...科学与人类健康国际研讨会-李士明教授:海参皂苷的结构与活性功能
海参含有丰富的皂苷、蛋白质、多肽、糖类、脂肪酸、维生素和多种微量元素。具有抗癌、抗凝血、抗细菌和真菌、防止氧化等生理活性。海参皂苷是海参的主要活性物质之一。海参皂苷是海参特有的三萜化合物,其结构复杂性在于其苷元环上的取代基种类、取代位置、以及与之相连的糖的类型、数量、连接次序及位点等都有不同,从而...
AI技术辅助蛋白高效设计,普言生物实现蛋白功能提升10倍以上
第二,我们根据开发需求构建了两个基本的AI模型:基于卷积神经网络(CNN)的多模态(multimodal)、多轨(multitrack)深度学习模型,可以有效理解蛋白序列、理化特性与功能的高维内在关系,实现对某一特定蛋白进行每天超亿级别序列的超精确计算分析;此外,基于transformer的大规模语言模型,利用1010级别的超参数和108级别的训练步骤,...
AI填补蛋白质设计一大空白,或揭秘癌症、痴呆症发病机制,促进新药...
然而,结构生物学领域历来专注于研究折叠成稳定3D结构的蛋白质和核酸,目前对蛋白质在细胞中如何发挥功能的理解大多基于“序列-结构-功能”关系这一概念。而真核生物中约有30%的蛋白质并不折叠成稳定的3D结构,这些动态变形的蛋白质就是IDPs,或者当它们位于其他结构化蛋白质域的背景下时,被称为“固有无...
重磅突破!AI 填补蛋白质设计一大空白,或揭秘癌症、痴呆症发病机制...
然而,结构生物学领域历来专注于研究折叠成稳定3D结构的蛋白质和核酸,目前对蛋白质在细胞中如何发挥功能的理解大多基于"序列-结构-功能"关系这一概念。而真核生物中约有30%的蛋白质并不折叠成稳定的3D结构,这些动态变形的蛋白质就是IDPs,或者当它们位于其他结构化蛋白质域的背景下时,被称...
DeepMind新成果被批像广告?AlphaProteo可高效设计靶蛋白结合物...
一方面,蛋白质设计需要从功能出发,设计全新或改良的蛋白质结构,以实现特定的生物或化学功能,所以非常依赖于对蛋白质结构与功能关系的理解。另一方面,蛋白质预测则能够提供关键的结构信息,指导设计。同时,设计出的蛋白质也能够帮助改进预测模型,增强蛋白质折叠、动力学等方面的预测准确性。
FSHW | 食源性降尿酸肽的研究进展及其作用机制
构效关系的解析一般依赖实验数据的大量积累,而以分子对接为基础的新型构效关系解析策略,结合了虚拟预测和功能实验,可以对作用于特定靶标的活性肽进行饱和式预测和功能分析,尤其适用于实验数据较少、靶点较新的活性肽构效关系分析(www.e993.com)2024年9月7日。活性肽多以口服的形式摄入,而消化道蛋白酶对其活性有潜在的破坏性,为了提高活性肽生物...
不只是AlphaFold!一文读懂蛋白质折叠的前世今生:从“不可能”到...
图|蛋白质结构水平(来源:MarkBelan)地球上已知的蛋白质有数亿种,未知的也有很多。它们承担着各种各样的功能:血红蛋白和肌红蛋白将氧气运输到肌肉和全身;角蛋白为头发、指甲和皮肤提供结构;胰岛素使葡萄糖进入细胞,转化为能量。蛋白质可以呈现出看似无穷多的形状,从而匹配它们在生命活动中执行的看似无穷多的任务。
AI Agent自主设计全新蛋白质登Nature!威斯康星大学让机器人科学家...
就像一个能自己做实验的机器人科学家。它能通过自主学习自行进行蛋白质设计,同时在实验室里自动进行测试。AIAgent,已经可以不需要人类帮助,就能自行设计和测试全新的蛋白质了!这个AI能够自主学习蛋白质结构与功能关系。而且在糖苷水解酶领域创造出的新蛋白质,比原始蛋白质更稳定。
研究揭示人类内在无序蛋白质组的构象组合
IDR具有多种瞬时形成的结构,并打破了传统的序列-结构-功能关系。蛋白质科学的发展使得在蛋白质组尺度上预测折叠蛋白质的三维结构成为可能。相比之下,人们对IDR的构象特性还缺乏了解,部分原因是无序蛋白的序列保守性很差,另外也因为只有少数这类蛋白在实验中得到了表征。无法预测整个蛋白质组中IDR的结构特性限制了人们...
更“天然”仿生骨、高难度蛋白质晶体……这些空间实验随神十七...
高通量蛋白质结晶及分子结构与功能研究将利用空间微重力环境,设计多种生长条件,获得大尺寸高质量蛋白质晶体。待样品随乘组回到地面后,将通过地面X-射线衍射获得其高分辨率结构。科学家将在此基础上进一步研究其生物学功能,揭示生命活动规律并用于相关生物技术研究。