Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这

但是,irCLIP和eCLIP目前均未得到广泛采用,部分原因是eCLIP和irCLIP敏感性的某些提高可能是由于特异性的降低所致;支持这一结论的是,这两种方法检测到的PTBP1结合位点处结合基序和调控的外显子富集度降低。由于大量公开可用的数据为计算分析提供了新的资源,因此重点考虑CLIP数据的质量控制,过滤,鉴定结合位点(peakcalling...

鲁白:我们要做出真正一流的基础研究,还有很长一段路要走

第四个是1950年,美国生物化学家埃尔文·查戈夫(ErwinChargaff)应用紫外分光光度法结合纸层析简单技术,发现DNA碱基组成的规律:嘌呤数等于嘧啶数(A=T,G=C)。但可惜的是,查戈夫始终没有弄明白碱基配对在DNA的结构的作用。第五个是1953年,物理化学家和晶体学家罗莎琳德·富兰克林(RosalindFranklin)捕捉到了DNA的X...

基因检测在疾病确诊、家系遗传模式分析与再生育计划中的重要作用

1、有疾病症状临床有些患者出现病症，例如呕吐、腹部疼痛、头痛等原因就医，在做了相应的影像学检查（CT、核磁、B超）、验血化验都没发现原因，这个时候医生会建议患者通过一些基因检测来进一步查询原因，当然如果仅仅凭借临床病症，而没特异性检测指标的情况下，进行基因检测，会有很大的概率结果是阴性。2、特异性检测...

Nature Biotech背靠背 | 脱靶率极低,中外团队分别开发基于腺嘌呤...

首先,该研究证明了ABE尤其是高活性ABE8e可介导高效的胞嘧啶编辑,猜测TadA-8e脱氨酶对腺嘌呤和胞嘧啶有一个共同的催化口袋,活性位点及其周围的关键氨基酸改变可能会影响催化底物的选择。基于结构导向的理性设计和筛选,发现在TadA-8e脱氨酶的活性口袋引入关键突变N46L,消除其固有的腺嘌呤脱氨酶活性而展现高效的胞嘧啶...

Nature子刊:李大力团队开发精准高效的腺嘌呤颠换编辑器ACBE

更重要的是,传统的终止密码子产生只能依赖于胞嘧啶的突变,该研究证明了ACBEs可在富含AT的序列背景中基于腺嘌呤引入提前成熟的终止子,通过终止Tyr基因表达成功制备了小鼠白化病模型。最后研究人员评估了ACBEs编辑人类致病性SNVs位点的能力,结果表明ACBE在SH3TC2基因中有效产生63%的终止密码子,该基因的终止会导致腓骨肌...

Nature子刊:李兵辉团队发现癌症的阿喀琉斯之踵——嘧啶小体

在增殖细胞中,嘌呤核苷酸和嘧啶核苷酸可以通过回收途径回收或从头途径合成(www.e993.com)2024年11月16日。所有催化嘌呤从头生物合成的六种酶都可以形成一种被称为“嘌呤小体”的多酶复合物来调节嘌呤通量。嘧啶的从头合成由3种代谢酶催化的6种化学反应组成,分别为位于胞质的CAD、锚定于线粒体内膜的二

Nature子刊:杨辉团队开发新型DNA碱基编辑器,首次实现高效腺嘌呤...

在导致人类产生遗传疾病的单点突变中,约四分之一的致病突变的修复需要实现腺嘌呤碱基的颠换(A-to-T和A-to-C;或互补链的T-to-A和T-to-G)。然而,还没有一种碱基编辑器能够实现A-to-T和/或A-to-C这类碱基之间的颠换(即嘌呤变嘧啶)。开发能够实现腺嘌呤碱基颠换的新型DNA碱基编辑器对基因治疗领域有着...

常见的精子DNA碎片发生的机制是什么?

正常情况下,碱基配对的原则是:1.嘌呤碱基专与嘧啶碱基配对,而且腺嘌呤(A)与胸腺嘧啶(T)配对(在RNA分子中,腺嘌呤与尿嘧啶(U)配对);鸟嘌呤(G)与胞嘧啶(C)配对。2.四种可能的碱基对为A—T、T—A、G—C和C—G????但是,精子DNA碎片发生是因为出现以下情况:...

日本团队新研究:陨石中首次发现核酸主要成分嘧啶碱基

论文显示,除了此前在陨石中发现的嘌呤碱基,如鸟嘌呤和腺嘌呤,研究团队还首次检测到了各种嘧啶碱基,如胞嘧啶、尿嘧啶和胸腺嘧啶,以及它们的异构体。这些化合物存在的浓度与模拟太阳系形成前条件的实验预测的差不多。嘧啶碱基的检测。研究团队认为,这些结果表明,这类化合物可能是在星际介质中经由光化学反应产生的,随...

生物学是如何颠覆行业和“吞噬”世界的(上)

詹姆斯·沃森和弗朗西斯·克里克的模型表明,DNA分子是由两条链组成的螺旋结构,它们通过互补碱基结合在一起,腺嘌呤(A)总是与胸腺嘧啶(T)结合,而胞嘧啶(C)总是与鸟嘌呤(G)结合。他们还确定,DNA通过分离成两条链,并将其中一条链作为模板,能利用上述碱基配对原理生成另一个DNA分子,以此来进行自我复制。