科学家基于AI构建蛋白质组年龄时钟,发现衰老与18种疾病风险密切...

研究人员使用基于梯度提升的机器学习算法和Boruta特征选择算法,来识别和优化与年龄预测相关的蛋白质标志物,不仅能够处理复杂的数据集、识别模式,还增强了蛋白质的准确性和稳定性。他们从近3000个蛋白质肽段进行筛选,确定了与年龄增长相关的204个关键蛋白质,进而基于这些蛋白质构建了预测模型。图丨研究设计和...

AI再问鼎诺贝尔化学奖!48岁DeepMind创始人因蛋白质结构预测摘桂冠

蛋白质可由十几个到几千个氨基酸组成,氨基酸链会折叠成特定的三维结构,而这种结构决定了蛋白质的功能有些蛋白质成为生命体的基本单元,可以构建肌肉、角或羽毛,而其他的则可能成为激素或抗体。其中许多蛋白质会形成酶,以惊人的精确度驱动生命的各种化学反应。位于细胞表面的蛋白质同样重要,它们充当细胞与其周围环境之...

...颁给AI?万字专题详解:计算和人工智能颠覆我们对蛋白质的理解方式

它的新版本AlphaFold3在2024年5月上线,引领生物学预测技术进入下一阶段:构建蛋白质与其他分子(诸如DNA或者RNA)结合的复合体结构。“这是迄今为止最宏大的‘机器学习驱动科学’的故事。”库雷希说道。不过,AI无法填补的鸿沟仍然大量存在。这类工具无法模拟蛋白质随着时间推移而发生的变化,或者说无法构建处于自身生存环境...

他们破译了蛋白质复杂结构的密码!解读2024年诺贝尔化学奖

蛋白质通常由20种不同的氨基酸组成,这些氨基酸如同组成生命的“积木”。2003年,贝克利用“积木”,成功创造出一种前所未有的新蛋白质,开启了构建全新蛋白质的大门。此后,贝克的研究小组不断发挥创意,创造出一系列富有想象力的蛋白质。这些蛋白质正在药物、疫苗、纳米材料和微型传感器等多个领域“大展拳脚”。精准预...

2024化学诺奖接力青睐AI,蛋白质结构预测新工具获一半奖项

第一进程,通过查询多个蛋白质的氨基酸序列数据库构建输入序列的多序列比对集(multisequencealignment,MSA)(MSA表征)。MSA的基本逻辑是同一功能蛋白质由于进化缘故,氨基酸序列会出现较大差异(如人肌红蛋白和鸽子肌红蛋白只有25%的氨基酸序列相同),但基本结构高度相似,据此作为结构预测的基础。同时,通过查询蛋白质...

营养专家建议老年人要吃些“肉”?原来这是保持年轻的原料

头发的主要成分也是蛋白质(www.e993.com)2024年11月8日。若缺乏蛋白质,为了保存能量和储存蛋白质,身体会减少头发中蛋白质的含量,这样头发就会发黄、变脆、变细,干燥且没有光泽、容易脱落。3、肌肉松弛蛋白质是构建和修复肌肉组织的关键,若缺乏蛋白质,肌肉会减少、松弛,力量下降,影响运动能力。

技术变革还是炒作噱头?AI for Bio到底能做什么|AI驱动科学

ArcInstitute开发的Evo是一种能够理解生物学三大基本语言(DNA、RNA、蛋白质)的长上下文生物基础模型。规模略小于ESM3(7B参数),基于80,000种细菌和古细菌的基因组训练得到[8]。它能够在给到提示后“自动补全”DNA、RNA和蛋白质序列的剩余部分。(可以通过Github获取,并直接在浏览器中使用。)...

Cell:利用蛋白质组学破解细胞表面的通信语言

他们的方法不仅让科学家们对细胞通信有了新的认识,还展示了蛋白质组学——对活细胞和生物体内所有蛋白质的研究,在解读细胞基本语言单位和揭开一些生物学最大谜团方面的潜力。Li说,“我们从构建蛋白质组学工具开始,然后将这些工具用于解决某些生物学问题,从而有所发现,同时也展示了蛋白质组学的威力。我们展示了蛋白...

又是AI?3位科学家获2024诺贝尔化学奖,AI抢夺科学家的最重要荣誉?

构建全新蛋白质的领域被称为denovo设计。研究团队绘制了一种全新的蛋白质结构,然后让Rosetta计算出哪种氨基酸序列可以产生所需的蛋白质。为此,Rosetta搜索了所有已知蛋白质结构的数据库,并寻找与目标结构相似的短片段蛋白质。然后,利用对蛋白质能量状态的基本认识,Rosetta优化了这些片段,并提出了一个氨基酸序列。

诺贝尔化学奖是AI for Science,物理奖是Science for AI

蛋白质可以由几十种氨基酸到几千种氨基酸组成这是一张教育性很强的示意图,清晰地展示了从基本构建块(氨基酸)到最终产物(蛋白质)的概念。左侧是一个环形排列,显示了20种基本氨基酸(AminoAcids)的名称:包括甘氨酸(Glycine);谷氨酸(Glutamicacid);