Sci Adv:单细胞RNA测序和空间转录组学绘制金鱼端脑细胞类型图谱
ST(Visium,10xGenomics)是一种基于测序的全转录组原位基因检测方法;在失去细胞分辨率的情况下,该方法保留了mRNA分子的位置信息,每个55μm直径的捕获点排列成一个阵列,中心(X-Y)间隔100μm。研究者从两条金鱼的端脑上采集了8个10μm的冠状切片,每个切片平均间隔100μm(Z)。因此,在像素大小约为100μm时,ST数...
...Vazyme表观助力浙江大学王良静、陈淑洁团队合作发现抗癌新方法!
ChIP-qPCR、CUT&RUN-qPCR和CUT&Tag-seq的结果表明IPA处理后,转录因子T细胞因子1(TCF-1,由TCF7编码)Tcf7基因超级增强子位点的H3K27ac增加了(图4),进而促进CD8+T细胞的干性程序。图4.IPA通过修饰Tcf7基因SE区域的H3K27乙酰化来激活Tpex细胞F.Westernblot检测CD8+T细胞中TCF-1、H2AK5ac、H2BK5ac、H3...
中国医学科学院揭示新的调控心肌纤维化转录因子
通过单核RNA测序,研究人员付出了大量努力来揭示人类心脏的细胞异质性。然而,由于在检测转录因子方面存在的限制,心脏的转录调控网络尚未得到系统描述。2024年4月22日,中国医学科学院/北京协和医院胡盛寿,宋江平和李向杰共同通讯在SignalTransductionandTargetedTherapy(IF=39)在线发表题为”PBX/Knotted1homeobox-2...
安徽农大张照亮团队首次报道木本植物根系单细胞转录组图谱
影响因子：7.7涉及的欧易生物服务产品：10×Genomics单细胞转录组测序单细胞样本情况：茶树（Camelliasinensisvar.sinensiscv.Shuchazao）根尖区1.茶树根细胞簇的scRNA-seq鉴定茶树根系可以合成和积累大量的茶氨酸（图1A和1B)。茶树根的细胞类型，包括皮层（Co)、木质部（Xy)、韧皮部（Ph)、形成层（Ca...
【快讯】2024单细胞组学在风湿免疫疾病研究与诊疗中的应用研讨会...
报告中讲到,他们通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞TCR/BCR测序技术,深入分析了稳定期RA患者,在接种COVID-19加强疫苗前后的免疫细胞变化。研究结果表明,加强针疫苗对RA患者的免疫细胞亚群组成和比例的影响有限。但在接种后,CD8+细胞毒性T细胞(CD8+T_CTL)占比呈上升趋势,而初始B细胞(na??veB)和经典树突状...
卵巢衰老的秘密,你知道么?Nature子刊揭秘|人卵巢衰老的时空转录组...
通过单细胞RNA测序(scRNA-seq),共检测了来自9个卵巢组织的数万个细胞,通过聚类分析确定了八种主要的卵巢细胞类型(图1b);通过空间转录组学技术,在组织切片上捕获mRNA并进行测序,观察到了它们在时空上的转录组变化(图1a),构建了一个全面的人类卵巢衰老时空图谱(www.e993.com)2024年11月15日。研究人员还基于临床样本的分析结果,筛选出卵巢衰老相关...
Nature Methods | 从胚胎发育到疾病解析:FlowSig引领细胞间信号...
随着单细胞RNA测序(scRNA-seq)和空间转录组学(ST)技术的迅猛发展,研究者们可以在单细胞水平上获得成千上万个基因的表达数据。然而,由于这些数据的复杂性和高维度特征,直接从中推断出驱动生物过程的细胞间通信流动仍然具有很大挑战。因此,开发能够有效分析这些数据并揭示细胞间通信流的方法成为当下的研究热点。
追问weekly | 过去一周,脑科学领域有哪些新发现?
研究团队利用果蝇模型,探讨了休眠神经干细胞向神经节延伸的富含肌动蛋白(actin)的突起的功能。通过扩展和超分辨率显微镜,科学家们揭示了这些突起中的精细肌动蛋白丝(F-actin)结构,并发现F-actin的聚合能够促进心肌相关转录因子的核转位,这一过程对于神经干细胞的再激活和大脑发育至关重要。
男同胞松口气!睾丸中未见新冠病毒
论文提出,需要在男性新冠肺炎患者康复后对其生殖系统进行更详细的生理和病理检查,才能得出关于睾丸是否可能受到新冠病毒攻击的确切答案.此前,美国国立卫生研究院的研究人员利用单细胞测序技术成功鉴定出了ACE2在睾丸中细胞的特异表达,表明睾丸可能是新冠病毒感染的潜在靶标.相关成果4月9日发表于《...
Nature连发10篇,揭示迄今最全小鼠完整大脑细胞图谱
过程中,研究团队将MERFISH与单细胞RNA测序数据结合进行成像,放入艾伦研究所的小鼠全脑通用坐标框架中,创建出单细胞空间图谱(每个细胞都有全转录组表达谱),可以系统地定量分析各个脑区的细胞类型和组成,推断细胞子类之间的特异性相互作用,预测配体-受体之间的分子关系,以及细胞-细胞相互作用的功能。