AI革新蛋白质设计,药物设计潜力凸显
由于蛋白质结构繁杂且变化多端,以往科学家要更多依赖于专家指导及湿实验验证的方法不断尝试探索,才能实现对蛋白质功能的精确调控,不仅耗费较大人力物力,成功率和项目周期都难以把握。“蛋白质结构的复杂性以及序列空间非常大,这两点导致以往依靠专家经验理解和高通量筛选等方式进行的蛋白质设计难以获得良好效果。”天骛...
实现蛋白质动态对接预测!上海交大/星药科技/中山大学等联合推出...
在基于靶点的药物发现过程中,筛选潜在候选药物和反向筛选(针对特定化合物确定蛋白质靶点)都至关重要。为了评估DynamicBind模型在实践中的筛选性能,研究人员在模型中添加了一个亲和力预测模块,使用从PDBbind数据集中获得的实验测量的结合亲和力数据进行训练,并在2023年发布的抗生素蛋白质组的药物筛选试验数据(包括...
重磅!2024年诺贝尔化学奖:AI驱动的蛋白质结构预测革新肿瘤治疗
AI辅助的蛋白质结构预测技术与其他计算方法相结合,大大加速了药物发现和优化的过程,提高了药物开发的效率和成功率。虚拟筛选(VirtualScreening):利用预测的蛋白质结构,对大型化合物库进行快速虚拟筛选,识别潜在的先导化合物,显著缩短药物发现时间。分子动力学模拟(MolecularDynamicsSimulation):结合AI预测的结构和分子...
CRISPR筛选在高阶遗传干扰研究中的新应用
一、通过慢病毒递送的dAsCas12a融合蛋白进行的CRISPRi缺乏活性在这项研究中,研究人员开发了一个基于AsCas12a的CRISPRi功能基因组学平台。AsCas12a是目前唯一在哺乳动物细胞中的组合筛选中被证明有效的Cas12a同源物。先前的研究使用dAsCas12a通过质粒瞬时转染在HEK293T细胞中进行CRISPRi。然而,当使用慢病毒递送的c...
Nature子刊:国际首次!Rapid Novor(快序生物)实现对人血清多抗直接...
该研究开发了一种融合传统蛋白质组学和从头测序技术的创新性方法,成功从接种SARS-CoV-2疫苗的人类血清多抗中精准鉴定到了一系列中和抗体,尤为值得一提的是,其中大部分是通过传统的B细胞测序技术无法获得的抗体序列。这一成果不仅展示了这种新方法从复杂的血清多抗中高效筛选抗体的可行性和巨大潜力,也是国际上首次发表...
2023 ASN现场直击丨评估蛋白尿的最佳方法究竟是什么?
而且现行许多疗法,如钠葡萄糖共转运蛋白2抑制剂(SGLT-2i)对于大量蛋白尿人群实际上更有效(图6)(www.e993.com)2024年10月16日。甚至血管紧张素转换酶抑制剂(ACEi)和血管紧张素受体拮抗剂(ARB)的有效性对于大量蛋白尿患者也更为有效。因此,在预测疾病的进展和筛选治疗方式方面,UPCR也具有较高的价值。
生命演化偏爱单一手性:为何蛋白质几乎都是“左撇子”?
由于二肽分子是由单个氨基酸与氨基酸前体——氨基腈连接形成的,其中氨基腈的手性可以通过化学合成方法进行调控,因此了解二肽的手性起源有助于理解生命分子演化的选择。Powner团队合成二肽的反应在水中发生,并与生物体中发现的所有氨基酸协同作用,因此这项工作为揭示第一批蛋白质是如何形成的提供了一条合理的实验途径。
“抗老第四巨头”——今年最火成分胶原蛋白竟然是智商税?!
在我们常规的认知中确实是这样,但重组胶原蛋白的研究者们从另一个路径给出了一些透皮方法,比如利用毛孔渗透,对重组胶原进行包裹等。▲这篇文章在小鼠胸椎左侧背部皮肤涂分子量55kDa的重组胶原蛋白,通过二次谐波和双光子激发荧光法观察重组胶原在体内的透皮吸收。
组学技术革命:从分子层面揭开疾病的面纱
这些变异毒株之间的区别在哪里?其中很重要的一点是,人们发现新冠病毒的刺突蛋白在不同毒株上的糖基化修饰方式存在很大的差异。不同的糖基化修饰方式意味着病毒不断调整刺突蛋白这把钥匙,想方设法打开人体细胞的大门。这一系列分析均得益于糖组学分析。其实起初,大家对于糖的认知也非常浅显,直至20世纪80年代,...
中国蛋白组学向何处去?
第一阶段:未知蛋白标志物筛选(biomarkerdiscovery)。这个阶段目的就是从样本中发展潜在的蛋白质标志物,常用的方法是不需要标记的非靶向质谱蛋白组学(DIA)。特点是要在尽可能多的样本中(1000个以上)尽可能地筛选更多的蛋白(比如5000种)。第二阶段:标志物验证(biomarkervalidation)。第一阶段可能从5000个蛋白...