐渐显现能力,其中一个重要的能力就是原子级协调。比如,提示中可能指定组成蛋白质的两个氨基酸需要在序列位置上相近,但在结构中相距较远。这衡量了模型在结构生成任务中达到原子级精度的能力。
无精是怎么一回事?科学家发现男性不育的根本原因
在包括人类在内的大多数有性繁殖的物种中,需要正确构建一种类似于网格桥的关键蛋白质结构,以产生精子和卵细胞。由前博士后研究员KatherineBillmyre博士领导的研究团队发现,在小鼠体内,改变这座桥的一个单一且非常特定的点会导致不孕症,这为人类男性由于减数分裂类似问题而导致的不孕症提供了见解。
专访清华大学刘俊杰:为基因编辑做减法,无需蛋白质的基于RNA核酶的...
基因承载着遗传信息,定义了生命的多样性和复杂性。基因编辑是理解和改造生命的关键技术,在生物学研究和生物产业发展中发挥着重要作用。历代基因编辑工具,如巨核酸酶、ZFN、TALEN均以蛋白质为基础,识别和切割DNA,编辑位点的重编程较为困难。目前被广泛使用的CRISPR-Cas工具,是RNA引导的蛋白核酸酶,通过引导RNA的间隔序列...
Nature Methods | 张阳团队开发远超AlphaFold2精度的蛋白互作结构...
在传统的结构生物学研究中,人们可以使用X射线晶体衍射、核磁共振及冷冻电镜等实验手段去解析蛋白质复合物的原子结构。但是结构生物学实验往往耗费大量人力物力,无法用于大规模获取蛋白质组学级别的分子结构信息。并且,因为技术上的限制(如结构的稳定性以及高阶复合物的尺度等),某些蛋白质相互作用的结构并不能通过传统的...