2024化学诺奖接力青睐AI,蛋白质结构预测新工具获一半奖项

蛋白质拥有广泛的生物学功能,包括结构组分(胶原蛋白)、催化功能(酶)、调节作用(激素)、物质运输(血红蛋白)、机械收缩(肌动蛋白)、机体免疫(抗体)等,进而参与几乎所有生命过程,如分子水平的DNA复制和转录、蛋白质翻译、物质与能量代谢等,以及细胞层面的精卵融合、细胞增殖和分化、细胞凋亡和坏死、细胞衰老和细胞通...

中国科大解析Lon蛋白酶的完整三维结构并揭示其底物识别与转移的...

LonAAA+蛋白酶(LonA)是一种在原核生物和真核生物细胞器中保守的ATP依赖性蛋白酶。LonA组装为同源六聚体,每个单体都包含一个N端结构域、一个中间ATP酶结构域和一个C端蛋白酶结构域。LonA通过降解受损或错误折叠的异常蛋白质在细胞蛋白质稳态中发挥重要作用,从而防止这些不需要的蛋白质种类形成有毒聚集体。LonA还...

分析蛋白质功能结构域的策略和步骤

蛋白质的功能结构域(Functionaldomains)是蛋白质序列中的特定区域,它可以独立地完成某种生物学功能。分析蛋白序列的功能结构域通常涉及以下几个步骤:1.序列比对使用如BLAST之类的工具,将目标蛋白序列与已知的蛋白数据库进行比对,寻找相似的已知结构或功能的区域。2.域预测使用专门的软件工具,如Pfam、InterPro、SMA...

「蛋白偶联」创新:细胞因子只是开始,PEG/mPEG修饰才是未来

结构上由L19IL2和L19TNF组成,其中L19抗体对纤连蛋白的额外结构域B具有特异性,其Ⅲ期PIVOTAL研究显示,治疗组复发或死亡风险降低了41%,中位RFS延长了一倍以上,且患者组实现病理学完全缓解(pCR)的比例为21%。而国内领域,研究进度较靠前的则是信达生物的一款PD-1/IL-2(IBI363),其采取非对称二聚体设...

【前沿进展】Cell Regen | F-box蛋白与男性不育

F-box蛋白是Skp1–Cullin1–F-box蛋白(SCF)E3连接酶复合体中负责底物识别的亚基,其中一些F-box蛋白在睾丸中高度表达。根据不同的羧基结构域,F-box蛋白通常被分为三大亚类:含亮氨酸重复序列的FBXL蛋白,含WD40重复序列的FBXW蛋白,含多种未知结构域的FBXO蛋白。目前,在人类和小鼠中至少发现了70种F-box蛋白。

...| 杨海涛/饶子和/孙蕾等揭示冠状病毒同时挟持细胞糖受体和蛋白...

本研究揭示了9-O-乙酰化唾液酸结合HCoV-HKU1刺突蛋白NTD结构域诱导其构象变化的关键分子事件,并阐明这一构象变化如何促进相邻受体结合域(RBD)开放,从而使蛋白受体TMPRSS2得以特异性识别(www.e993.com)2024年11月8日。毫无疑问,这一重要发现不仅填补了冠状病毒侵入机制研究的空白,更首次将冠状病毒入侵所需的糖受体和蛋白受体的作用联系起来,极大...

《食品科学》:宁夏大学李亚蕾教授等:牛HSPA6蛋白特性分析及蛋白...

牛HSPA6蛋白结构域、磷酸化位点及糖基化位点分析牛HSPA6蛋白包含N-端核苷酸结合域(NBD)和C-端底物结合域(SBD)两个重要且独立的结构域。NBD又称为ATP酶结构域,约44kDa,可以结合并水解ATP;SBD称为肽结合域,约28kDa,具有蛋白酶敏感位点的中间域和结合延伸的多肽。牛HSPA6蛋白的两个结构域可以进行变构耦合,...

Transformer大杀器进入蛋白质组学,一文梳理LLM如何助力生命科学...

蛋白质是一种「语言」自然语言由单词、短语、句子等不同层次的模块组成,蛋白质的「语言」也是类似的情况。蛋白质由基序(motif)和结构域(domain)组成,类似于蛋白质世界的「单词」和「短语」。基序和结构域的各种组合与重复构建了更加复杂的结构,从而决定蛋白质的生物功能,类似于人类语言中句子传达的含义。

正确认识肠道内脆弱拟杆菌——其在健康的阴暗面和光明面

详细的结构分析确定,N端前结构域可能参与原毒素通过细胞被膜的分泌以及细菌细胞内毒素活性的抑制。有趣的是,N端结构域包含代表独特折叠的脂蛋白信号肽,而C端金属蛋白酶结构域是真核A解整合素和金属蛋白酶(ADAM)蛋白酶的异种同源物,表明脆弱拟杆菌水平获取BFT。

颠覆教科书!张锋最新Science论文:发现“隐藏基因”,揭开全新遗传...

这两项研究均发现,DRT2系统为细菌提供了强大的抗噬菌体防御能力,并且在感染期间,编码DRT2的细菌停止生长和分裂,不允许噬菌体复制。而DRT2系统仅编码一个逆转录酶和一个非编码RNA(ncRNA),似乎没有涉及任何其他蛋白质结构域或因子。因此,这两项研究都进一步探索了这种极简系统究竟是如何既能识别病毒(噬菌体)感染又能...