国产基因测序仪,在夹缝中爆发

高通量机型主要用于服务大规模、大人群的基因测序需求,比如大人群的全基因组测序、超深度外显子组测序、肿瘤Panel测序等,往往需要用到高通量测序仪。中通量基因测序仪主要用在常规的科研实验室中,低通量基因测序仪的应用场景则主要在临床上,比如肿瘤和感染性疾病的靶向测序、肿瘤早筛、遗传性疾病的筛查等。在国内,华...

沃信:分子杂交箱(杂交炉)在基因表达分析等领域的应用

基本原理:通过检测RNA的杂交反应,研究基因在特定条件下的表达水平和调控机制。分子杂交仪能够提供稳定的杂交环境,确保杂交反应的准确性和可靠性。应用实例:在基因芯片实验中,分子杂交仪用于将标记的RNA或DNA探针与固定在芯片上的DNA序列进行杂交,通过检测杂交信号强度来评估基因的表达水平。2.突变检测应用目的:通过...

利用DNA和RNA测序组合方法鉴定非小细胞肺癌靶向治疗的基因变异特征

目前,基因组DNA(gDNA)和全外显子测序(WES)通常用于NGS基础靶向治疗分析肿瘤组织样本中的变异,这些变异包括单核苷酸变异(SNV)、插入/缺失变异(indel)和拷贝数变异(CNV)。与此同时,信使RNA(mRNA)已被更广泛地用作识别融合和进行基因表达分析的输入模板。然而,由于表达水平变化较大,mRNA很少用于检测SNVs或indel等体细...

基因测序技术:就像考试做“问答题”

相较于NGS二代测序,纳米孔测序的优势在于:第一,可单次读取很长的DNA序列,从而更好地检测基因片段中缺失、重复等大规模的结构变异,获得更加清晰、完整的基因组信息。第二,速度快,基本可以实现样本进—测序—数据出的快速流程,而且数据产出的同时就可以进行信息分析,明确疾病、突变或感染类型,做到实时测序、快速获得检...

整合生命组学数据,揭示生命复杂系统构成原理

1.差异表达分析(DifferentialExpressionAnalysis):通过统计方法识别在不同条件下显著差异表达的基因。2.蛋白-蛋白互作网络分析(Protein-ProteinInteractionNetworkAnalysis):使用STRING,Cytoscape等工具构建蛋白-蛋白互作网络,识别关键节点和模块。例如:用DNAJC5查询STRING蛋白-蛋白相互作用网络。蛋白质之间的彩色线...

指南共识丨纳米孔测序在病原微生物检测中的应用专家共识

依据检测目的和方法的不同,TGS主要分为靶向测序(targetednextgenerationsequencing,tNGS)、宏基因组测序(metagenomicsnextgenerationsequencing,mNGS)和全基因组测序(wholegenomesequencing,WGS)等方向;依据测序原理的不同,则可分为纳米孔电信号测序[以纳米孔单分子测序(以下简称“纳米孔测序”)为代表]和单分子...

疾驰七载,这匹“黑马”还会带来测序行业新变革吗?——深度访...

最大的“不一样”体现在化学方法的革新。AVITI测序仪的测序方法不再是下一代测序中主流的边合成边测序技术(SBS),而是ABC亲和力测序(ABC,Aviditybasechemistry)。这种测序化学是全新的测序化学原理,通过对测序芯片表面降噪技术,原位线性扩增技术,以及亲和力测序化学实现了更高精度、低成本的测序技术革新。同时亲和力...

2024诺贝尔生理学或医学奖 | microRNA:揭开细胞发育之谜

今年的诺贝尔生理学或医学奖表彰了维克多·安布罗斯(VictorAmbros)和加里·鲁夫坤(GaryRuvkun),他们发现了调控基因活动的一个基本原理。每个细胞都包含相同的染色体,因此每个细胞都拥有完全相同的一套基因和指令。然而,肌肉细胞和神经细胞等不同的细胞类型却表现出非常不同的特征。这些差异是如何产生的呢?答案在于基因...

瞭望丨美国盗取人种基因的八大手段

比如，位于美国硅谷的DNA测序公司“23与我”曾为客户提供基因侧写服务，还通过授予某全球性药业巨头基因数据许可使用权而获利3亿美元——以最直截了当的方式把基因数据变成了金钱。国内的公司也可能出于利益考虑而有意或无意地将基因信息传播出境。2016年，相关部门在检查中国一家药企时发现，他们试图将5000多份中国人...

基因编辑系列1-生命及其底层代码

而后，在对DNA认识的基础上，人们开始试图对这一底层代码进行控制的研究。1979年，利用酵母等内源重组效率高的单细胞生物实现基因替换，原始的基因编辑（Geneediting）登上历史舞台。1984年，我国科学家朱作言领导的团队培育出世界上第一条转基因鱼。1990年，人类基因组计划启动，2003年该计划的测序任务顺利完成，人类...