诺奖得主David Baker学生沈浩署名文章:蛋白质设计究竟是什么?
然而,绝大部分蛋白质的功能尚不清楚,因为在序列信息之上,还有更重要的一层,那就是蛋白质的三维结构。1972年,诺贝尔化学奖的一项重大发现就是蛋白质的三维结构由一维序列决定。通过漫长的进化,自然界筛选出一系列蛋白质序列,这些序列通过合理排列疏水性和亲水性氨基酸,在水中自发折叠形成蛋白质的结构。然而,从物理...
...了,专家解读:2024诺贝尔化学奖为何颁给蛋白质的AI计算和结构预测
蛋白质序列的决定了它的结构和功能,就像一把钥匙只有对应形状的锁才能打开一样。”“蛋白质结构预测,实际上是个古老的问题,大家一直在破译的路上,而这次获奖成果解决了一个困扰生命科学领域近七十年的难题。”张贵军表示,这串“珍珠项链”中每一个“珍珠”的类型、排列顺序的“第一遗传密码”早在上世纪60年代已...
借助AI模型破解蛋白质结构的密码
另一个重大发现是科学家能够预测蛋白质的结构了。蛋白质中的氨基酸像长串珠子一样连接在一起,折叠成复杂的三维结构,这种结构对蛋白质的功能至关重要。自20世纪70年代以来,科学家们就一直在努力根据氨基酸序列预测蛋白质的结构,但这一直是个巨大的挑战。四年前,这一领域迎来了重大突破。2020年,哈萨比斯与江珀提...
2024年诺贝尔化学奖揭晓!揭开蛋白质折叠的秘密
相对于Rosetta等此前的结构预测算法,AlphaFold2得到的预测结构与实验测定的真实蛋白质结构有着非常高的一致性。插图:使用Baker程序Rosetta开发的蛋白质AlphaFold2的技术特点是使用了一种基于深度学习的方法,特别是注意力机制和神经网络,用于预测蛋白质的氨基酸对之间的距离,并据此构建蛋白质的三维结构。它的成功震撼了科...
AI再度“爆冷”诺贝尔化学奖 知乎答主科普人工智能预测蛋白质结构
AI全面“入侵”本届诺贝尔奖,成为最大赢家。诺贝尔物理学奖颁发给GeoffreyHinton的原因是,其使用了统计物理学的工具来训练机器,为后续人工神经网络实现机器学习奠定了基础,而化学奖的两位获得者则是利用人工智能推动了科研的前进,借助AI模型AlphaFold2解决了一个已存在50年的难题:预测蛋白质的复杂结构。AlphaFo...
诺贝尔化学奖给了预测蛋白质的哈萨比斯等,是AI for Science,物理...
结构特点它包含了新颖的α螺旋和β折叠的组合方式这种排列在自然界中从未被发现过虽然使用了常见的二级结构元素(α螺旋和β折叠),但它们的三维空间排布是全新的突破意义证明了我们可以设计出自然界中不存在的蛋白质结构表明蛋白质设计不必局限于模仿自然蛋白质...
诺贝尔化学奖是AI for Science,物理奖是Science for AI
2.结构特点它包含了新颖的α螺旋和β折叠的组合方式,这种排列在自然界中从未被发现过。虽然使用了常见的二级结构元素(α螺旋和β折叠),但它们的三维空间排布是全新的。3.突破意义证明了我们可以设计出自然界中不存在的蛋白质结构。表明蛋白质设计不必局限于模仿自然蛋白质。
诺贝尔化学奖是AI for Science,物理奖是Science for AI-虎嗅网
2.结构特点它包含了新颖的α螺旋和β折叠的组合方式,这种排列在自然界中从未被发现过。虽然使用了常见的二级结构元素(α螺旋和β折叠),但它们的三维空间排布是全新的。3.突破意义证明了我们可以设计出自然界中不存在的蛋白质结构。表明蛋白质设计不必局限于模仿自然蛋白质。
AI革新:蛋白质设计新突破,助力癌症与痴呆症研究
IDPs是一种无法折叠成稳定或有序三维结构的蛋白质,被认为在健康系统和各种疾病的病理生理学中都具有重要的生物学意义。与折叠的蛋白质不同,IDPs的特点是高度无序、局部移动性和高动态性,对现有预测工具而言尤其具有挑战性。这项研究不仅在理论上提出了新的设计方法,还通过实验验证了设计的IDPs变体,并使用机...
诺奖2024|马剑鹏:AI已绕不开,不能再不懂,宜从娃娃抓起
“在你身体的每个细胞内,数十亿个微型机器——蛋白质——正在努力工作。”有人甚至说,几乎生命的一切特征都跟蛋白质有关。的确,蛋白质是每个生物体中每个生物过程的基础,它是生命的基石。没有蛋白质,生命就无法存在。结构是如此重要,蛋白质复杂而多样的结构,对应了各种惊人的功能,从而促成了生命的丰富多彩。其...