Cell | 绘制人体病原体与人体外蛋白间的互作图谱
节肢动物传播的微生物病原体与人类胞外蛋白和分泌蛋白(统称为外蛋白,exoproteins)之间的相互作用是引发媒介传染病的关键。探究病原体与人类外蛋白之间的互作有助于了解媒介传染病的致病机制,并有望为治疗和预防媒介传染病提供潜在靶点。近日,弗雷德哈钦森癌症研究中心AaronM.Ring团队、耶鲁大学ErolFikrig团队和Noah...
登Nature子刊,拓扑Transformer模型多尺度蛋白质-配体互作预测
元素相互作用,包括氢键、范德华力和π堆积,是蛋白质-配体复合物稳定性和特异性的基础。为了在元素层面分析这些相互作用,研究人员在拓扑序列嵌入中引入了元素特定分析。该方法根据蛋白质和配体中的常见重元素构建子超图,生成元素特定的拉普拉斯矩阵来编码复合物内的相互作用。该技术提取详细的物理和化学特征,增强了...
蛋白质互作质谱分析:从样本到结果的全面质谱分析蛋白
蛋白质互作质谱分析是一种利用质谱技术研究蛋白质相互作用的方法。质谱技术是一种通过测量蛋白质分子的质量和荷电量来确定其结构和性质的方法。蛋白质互作质谱分析则是在质谱技术的基础上,通过分析蛋白质之间的相互作用来揭示它们在细胞内的功能和调控机制。二、蛋白质互作质谱分析的步骤蛋白质互作质谱分析通常包括以下...
Naveni PLA原位蛋白互作技术常见FAQ
邻近连接技术(Proximityligationassay)是一种定位蛋白质检测技术。将两种一抗分别与位于一种蛋白质或两种邻近蛋白质上的目标表位结合,再使用Navenibodies(与专有oligo臂结合的精选抗体)与各自的一抗结合,当Navenibodies靠近时,附着的寡聚物能形成DNAcircle,再加入聚合酶,就会启动滚圆扩增(RCA)过程。通过标记的...
基于中国野生毛葡萄的抗白粉病功能,研究其互作蛋白,有何重要性
PAN结构域含有大量的半胱氨酸,已被证明参与蛋白质-蛋白质相互作用和蛋白质-碳水化合物相互作用。最后一类是℃型LecRLK,它是一种钙依赖凝集素类受体激酶,在植物中发现较少,却是存在于哺乳动物中的一个大家族,其主要功能是参与先天性免疫反应并通过自我识别与非自我识别参与免疫过程,识别病原体。
...团队研究成果:利用深度学习方法揭秘疾病突变对蛋白质互作影响...
因此,研究团队通过MIPPI对来自于发育迟缓障碍患者的612个罕见错义变异,进行蛋白互做的致病性解析(www.e993.com)2024年7月24日。研究团队通过MIPPI,比较具有相同突变蛋白的不同成对蛋白互作之间所有四种效应类别(破坏、减少、增加、无效应)的预测得分,计算了其突变效应谱的相异性(余弦相似性)。研究人员发现,具有相同的突变体的蛋白对它的不同蛋白...
研究发现一氧化氮互作蛋白调控低糖诱导神经元凋亡的新机制
NO互作蛋白调控低糖诱导神经元凋亡的新机制版权声明本网站所有注明“来源:生物谷”或“来源:bioon”的文字、图片和音视频资料,版权均属于生物谷网站所有。非经授权,任何媒体、网站或个人不得转载,否则将追究法律责任。取得书面授权转载时,须注明“来源:生物谷”。其它来源的文章系转载文章,本网所有转载文章系出于传...
Nature Methods | 超过AlphaFold2精度,蛋白质互作结构预测新工具
基因是构造生命的基本蓝图,而蛋白质是生命功能的执行者和生命现象的体现者。蛋白质生物学功能的绝大部分都是通过和其它蛋白质的相互作用来实现。因此,蛋白质-蛋白质相互作用(简称‘蛋白质互作’)在生命功能的实现以及生物的进化过程中都扮演极其重要的角色。例如,抗体和抗原蛋白的相互作用,帮助生命个体识别和抵御外界病...
人早期胚胎发育的表观遗传调控(染色质组蛋白修饰+DNA甲基化
关键的未解决问题包括:组蛋白修饰是否调控EGA基因的及时诱导和随后的抑制?染色质修饰过程在赋予早期胚胎细胞与多谱系分化的持续能力相关的发育可塑性方面的确切作用是什么?在更多的胚胎期(包括植入后)对组蛋白修饰进行进一步分析,以及有针对性的表观基因组工程和功能丧失方法,以检测定义因子在胚胎和胚胎模型中的致病作用...
Nature Methods | 解码RNA与蛋白质相互作用的新视角:TREX技术的突破
NORADlncRNA:利用TREX技术,研究人员揭示了NORADlncRNA与其结合蛋白之间的复杂互作网络,这对于探究NORAD在维持基因组稳定性中的功能具有重要意义。TREX技术揭示的RNA与蛋白质的相互作用45SrRNA的区域性互作组织图谱TREX技术在揭示45SrRNA与RNA结合蛋白(RBPs)之间相互作用的研究中,展现出了前所未有的精确度和深...