谷歌DeepMind再放大招!AlphaProteo直接设计全新结合蛋白,加速药物...
基于AF的蛋白-蛋白对接/蛋白-多肽对接利用AF2做多构象预测和功能发现基于AF2的环肽设计d)trrosetta幻想设计e)基于ProteinMPNN的蛋白质设计MPNN模型简介设计流程方法比较第四天蛋白质的从头生成模型a)扩散模型b)RFdiffusion实现蛋白结构设计蛋白Binder生成蛋白骨架设计单体蛋白从头生成多聚体蛋白从头生成...
质谱测定氨基酸序列
(1)蛋白质消化:大的蛋白质首先通过特定的蛋白酶(如胰蛋白酶)切割成较小的肽段。(2)肽段纯化:使用HPLC或其他色谱方法对肽段进行纯化。2、肽段电离在质谱仪中,肽段首先被电离,常见的电离方法包括电喷雾电离(ESI)和基质辅助激光解吸/电离(MALDI)。3、串联质谱(MS/MS)分析被选择的前体离子进入碰撞室与气...
一谱识菌: MALDI-TOF MS 在病原微生物临床应用的专家共识
基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assistedlaserdesorptionionizationtime-of-flightmassspectrometry,MALDI-TOFMS)是一种新型软电离有机质谱技术,用于分析生物分子(如DNA、蛋白质、多肽、糖类等)和大分子量的有机分子??[??1??]??,使得微生物蛋白质指纹图谱进行菌种鉴定成为可能。随着MALDI-TOFMS...
串联质谱蛋白质测序方法综述:技术、应用与挑战
主要的原理包括肽段裂解、质谱分析和数据解析。2.串联质谱蛋白质测序的技术方法2.1液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)是目前最常用的蛋白质测序技术方法之一。它将液相色谱与串联质谱相结合,通过色谱分离和质谱分析,实现对复杂蛋白质混合物的测序。2.2胶质量谱(gel-basedMS)胶质量谱...
...| 突破质谱细胞术的瓶颈:ACE技术助力低丰度蛋白质检测
ACE方法概述:图a详细描述了ACE方法的工作原理,包括初始标记、引物延伸、热循环和金属探针杂交等步骤。展示了如何通过多次热循环扩增引物链,从而显著放大每个抗体上的金属信号。悬浮质谱细胞术中的应用:图b展示了ACE在悬浮质谱细胞术中的应用,说明ACE技术可以放大信号,使得低丰度标志物在质谱细胞术中的检测和定量成为可...
Nat Commun | 结合机器学习与血浆蛋白质组质谱分析可提前7年预测...
该研究包括三个阶段:第0阶段,通过非靶向质谱法推断蛋白质组学组成,识别潜在的生物标志物;第I阶段,将来自发现阶段的候选蛋白通过靶向质谱多反应监测(MRM)方法,应用于更大的样本队列中;第II阶段,对靶向MRM方法进行改进并分析更多样本,以评估靶向蛋白质panel的临床可行性(www.e993.com)2024年10月16日。
首台(套)用于血清多肽及蛋白指纹图谱检测的飞行时间质谱仪ClinMS...
此次获批的ClinMS-Plat??I飞行时间质谱仪由质谱仪主机(离子源模块、检测器模块、飞行管、机架模块、外壳、真空泵)和软件组成,产品基于MALDI-TOF方法,结合配套试剂可用于人体血清样本中多肽或蛋白指纹图谱的采集,是国内首台(套)用于血清多肽或蛋白指纹图谱分析的临床质谱仪。仪器针对性地根据血清多肽分子量进行了检测区...
西湖欧米丨蛋白质谱学堂征集令
此次蛋白质谱学堂的课程内容,基于前两期学员提出的建议和此次部分已报名学员的“课程定制”,除了涵盖蛋白组学基础、质谱数据采集原理、蛋白组学数据分析基础等入门课程,还将涉及单细胞组学、修饰蛋白质组学、质谱个性化采集方法应用、个性化数据分析、多组学数据联合分析、AI大数据建模等高阶应用内容。
整合生命组学数据,揭示生命复杂系统构成原理
1.差异表达分析(DifferentialExpressionAnalysis):通过统计方法识别在不同条件下显著差异表达的基因。2.蛋白-蛋白互作网络分析(Protein-ProteinInteractionNetworkAnalysis):使用STRING,Cytoscape等工具构建蛋白-蛋白互作网络,识别关键节点和模块。例如:用DNAJC5查询STRING蛋白-蛋白相互作用网络。蛋白质之间的彩色线...
DropBlot——一种化学固定单细胞蛋白质组分析的混合微流控平台
利用DropBlot分析患者来源的肿瘤细胞样本,深入了解肿瘤细胞中蛋白质表达的异质性,为癌症研究和治疗提供新的见解和方法。研究要点研究过程一.工作原理概述及步骤DropBlot是一种用于化学固定单细胞蛋白质组分析的混合微流控平台,通过微流体H-型连接点产生水包油(W/O)液滴,将单个固定细胞与含有表面活性剂的抗原...