为什么诺贝尔化学奖又被人工智能学者拿了:阿尔法折叠,蛋白质结构...
它能从蛋白质的一级结构,即氨基酸序列的组合,来预判1)蛋白质的二级结构,即蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构;2)三级结构,即在二级结构基础上多段进一步折叠盘绕后形成的特定空间结构;3)四级结构,即蛋白质-蛋白质复合形成的结构,是更为复杂的生物大分子。AlphaFold系列对蛋白质结构与功能的预测,有望对人类在...
2024化学诺奖接力青睐AI,蛋白质结构预测新工具获一半奖项
蛋白质拥有广泛的生物学功能,包括结构组分(胶原蛋白)、催化功能(酶)、调节作用(激素)、物质运输(血红蛋白)、机械收缩(肌动蛋白)、机体免疫(抗体)等,进而参与几乎所有生命过程,如分子水平的DNA复制和转录、蛋白质翻译、物质与能量代谢等,以及细胞层面的精卵融合、细胞增殖和分化、细胞凋亡和坏死、细胞衰老和细胞通信等...
诺贝尔化学奖颁给DeepMind,AI是如何终结蛋白质研究的?
上:从左往右依次为SARS-COV-2刺突蛋白、新冠疫苗靶点;5-羟色胺受体、管控情绪与消化;血红蛋白、输送血液中的氧气;细胞因子、调节免疫防御。下:从左往右依次为胶原蛋白、让组织成型;萤火虫萤光素酶、发光;抗体、鉴别外来物质;胰岛素、调节血糖;淀粉酶、消化淀粉;瘦素、控制食欲。图源:RCSBPDB当谷歌的公关部门向...
诺贝尔化学奖:人工智能终结了蛋白质研究吗?-虎嗅网
上:从左往右依次为SARS-COV-2刺突蛋白、新冠疫苗靶点;5-羟色胺受体、管控情绪与消化;血红蛋白、输送血液中的氧气;细胞因子、调节免疫防御。下:从左往右依次为胶原蛋白、让组织成型;萤火虫萤光素酶、发光;抗体、鉴别外来物质;胰岛素、调节血糖;淀粉酶、消化淀粉;瘦素、控制食欲。图源:RCSBPDB当谷歌的公关部门向...
AI蛋白质折叠:在生命宇宙中漫游,远眺生物经济的流光
究其原因,一方面蛋白质是一个非常大的体系,由成千上万个原子组成,对应一个非常大的搜索空间,构型是千变万化的;另一方面,虽然研究者普遍接受蛋白质折叠到最小能量状态,但对于“能量函数到底是什么样的”这个问题,研究者们莫衷一是。巨大的研究价值,加上有限的研究手段和缓慢的研究进展,让蛋白质结构研究成为现代...
胶原纤维瘤样增生是什么病
核心提示:胶原纤维瘤样增生是一种以过度产生胶原纤维为特征的结缔组织疾病(www.e993.com)2024年10月16日。胶原纤维瘤样增生是由于细胞外基质蛋白异常积聚导致的。这些蛋白质包括胶原蛋白和其他结构蛋白,在正常情况下帮助支撑身体组织,但在该疾病状态下胶原纤维瘤样增生是一种以过度产生胶原纤维为特征的结缔组织疾病。
凭什么AI能屡屡斩获诺奖在内的国际大奖?AlphaFold重塑了蛋白质科学
为了理解蛋白质的构建原理并探索其结构,科研人员采用了多种方法。他们试图用能量方程表达物理间的相互作用,同时运用X射线晶体学和其他技术来制作可作为蛋白质结构蓝图的模板。此外,他们还结合了关于特定氨基酸的知识(比如说是否带电荷)以及它们在链上的位置,以获得关于蛋白质结构特征的线索。
PNAS:颜宁团队以《荷塘月色》为灵感,报道结构生物学研究新范式
由于TLP-1原纤维是从环境中收集的,预测结构与TLP-1相似的蛋白在UniProt数据库中都没有特定的功能注释。虽然对实验结构没有得到任何相似的折叠,但他们在检索到的许多相近序列中发现了一个有趣的特征,即所有检索到的细菌起源的实验结构都是通过DSE机制组装的菌毛。
AI革新:蛋白质设计新突破,助力癌症与痴呆症研究
IDPs是一种无法折叠成稳定或有序三维结构的蛋白质,被认为在健康系统和各种疾病的病理生理学中都具有重要的生物学意义。与折叠的蛋白质不同,IDPs的特点是高度无序、局部移动性和高动态性,对现有预测工具而言尤其具有挑战性。这项研究不仅在理论上提出了新的设计方法,还通过实验验证了设计的IDPs变体,并使用机...
诺奖解读|马剑鹏:AI已绕不开,不能再不懂,宜从娃娃抓起
“在你身体的每个细胞内,数十亿个微型机器——蛋白质——正在努力工作。”有人甚至说,几乎生命的一切特征都跟蛋白质有关。的确,蛋白质是每个生物体中每个生物过程的基础,它是生命的基石。没有蛋白质,生命就无法存在。结构是如此重要,蛋白质复杂而多样的结构,对应了各种惊人的功能,从而促成了生命的丰富多彩。