我国基因产业与全球先进水平基本并跑
可以检测罕见的eccDNA(Chenetal.NatCommun,2024);新加坡基因组研究所的团队发布可对细胞类型和基因表达进行原位分析的空间转录组学方法FISHnCHIPs,获得与单基因FISH相似的空间信息,且灵敏度提高2-20倍(Zhouetal.NatCommu,2024);应对大规模空间组学数据处理的开放式和通用数据框架SpaticalData在NatureMeth...
【学术进展】基因组学再创新高,生命科学迎来颠覆性进展,解决历史...
1.1全连接深度神经网络DNN在基因组学中的应用举例1.2卷积神经网络CNN在基因组学中的应用举例1.3循环神经网络RNN在基因组学中的应用举例1.4图卷积神经网络GCN在基因组学中的应用举例2.无监督的神经网络算法2.1自动编码器AE在基因组学中的应用举例2.2生成对抗网络GAN在基因组学中的应用举例实操内容1.Linux操...
一种新型研究的出现,造福全人类
实操内容包括DeePMD软件的进阶使用与补充讲解,包括多GPU并行训练,LAMMPS以多GPU并行方式运行机器学习力场模型,使用Python代码快速可视化机器学习力场模型在等变与不变设计上的区别,使用多种机器学习的降维方法结合K-Means聚类从分子模拟轨迹中以低冗余方式提取多帧结构文件,NequIP模型的超参数介绍和使用,...
2024年诺贝尔生理学或医学奖揭晓,专家解读微小RNA对基因调控的作用
这些miRNA大多能定位于细胞核内,而其进一步研究发现,这些miRNA能够与增强子结合,并在全基因组的水平上激活基因表达。于文强最后表示,此次针对microRNA领域研究获奖,也意味着现在诺奖不仅仅是停留在基础研究层面,还要能进一步去解决问题,miRNA激活基因的研究无疑是下一个研究热点,将推动miRNA研究进入2.0时代。“目前...
2024年诺贝尔生理学或医学奖揭晓!两位科学家获奖
03他们的突破性发现揭示了一种全新的基因调控原理,对于包括人类在内的多细胞生物至关重要。04事实上,microRNA对于生物体的发育和功能至关重要。05未来microRNA研究将更加侧重于转化、应用。以上内容由腾讯混元大模型生成,仅供参考学界早有预言,microRNA的研究,必然会诞生一个诺贝尔奖。如今,这一预言终于应验。
时代楷模!一种新型研究的出现轰动世界,造福全人类,成功通过细节...
05.深度学习基因组学06.机器学习代谢组学2201机器学习分子动力学第一天:理论与实操并行,开启分子动力学探索之旅第一天的课程内容丰富多样(www.e993.com)2024年11月18日。理论部分从诺贝尔奖的AI元年出发,探讨AI与SCIENCE的交叉,介绍科学研究的四范式,重点阐述了从大数据时代到AI4SCIENCE时代,如GoogleDeepMind/微软研究院/...
Cell | 癌症治疗的新前沿:基于蛋白组学与基因组学的免疫亚型鉴定...
研究采用的是多组学数据整合分析方法,通过整合蛋白质组学、基因组学以及其他组学数据,来揭示肿瘤免疫特性的全貌。这种方法可以帮助研究人员从多个维度理解肿瘤与免疫系统之间的复杂相互作用。为了保证分析的准确性,采用了高级统计模型和机器学习算法,对大规模的组学数据进行处理和分析。
AI+Science 新视野:用物理信息引导 AlphaFold 2 预测蛋白质动力学
图1:研究方法示意图:根据物理知识筛选MSA中的序列,引导AF2预测蛋白质的不同构象状态。2.蛋白质折叠的能量面与阻挫美国国家科学院院士、莱斯大学的PeterG.Wolynes教授(本文的合作者之一)及其同事在20世纪80年代提出的蛋白质能量面理论,为预测蛋白质结构与动力学提供了基本的物理学原理:蛋白质折...
特别关注|非酒精性脂肪性肝病多组学研究现状
表观基因组学是研究表观遗传机制的全基因组变化,包括DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重塑、基因印记和非编码RNA表达。这些修饰通过调节基因的表达,影响细胞功能和特性,从而影响个体健康。表观基因组学在医学领域具有重要意义,可为早期诊断和治疗提供新的思路和方法,对NAFLD相关研究有重要的促进作用。
CDE公开征求意见!规范腺相关病毒载体基因治疗产品非临床研究
(一)研究目的非临床研究是药物开发的重要组成部分。AAV载体产品非临床研究的主要目的是:(1)对拟定的作用机制进行概念验证,考察有效性潜力,明确其在拟定患者人群中使用的生物学合理性。通常包括:考察其携带的目的基因(或核酸片段)能否进入预期的靶细胞并表达为具有生理学功能的蛋白产物、蛋白产物能否对拟定适应症起到...