质谱测蛋白序列需要多少蛋白?
1.传统的质谱分析对于较早的或更常见的质谱设备,分析一个蛋白质样品通常需要几微克到几十微克的蛋白质。2.高灵敏度质谱仪对于现代的高灵敏度质谱仪,如使用电喷雾电离(ESI)或基质辅助激光解吸/电离(MALDI)技术的设备,通常只需几百纳克到几微克的蛋白质即可进行有效分析。3.单细胞蛋白质组学在某些高端应用,...
代谢组学、单细胞蛋白组学……ASMS2024上这些质谱新技术值得关注
ECD特别适合用于研究大分子蛋白质、易损修饰和异构体残基——仅使用传统的碰撞诱导解离(CID)方法难以明确表征这些分析物。结合6545XT本身就有的完整蛋白质分析能力,ExD池还适用于对较大的和高电荷的蛋白质(如抗体)以及小一些的亚基(如肽)执行“toptomiddledown”表征,由此生成的丰富谱图信息可使用ExDViewe...
蛋白质组学前沿技术-蛋白冠蛋白质组学
申志远申志远博士在加入中国应脉医疗团队之前,在Seer总部担任高级应用科学家负责北美地区客户技术支持和应用,主要方向是基于质谱技术的高通量无偏蛋白组学在学术科研以及制药领域的应用。应脉医疗是Seer公司在大中华地区的唯一战略合作伙伴。康林上海百趣生物蛋白质组学产品总监。在蛋白质组学领域拥有近10年工作经验,...
4D蛋白质组学解析:从静态到动态的生物大数据分析
3.生物大数据分析:4D蛋白质组学的特点之一是其产生的海量数据。这就需要强大的生物大数据分析技术来解读和提取有价值的信息。这涉及到统计学、机器学习和数据挖掘等方法的应用,以发现蛋白质组的模式、趋势和功能。4D蛋白质组学的出现为我们提供了从静态到动态地解析生物大数据的机会。通过结合静态和动态分析,我们...
...AI Lab 姚建华、杨帆:腾讯 AI Lab 为何瞄准单细胞蛋白质组学?
论文一中建立的SPDB数据库,通过标准化处理不同来源的单细胞蛋白质组学数据,使得数据易于比较和分析,是目前全球数据量最大、覆盖技术和数据集最为广泛的单细胞蛋白质数据库。论文二中的scPROTEIN框架,针对单细胞蛋白组数据的特殊性提出了解决方案,能够处理数据中的不确定性、缺失值、批次效应和噪声问题。为基于...
...刘敦华教授等:枸杞果实生长发育过程中寡糖代谢的蛋白组学分析
通过iTRAQ定量蛋白组学技术,从生物过程、分子功能和细胞组成3个方面分析在GO数据库中所筛选到的差异蛋白,进而做更准确的功能注释(www.e993.com)2024年9月7日。如图2所示,通过GO功能注释,分别筛选出枸杞生长过程中5个时期与寡糖合成代谢相关的差异蛋白共461种。随着果实的不断发育成熟,与寡糖合成相关的蛋白质在数量和丰度均有显著变化,上调...
华大基因获8家机构调研:公司自主开发的“Dr.Tom多组学数据挖掘...
答:公司自主开发的“Dr.Tom多组学数据挖掘系统”可以快速、深度地挖掘基因、蛋白和代谢数据,该系统整合了多个国际常用的基因数据库和生物信息分析工具,并优化了数据挖掘的方式和展现形式,还结合了云计算、人工智能和机器学习技术。通过该系统,科研用户可以方便的进行自助式多组学数据挖掘。专利布局方面,公司在生物信息异构...
质谱分析蛋白:从样本到结果所需的最低蛋白量
质谱分析所需的蛋白量因分析目标和采用的技术而异。例如,如果是需要确认单个蛋白质的身份,最低蛋白量通常在纳克级别;然而,如果是进行蛋白质组学分析以探索一组蛋白质的变化,那么所需的蛋白质量则可能达到微克级别。三、拓宽视角:质谱设备的进步随着质谱技术的不断进步,质谱设备的灵敏度和分辨率也持续提高,这使得...
十多家制药巨头联合发表Nature论文,揭示血浆蛋白质组学与遗传和...
在这项研究中,研究团队描述了使用基于抗体的临近延伸分析(PEA)技术,在英国生物样本库(UKBiobank)的54219名参与者的血浆蛋白质组学特征进行了分析。该研究提出了2923个蛋白质的全面蛋白质数量性状位点(pQTLs)映射,识别了14287个主要的遗传关联,其中81%以前未被描述,以及非欧洲个体的祖先特异性pQTL映射。该研究提...
科研人员开发uCoTargetX技术实现单细胞多组蛋白修饰与转录并行检测
RUNX1-H3K27ac染色质速率(chromatinvelocity)和轨迹分析,能在一定程度上预测心脏和造血谱系的分化路径,并提示RUNX1可能先于H3K27ac发挥驱动作用。进一步,研究人员巧妙地将uCoTarget与基于组合标签的转录组捕获技术相结合,开发出uCoTargetX,率先实现单细胞全基因组范围内多种蛋白-染色质的相互作用和mRNA同时捕获。同一...