“85后”摘取诺贝尔奖,年纪轻轻收获顶级荣耀,靠的是什么?
它能通过深度学习模型直接从氨基酸序列预测蛋白质的三维结构,大幅提高了预测的准确性和效率。其预测结果的平均准确率达到了92.4%,几乎与实验结果相媲美。值得一提的是,与以往科学家获得一个蛋白质结构通常需要数年时间不同,有了AI的加持,同样的实验现在只需几分钟就能完成!这实在是令人惊叹。那会儿,36岁的江珀就被...
2024化学诺奖接力青睐AI,蛋白质结构预测新工具获一半奖项
蛋白质拥有广泛的生物学功能,包括结构组分(胶原蛋白)、催化功能(酶)、调节作用(激素)、物质运输(血红蛋白)、机械收缩(肌动蛋白)、机体免疫(抗体)等,进而参与几乎所有生命过程,如分子水平的DNA复制和转录、蛋白质翻译、物质与能量代谢等,以及细胞层面的精卵融合、细胞增殖和分化、细胞凋亡和坏死、细胞衰老和细胞通信等...
借助AI模型破解蛋白质结构的密码
另一个重大发现是科学家能够预测蛋白质的结构了。蛋白质中的氨基酸像长串珠子一样连接在一起,折叠成复杂的三维结构,这种结构对蛋白质的功能至关重要。自20世纪70年代以来,科学家们就一直在努力根据氨基酸序列预测蛋白质的结构,但这一直是个巨大的挑战。四年前,这一领域迎来了重大突破。2020年,哈萨比斯与江珀提出...
科普|人工智能助力破解蛋白质神奇结构密码——2024年诺贝尔化学奖...
“30年前,如果能用实验设备解析一种蛋白质结构就完全可以发表一篇博士论文,因为那是一件极为困难的事情,”诺贝尔化学委员会评委邹晓冬9日接受新华社记者采访时说,得益于今年诺贝尔化学奖获奖成果,人们现在可以设计蛋白质,还可通过人工智能预测蛋白质三维结构,“这是一个非常大的革命”。曾经不可实现的梦想蛋白...
三名科学家因破解蛋白质结构密码分享2024年诺贝尔化学奖
贝克当天接受电话采访时说,他获得这一殊荣是站在了巨人的肩膀上。蛋白质结构预测真正凸显了人工智能的力量,使人们得以将人工智能方法应用于蛋白质设计,大大提高了设计的能力和准确性。今年三个诺贝尔科学奖项中的两项均与人工智能相关。此前,诺贝尔物理学奖授予了在使用人工神经网络的机器学习方面做出基础性发现和发...
2024化学诺奖专家解读:颁给蛋白质预测和AI实至名归,化学家还不会...
沈琦告诉澎湃科技,有了这些预测工具之后,科学家们能够根据氨基酸序列快速计算出蛋白质的精细结构,大大提高工作效率(www.e993.com)2024年10月17日。另外,通过AI也能高效设计和验证新的蛋白结构,帮助新药开发和人工生命体的构建。“从蛋白质一级结构预测高级结构是化学生物学家、结构生物学家和物理化学家都非常关心的一个重要问题。”他说,“AI确实...
力德福|超高压技术助力胡萝卜复合果汁开发
超高压技术利用100-600MPa以上的压力,在常温或较低温度条件下,使食品中的酶、蛋白质及淀粉等生物大分子改变活性、变性或糊化。其主要原理是高压能引起菌体蛋白中的氢键、离子键、疏水键、二硫键等较弱的非共价键类变化,使蛋白质高级结构破坏,从而导致蛋白质凝固及酶失活。同时,超高压还可造成菌体细胞膜破裂,使菌...
David Baker:可预测所有生物分子,生成具有高级结构的蛋白质
实验室测试表明,RFdiffusionAll-Atom可以产生具有高级功能的蛋白质,比方说,产生带有口袋的蛋白质,这些口袋可以与特定小分子化合物结合。通过概念验证,研究团队发现这些设计的蛋白质可以与包括类固醇地高辛、富含铁的血液分子血红素以及植物用来吸收阳光的化学物质结合。这进一步表明,AI可以产生多种高级的生物功能。
深圳湾实验室周耀旗:填补AlphaFold 2缺口,开启所有蛋白质结构的高...
“这是一个蛋白质结构预测时代。”厘清生命科学的底层逻辑,在基础科学与临床药物之间搭起一座桥梁,是无数人的终生理想。在蛋白质这一命题上,曾有全球科技巨头谷歌旗下的前沿人工智能企业DeepMind,将机器学习和系统神经科学的最先进技术结合起来,建立强大的通用学习算法,最抢眼的一大成果便是在蛋白质结构预测上的应用...
薛定谔高级总监:AlphaFold 模型可以用于基于结构的药物设计吗?
由于AlphaFold2蛋白质结构目前不包含任何配体信息,因此,该模型会导致许多活性命中被错误分类为诱饵化合物。然而,如果我们使用IFD-MD对接已知的命中分子,我们就能够提高AlphaFold模型的性能,IFD-MD是一种基于分子动力学的诱导拟合对接技术,可以重组蛋白质以适应结合配体。使用这些IFD-MD改进结构的虚拟筛选...