因为一个“很难,很重要的问题”,我从计算机转向研究蛋白质

中间这幅图片是一个血红蛋白,它的主要功能是帮助我们把氧气运输到人体各个地方。怎么运输?你看到中间有些小球,这些小球表示的是铁原子。血红蛋白把铁原子包裹起来,铁原子跟氧气结合,通过这种方式把氧气运输到各个细胞里面去。最右边的蛋白(朊蛋白)跟疯牛病有关系,这里显示了朊蛋白两种不同构型,左边的构型是正常的折叠...

...洪亮团队提出CPDiffusion模型,超低成本、全自动设计功能型蛋白质

上海交通大学洪亮团队设计了一种扩散概率模型框架CPDiffusion,该框架能够以非常低的训练成本、数据成本学习蛋白质的序列、结构与功能之间的隐含映射关系,从而生成多样化的蛋白质序列。蛋白质是生命活动的主要执行者,其结构与功能之间的关系一直是生命科学领域研究的核心议题。近年来,随着深度学习的兴起,借助其强大的数据...

Nature与Science同时出王炸!生命科学领域又一位“天才少年”诞生...

2021年,DeepMind推出了AlphaFold2,其能够根据氨基酸序列来准确预测蛋白质的三维结构。AlphaFold2的出现,引发了蛋白质结构及其相互作用建模领域的一场革命,为蛋白质建模和设计应用提供了广泛的可能。而最近,DeepMind团队带来了AlphaFold2的全面升级版——AlphaFold3。以下为大家公布十大诺奖热点方向十大热门方向01、AI蛋白...

追问weekly | 过去一周,脑科学领域有哪些新发现?

他们发现,结构-功能的对应性在不同脑区表现出显著差异。在初级感觉和运动皮层,结构与功能的耦合关系较为紧密,尤其是在处理感知和运动功能时;而在联合皮层,该对应性较弱,反映出复杂认知功能对直接神经连接的依赖性较低。此外,研究结合自然语言处理技术发现,人类的语言系统与大脑的神经结构有一定的对应性,这种联系可能...

BAAI:第一原理的脑和认知科学的人工智能,6大角度

在行为层面上,心理学和认知科学已经证明,人类和动物的大脑可以执行非常智能的高级认知功能,如灵活学习、长期记忆和在开放环境中做出决策。在结构层面上,认知和计算神经科学揭示了大脑具有极其复杂但优雅的网络形式来支持其功能。多年来,人们一直在收集关于大脑结构和功能的知识,这一过程随着全球范围内大型脑项目的启动而...

Nature Methods:基因变异与蛋白质功能的动态链接:G2P平台推动临床...

通过G2P平台,可以方便地检索并可视化基因-蛋白质的映射关系,并且能够将数据下载用于后续分析(www.e993.com)2024年11月3日。这一工具为基因组学与蛋白质结构之间的桥梁提供了极大的便利,为探索与疾病相关的遗传变异的结构功能机制铺平了道路。近年来,人工智能(AI)技术的进步极大地推动了结构生物学的发展,尤其是AlphaFold等AI驱动的蛋白质结构预测...

...等解读AI赋能的蛋白质结构与功能预测及设计丨Cell Press线上讲座

蛋白质的体内合成受基因调控,其主链结构多为线型结构。具有非线型复杂拓扑结构的蛋白在大自然中较为少见,大多与特定的功能优势相联系。我们致力于拓展蛋白质的拓扑结构,以探索拓扑结构的构效关系以及生物医药应用。利用可基因编码的多肽标签-蛋白质化学反应,通过合理的设计及与蛋白质折叠的结合,我们已经合成了多种具有复...

AlphaFold为什么能精准预测蛋白质结构?

当不同的氨基酸连成一串的时候,它们会脱水形成肽链,也就是蛋白质的一级结构;而这样的一级结构是不稳定的,受到疏水作用、氢键和范德华力等影响,肽链最终会折叠成一个非常复杂而稳定的三维结构。图1是一个蛋白质折叠前后对比的例子。图1:蛋白质折叠示意图丨图源:wiki...

蛋白质序列全局比对分析如何解析蛋白质功能和结构的多样性?

1.全局比对分析的原理全局比对分析是将目标蛋白质序列与已知蛋白质序列进行比对,寻找相似性并推测功能和结构。该分析方法基于序列相似性和保守性的概念,通过算法和统计模型对序列进行比对和评分,以确定相似性和差异性的程度。全局比对分析可以识别序列之间的保守区域和变异区域,从而揭示蛋白质的功能和结构的多样性。

2025天津医科大学《810生物学基础》全国硕士研究生入学统一考试大纲

(二)真核细胞的结构和功能1、生物膜2、细胞壁3、细胞质及其内含物4、细胞核二、细胞的增殖细胞增殖与细胞周期各时相的主要事件三、细胞有丝分裂(M期)增殖的过程四、细胞增殖调控的基本原理五、细胞呼吸(一)糖酵解(二)有氧氧化(三)生物氧化...