【本月之星】人全基因组文库、鼠激酶组文库、 RNA结合蛋白文库

CRISPR文库筛选是一种基于CRISPR/Cas9技术的高通量基因筛选方案,通过构建包含成千上万个sgRNA的文库,并将这些sgRNA克隆到慢病毒载体中,以低MOI感染靶细胞。这种方法可以确保每个细胞只被一种sgRNA感染,从而实现针对不同sgRNA对应基因的功能筛选。对此,小编为大家解读三篇CRISPR文库相关的研究文献,希望能为大家的科研道路...

iMeta | 北大深圳医院桂耀庭组揭示弱精子症患者精浆微生态的动态...

16SrDNA测序是微生物研究领域极其重要的方法,可以实现微生物群落的表征,包括有益微生物群落,致病微生物群落和其他微生物群落。本部分采用十六烷基三甲基溴化铵和十二烷基硫酸钠(CTAB/SDS)法提取样品的基因组DNA,并使用附有唯一条形码特异性引物(341F:CCTACGGGRBGCASCAG;806R:GGACTACNNGGGTATCTAAT)进行基因的扩增。

详解丨基因KO了,蛋白还残留?

片段敲除可以移除基因的较大片段,使基因功能丧失,减少蛋白质残留的可能性。源井生物红棉CRISPR基因编辑系统自动设计敲除方案,优选片段方案,覆盖更多转录本,智能化基因型预测,最大程度降低基因敲除后蛋白质残留的可能性,并减少gRNA的筛选成本。03红棉3大神器——评估项目风险如果基因表达水平的本底就很低,使用W...

一天两篇Nature!值得了解的铁死亡靶点筛选思路

Kraft等人使用三种不同铁死亡诱导方式(RSL3、IKE和GPX4基因敲除)处理小鼠成纤维细胞,并进行全基因组激活文库筛选。通过比较分析三种不同处理方式中sgRNA富集信息,研究者们发现只有GCH1基因在这三种处理条件下均显著富集。该团队进一步研究发现,GCH1通过促进抗氧化剂BH4的表达从而抑制细胞铁死亡[6]。无独有偶,Soula等人用...

《自然》:控糖或能让神经干细胞恢复活力!斯坦福科学家揭秘衰老...

说是大活儿一点都不夸张,研究者建立了23000个蛋白质编码基因的sgRNA文库进行了体外筛选,每个基因准备了10个不同的sgRNA,另外还有15000个对照sgRNA,工程还是很庞大的。分析的神经干细胞分别取自3-4月龄的年轻小鼠和18-21月龄的衰老小鼠。不用多说,衰老小鼠神经干细胞的激活能力显然更差,大约只有年轻小鼠的一半。

新技术为肿瘤化疗耐药研究打开“新大门”

该研究通过30套全基因组CRISPR基因敲除筛选以及26套成药基因文库筛选,系统地鉴定了多种肿瘤细胞对于7种常见化疗药物(奥沙利铂、伊立替康、5-氟尿嘧啶、阿霉素、顺铂、多西他赛和紫杉醇)的化疗耐药相关基因,揭示了肿瘤化疗耐药的全局性规律和分子基础,并提出了对抗耐药的潜在治疗策略(www.e993.com)2024年11月21日。

天津工生所开发基于碱基编辑的全基因组扰动文库构建与筛选技术

中国科学院天津工业生物技术研究所研究员王猛带领的高通量编辑与筛选平台实验室与生物设计中心平台实验室合作,结合胞嘧啶碱基编辑技术以及靶向全基因组的sgRNA混合文库,以在基因编码区提前引入终止密码子的方式,开发了全基因组规模单基因失活文库的构建方法,并用于功能基因的筛选。该方法不产生DSB、无需添加外源DNA模板、...

华中农业大学构建基于猪CRISPR文库技术的高通量功能基因筛选平台

图1.猪全基因组CRISPR敲除文库(PigGeCKO)设计和构建基于全基因组CRISPR文库设计构建关键功能基因高通量筛选平台,对于功能基因组研究和品种改良具有重要产业价值,更将大力推动家猪功能基因鉴定进入精准、高通量研究的新阶段,为基因功能鉴定和育种提供新思路和新策略。近年来,该团队在sgRNA设计软件开发(biootools)、高...

「前沿资讯」CRISPR文库筛选新动向

在本研究中开发了一种肺炎克雷伯菌CRISPRi文库筛选方法即（Mobile-CRISPRi-seq），识别在体外抗菌适应和体内宿主免疫中发挥关键作用的基因。Mobile-CRISPRi-seq针对肺炎克雷伯菌870个CE基因，发现了甲氧苄啶筛选下四氢叶酸合成途径基因folB和folP的缺失。应用Mobile-CRISRPRi-seq和比较基因组学筛选策略，还鉴定了与多...

湖南党史的“百科全书”《湖湘红色基因文库》系列丛书出版

《湖湘红色基因文库》正式亮相。红网时刻7月28日讯（记者蔡娟郭薇灿任晔朱丽萍管一桦）7月28日下午，《湖湘红色基因文库》新书发布会在湖南长沙举行。由中共湖南省委研究部署的庆祝建党百年大型党史资料丛书首批图书正式出版。省委常委、省委秘书长张剑飞出席发布会并讲话，《文库》编纂出版有关负责人、编撰作者、...