GPT-4无师自通预测蛋白质结构登Nature子刊!LLM全面进军生物学...
α-螺旋是蛋白质中最常见且被广泛研究的二级结构。研究人员表示,虽然使用各种prompt进行了多次尝试,GPT-4和GPT-3.5都无法像模拟氨基酸一样准确地生成α-螺旋多肽链的结构。有趣的一点是,GPT-4习惯于用数学公式描述α-螺旋的空间结构参数:由于单独使用GPT-4效果不佳,实验人员尝试整合Wolfram插件,这是由Wolfram-Alp...
...交大钟博子韬:极致利用数据,以原子精度预测所有生物分子结构...
蛋白质合成始于DNA转录,后将遗传信息传递给RNA,再翻译成蛋白质,进一步折叠成二级结构、三级结构、四级结构。大多数蛋白质会折叠成独特的构象,而结构所需的信息都编码在氨基酸序列中,也就是我们常说的:序列决定结构,结构决定功能,蛋白质结构预测对于了解生物功能至关重要。AlphaFold3突破:革新模型架构,提高数据...
...张东杰教授等:重金属铅对大麦苗粉蛋白质二级结构及氨基酸的影响
蛋白质是具有特殊结构的生物大分子,蛋白质二级结构在1600~1700cm-1之间,与酰胺I带重叠。经过PeakFit软件去卷积处理拟合后得到酰胺Ⅰ带图谱,通过峰高度和峰面积可以看出受Pb胁迫后大麦苗粉(CMQPb)的蛋白质二级结构较未胁迫大麦苗粉(CMQ)相对含量发生了变化,如图1所示。02大麦苗粉酰胺Ⅰ带图谱的高斯拟合...
...药物研发新革命,AlphaFold3太强了!专家团队手把手教授AI蛋白质...
这一最新模型能预测含有蛋白质数据库(ProteinDataBank)内几乎所有分子类型的复合物的结构,包括配体(小分子)、蛋白质、核酸(DNA和RNA)如何聚集在一起并相互作用,以及预测翻译后修饰和离子对这些分子系统的结构影响,从而帮助我们在原子水平上精确地观察生物分子系统的结构。这种用计算机解析蛋白质与其他分子复杂相互...
...团队开发trRosettaRNA:利用Transformer网络自动预测RNA 3D结构
此外,还有两个二聚体(R1107、R1108)和两个具有许多单链区域的蛋白质结合RNA(R1189、R1190)。这些特征对SPOT-RNA预测可信二级结构提出了挑战。为了说明这一点,与20个RNA-Puzzles目标相比,来自CASP15的8个天然RNA的SPOT-RNA预测二级结构的平均F1分数要低得多(分别为0.62和0.72)。
组织最大的浪费,是经验的浪费
第二,现在是“小而美”的自主按需学习时代,有碎片化和个性化的特征;第三,现在是“精灵轻”的绩效导向培训时代,培训需要精准支撑业务,讲求落地转化,特点是轻课程重实践(www.e993.com)2024年9月7日。3.经验萃取适合的组织类型经验萃取适合的企业或组织类型:第一种,标杆企业。企业已经在行业内成为了头部或者龙头,且标杆企业内部有足够多的经验...
南开开发trRosettaRNA:利用Transformer网络自动预测RNA 3D结构
此外,还有两个二聚体(R1107、R1108)和两个具有许多单链区域的蛋白质结合RNA(R1189、R1190)。这些特征对SPOT-RNA预测可信二级结构提出了挑战。为了说明这一点,与20个RNA-Puzzles目标相比,来自CASP15的8个天然RNA的SPOT-RNA预测二级结构的平均F1分数要低得多(分别为0.62和0.72)。
定量蛋白质组学方法应用于病毒结构、功能及感染机制研究
基于iTRAQ试剂的定量蛋白质组学揭示相似病毒的结构和功能差异图1:iTRAQ试剂结合定量蛋白质组学能够揭示病毒不同状态下的蛋白丰度差异(来源ZhihongHu,JVI,2012)EV71(肠道病毒71型)是导致幼儿手足口病的主要病原体之一,其表达两种EV71病毒,包涵体衍生型病毒(occlusion-derivedvirus,ODV)和出芽型病毒(buddedvirus,...
花青素与小麦蛋白相互作用及对蛋白质结构的影响
Gli属于单体蛋白,有4种类型,分为α、β、γ、ω四种类型,Gli决定面团的黏性。Glu是多肽链通过分子间二硫键相互连接成的大分子聚合物,主要由2种亚基组成,分别为低分子质量亚基和高分子质量亚基,其分子内含有较多的β-折叠结构,易发生聚集作用,主要为面团提供弹性。
...大学苏东民教授等:亚麻籽胶及沙蒿胶对冻融面筋蛋白微观结构和...
4、冻融循环中亲水胶体对面筋蛋白二级结构的影响如表1所示。未添加胶体的面筋蛋白经过冻融循环处理后,α-螺旋和无规卷曲相对含量降低、β-转角和β-折叠相对含量增加。β-折叠相对含量增加是因为α-螺旋受冻融循环处理的影响形成了一系列新的β-折叠并转向更弱的氢键结构,从而加剧了分子间的β-折叠,使二级结构发...