【小优细节君】组织磷酸化蛋白很难做?细节要注意

蛋白质磷酸化是最常见和最重要的翻译后修饰(PTMs)之一。磷酸化调控机制由激酶、磷酸酶及其底物磷酸结合蛋白组成,蛋白质通过三磷酸腺苷(ATP)水解和激酶的酶活性获得磷酸基团。自1992年E.H.Fischer和E.G.Krebs两位科学家因发现可逆性蛋白质磷酸化而获得诺贝尔奖以来,磷酸化在所有生命过程中的重要作用一直是研究热门。

Science一周论文导读|2024年6月7日

(导读领研网)本研究展示了KRAS突变驱动下的蛋白磷酸化特征,鉴定出2123个ERK依赖性的磷酸化蛋白。并在此基础上构建了一个基于ERK依赖性的磷酸化蛋白组的蛋白激酶信号网络,以此来展示随时间改变的激酶动态变化。ERK磷酸化蛋白组中有17%对PDAC生长非常关键,主要富集于细胞核定位蛋白以及细胞周期调节...

国内Nature,Cell三连发:翻译后修饰研究如何花式发顶刊

单磷酸腺苷酸化修饰(AMPylation)是一种广泛存在于原核和真核生物中的蛋白质翻译后修饰,在腺苷酸化酶的催化下,使用单磷酸腺苷基团(AMP)修饰蛋白质的氨基酸侧链。本文报道了使用三磷酸腺苷(ATP)作为配体和宿主肌动蛋白作为激活剂,嗜肺军团杆菌的效应蛋白LnaB对PR-Ub上的磷酸核糖基的磷酰基进行AMPylation,从而生成ADPR-...

Nat Chem Biol | 陈鹏与合作者开发面向磷酸蛋白组的生物正交...

通过对激酶信号通路的定量磷酸化蛋白质组学分析,该工作获得了以下结论:1)DeKinomics实现了秒级分辨率的活细胞内激酶激活;目标激酶激活数秒内即引起特异的下游磷酸化信号级联,这种响应能被磷酸化蛋白质组学精准定量。2)从DeKinomics高时间分辨的磷酸化蛋白质组学数据中,寻找响应速度最快的磷酸化位点,是鉴定目标激酶细胞...

突破耐药困境!CDK6与仑伐替尼的抗癌战争

作者通过体外激酶测定,证实GSK3β是CDK6的直接底物(图6c),并使用共聚焦IF显微镜进一步证实了这两种蛋白的共定位(图6d)。接下来,作者研究了CDK6是否通过直接结合调节GSK3β(Ser9)的磷酸化,结果表明,抑制CDK6可抑制GSK3β(Ser9)的磷酸化和β-catenin的表达,而过表达CDK6后则会出现相反的效果(图6e)。

解析R848结合流感疫苗的偶联剂依赖效应:对APC激活及体内免疫原性...

-IPR8-GMBS-R848疫苗刺激的细胞中磷酸化IκBα/总IκBα比率显著增加,与其他疫苗相比(www.e993.com)2024年10月31日。-不同疫苗刺激组的总IκBα水平相似,支持在IPR8-GMBS-R848刺激的MODC中NF-κB的激活增加。综上所述,在IPR8-GMBS-R848刺激的MODC中观察到促炎细胞因子的产生增加,说明该疫苗可能具有增强免疫反应的潜力。

JMV|北京大学彭宜红教授课题组揭示肠道病毒2A蛋白ST125磷酸化是...

而S125A和S125D基团均不具有形成有效氢键网络的作用。由此揭示了EV-A712AproS125磷酸化修饰有益于对底物水解的分子动力学机制。综上,本研究确立:肠道病毒存在由宿主细胞ERK1/2激酶介导的2AproS/T125单位点磷酸化修饰作用,该位点磷酸化有益于病毒2Apro切割活性,并有效保障肠道病毒增殖和致病作用,且该作用...

『珍藏版』Cell综述 | 细说mTOR底物磷酸化

4.mTORC1底物:S6K、4E-BP、ULK1和TFEB目前描述最完善mTOR底物是S6K和4E-BP。它们被广泛用作mTORC1活性指标,因为存在特异性识别这两种蛋白质磷酸化形式的抗体。S6K哺乳动物中有两个S6K,由不同的基因编码。S6K属于AGC激酶家族。AGC激酶家族成员通常是mTORC2的底物。S6K是唯一的AGC激酶,是一个mTORC1底物。S6K1被...

【Nature子刊】广东药科大学李雄团队发现磷酸化激酶PLK1调节癌症...

由于异常DNA高甲基化导致TSG沉默是癌症的一个基本特征。在本研究中,PLK1与TSG启动子区DNA甲基化水平呈正相关,抑制PLK1显著提高了p16、p21、p73、MAGI2、SOX7和MSX1等TSG的表达水平。本研究揭示了PLK1通过磷酸化修饰促进UHRF1蛋白稳定性是肿瘤细胞中TSG被表观遗传沉默,从而打破癌基因和TSG之间的平衡、维持癌细胞增殖...

磷酸化+TMT蛋白质组学探究改善自噬信号异常疾病的治疗靶点

因为蛋白质磷酸化的丰度低,所以细胞器水平的研究是个挑战。为了克服这个问题,作者开发一种方法。首先,使用质谱仪分别检测了溶酶体蛋白质组和总的mTORC1调控的磷酸化蛋白质组。然后,交叉引用了两个数据集,并用生物信息学提取了潜在的溶酶体特异性mTORC1底物。