2024诺贝尔化学奖解读:他们破译了蛋白质令人惊叹的结构之谜
在蛋白质中,氨基酸以长链的形式相互连接,形成三维结构,这是蛋白质功能的关键。自20世纪70年代以来,研究人员一直试图从氨基酸序列预测蛋白质结构,但这被认为是极其困难的。然而,四年前由戴米斯·哈萨比斯和约翰·江珀实现了一个惊人的突破。戴米斯·哈萨比斯其实是从游戏领域“跨界”来到化学领域。出生于1976年7月...
他们破译了蛋白质的结构之谜
大卫·贝克在哈佛大学学习的是哲学和社会科学专业,后来探索细胞生物学,对蛋白质结构着迷。1993年,他就职于美国华盛顿大学西雅图分校。2003年,大卫·贝克成功利用氨基酸这一生命的基本建构单元,设计出了一种与任何其他蛋白质都不同的新蛋白质。从那时起,他的研究小组设计出了一系列富有创意的蛋白质,包括可用作药物、疫...
解读|为什么AI工程师预测蛋白质结构能获诺贝尔化学奖?
除了根据氨基酸序列预测蛋白质的结构——从线性的序列就能预测其折叠后的三维空间结构,人们在AI模型的帮助下,洞悉蛋白质结构的上述密码后,产生了更大想象力——创造具有新功能的蛋白质。这可能导致新的纳米材料、靶向药物、更快的疫苗开发、最小的传感器和更环保的化学工业。它也让我们更好地了解生命是如何运作的,...
诺奖得主David Baker学生沈浩署名文章:蛋白质设计究竟是什么?
然而,绝大部分蛋白质的功能尚不清楚,因为在序列信息之上,还有更重要的一层,那就是蛋白质的三维结构。1972年,诺贝尔化学奖的一项重大发现就是蛋白质的三维结构由一维序列决定。通过漫长的进化,自然界筛选出一系列蛋白质序列,这些序列通过合理排列疏水性和亲水性氨基酸,在水中自发折叠形成蛋白质的结构。然而,从物理...
AI助力蛋白质研究:从结构预测到新应用,均获诺贝尔化学奖
而在蛋白质设计方面,传统理性设计方法和AI技术可结合,发挥各自优势。科学家可利用理性设计确定基本结构框架,再用AI技术优化改进,获得更好性能的蛋白质。此外,AI还可与其他技术手段结合,如高通量筛选、基因编辑等,为蛋白质研究提供更强大工具。2.AI在蛋白质研究中面临的问题...
诺贝尔化学奖是AI for Science,物理奖是Science for AI
2.结构特点它包含了新颖的α螺旋和β折叠的组合方式,这种排列在自然界中从未被发现过(www.e993.com)2024年10月17日。虽然使用了常见的二级结构元素(α螺旋和β折叠),但它们的三维空间排布是全新的。3.突破意义证明了我们可以设计出自然界中不存在的蛋白质结构。表明蛋白质设计不必局限于模仿自然蛋白质。
解读|为什么AI工程师预测蛋白质结构能获诺贝尔化学奖?
药物、疫苗和传感器:设计一种从未存在过的全新结构的蛋白另一位诺贝尔化学奖得主、美国华盛顿大学教授戴维·贝克(DavidBaker)也是“玩”蛋白质的。他在软件的帮助下,设计了自然界不存在的、全新的、特殊结构的蛋白质。戴维·贝克1962年出生于美国华盛顿州西雅图,他师从兰迪·谢克曼(2013年诺贝尔生理学或医学奖得...
诺贝尔化学奖是AI for Science,物理奖是Science for AI-虎嗅网
2.结构特点它包含了新颖的α螺旋和β折叠的组合方式,这种排列在自然界中从未被发现过。虽然使用了常见的二级结构元素(α螺旋和β折叠),但它们的三维空间排布是全新的。3.突破意义证明了我们可以设计出自然界中不存在的蛋白质结构。表明蛋白质设计不必局限于模仿自然蛋白质。
GPT-4无师自通预测蛋白质结构登Nature子刊,LLM全面进军生物学...
氨基酸是蛋白质的最小组成单位,其原子组成和几何参数已经得到了很好的表征,因此非常适合基本结构建模任务。实验通过prompt给出最少的必要上下文信息,让GPT-4以PDB格式对20个标准氨基酸进行建模,同时还纳入了GPT-3.5作为性能对比。对每个单独的氨基酸,研究人员都用相同的prompt输入5次迭代运行以监控一致性。
医生调查896位肝病患者,发现患肝病的人:基本都会有2个特点
针对肝病,有医生曾深入调查过896位患者,他们基本都有2个共同特点!一、为什么越来越多的人患肝病?肝病是指发生在肝部位的疾病,能够给肝功能造成损伤或者说肝脏结构病变的一系列疾病。常见的肝病包含病毒性肝炎、无菌性肝炎、肝硬化、肝癌等。肝病的类型比较多,而且因为肝脏的代谢能力比较强,所以很多患者在发病初...