因为一个“很难,很重要的问题”,我从计算机转向研究蛋白质

从数学角度,你也可以用一个字符串去表示一个蛋白质的氨基酸序列。每个氨基酸都是由几十个原子形成的,在这页幻灯片的下半部分,我画了一些原子结构,大家可以对蛋白质的分子式有一个直观的认识。现在我们只要知道氨基酸序列,就能知道蛋白质的分子式。原子在细胞里面有相互作用力,最后会形成一个比较稳定的状态去执行某...

从图神经网络到几何深度学习:AI4Science 的下一个颠覆性突破在何处?

例如对于这个小白兔(Bunny),它经过一个旋转变换后是否还能判断出它是一个小白兔。这种空间上的等变性对药物设计,特别是大分子药物设计、抗体设计的预测复合体结构中(例如AlphaFold3)的准确性的提升十分重要。感兴趣的朋友可以观看相关分享——图神经网络与组合优化:5.几何图神经网络及其科学应用(httpspattern...

超越“氢键”,全新定义!

其中,氢键是最为人所熟知的例子。长期以来,科学家们普遍认为氢是唯一能够形成这类键的元素,因此“次级键合作用”、“非共价键”和“氢键”等术语常被互换使用。然而,随着研究的深入,这一观念逐渐受到挑战。在20世纪70年代,研究人员发现卤素原子也能参与类似的相互作用,随后的研究进一步表明,其他p区元素也能形成类似...

大脑复杂性的演化:一个空间、时间和熵的故事

举个例子,熵值随着物质自发的均匀分布(如两种起初分离的气体相互混合)而增加。与之相似,热量随着温度梯度(temperaturegradient)降低也带来了熵增,这是由粒子热能在空间上的均匀分布产生的。空间中自由活动的粒子最终总是呈现出无结构的随机排布,这种现象的本质原因很简单——无序状态比有序状态有更多种可能性。玻尔兹曼...

究竟什么是科学?——从牛顿《炼金术手稿》谈起(中) | 文一

因此,牛顿认为,“发酵”与“腐烂”就像作用力(生命力)与反作用力(衰败力)一样不断地维持着宇宙万物的生命周期和相互转化。牛顿是在他写作《自然哲学的数学原理》和《光学》期间,通过炼金术实验(见图1)构思出他的“本体论”化学图像的。不过凯恩斯关于牛顿“不是理性时代的第一人,而是最后一位魔法师”,关于牛顿...

对话深势科技 | 如何用AI改变科学?

Q:上亿原子体系规模的计算,如何换算到大模型领域的计算,大概是什么样的计算量?A:在微观尺度下,两个原子之间的相互作用可以通过物理模型来分析,例如通过经典力学或量子力学方程,计算它们之间的相互作用力和运动轨迹(www.e993.com)2024年11月10日。这时,计算只需要考虑两个原子的相互影响,问题相对简单。然而,随着系统中的原子数量增加,情况变得更加复...

杨振宁是如何获得诺贝尔奖的?通俗易懂的语言,让你迅速搞懂

举个例子,我们知道物理学上有一个定理叫做能量守恒。能量守恒定律对应的叫做时间平移对称性,意思就是不论什么时候做实验,这个定律都是成立的。看到这句话,你可能觉得这是废话。别急,物理学家们当初还觉得宇称守恒是一句废话呢,一会我们会讲他们是怎样被啪啪打脸的。

1932,物理学的奇迹之年丨展卷

需要一种新的作用力,而且从概念上讲和万有引力和电磁力这两种已知的作用力同样属于基本作用力。费米给这种作用力起名叫弱相互作用,跟另外两种作用力的不同之处在于会让粒子改变身份:按费米的设想,电子在弱相互作用下会变成中微子,质子则会变成中子。稍微延伸一下,这种作用力甚至可以让一个中子完全消失,变成一个质子、...

“此有故彼有,此生故彼生”,缘起,应这样理解

缘起,世间的一切是相互作用的,是这个世界最基本的一个底层的逻辑,或者说运行的逻辑。再举一个例子,我、师兄、师父、师爷。为什么我叫师父为师父呢?因为我是徒弟。没有徒弟,就没有师父。同样,没有师父,也没有徒弟。所以,整个关系也是缘起的。在家庭中也一样,如果没有孩子,我们就不可能成为父母。正因为有了孩...

香港理工大学博士:凡伟改写了库仑定律,解释了高温超导机理

根据论文显示：凡伟发现了电荷和电场不存在，改写了库仑定律，提出了麦克斯韦方经典电磁学理论的一种替代理论模型；预测了电子和质子作为一种不具有电荷属性的粒子而存在，并基于电荷不存在预测了自然界四大基本相互作用力之一的“强相互作用力其实并不存在”。同时，作者还基于电荷不存在解释了高温超导机理，并使用理论力学...