想改造蛋白质?交给人工智能吧

值得一提的是,功能标签是该模型的“独门秘笈”,借助它可以为蛋白质序列与前文提到的热稳定性、活性、亲和力、衰减耐受性等功能找到合理的对应方式。此前AlphaFold2预测蛋白质结构一鸣惊人,就是因为它完美实现了蛋白质序列到结构的对应,而蛋白质序列到功能的良好对应有助于蛋白质实现更优异功能,可谓改造蛋白质的“胜负...

他开创了AI蛋白质结构领域,现在要做比诺奖更大的事

结构性的蛋白质组成生物的身体——头发和指甲里的角蛋白,皮肤里的胶原蛋白,肌肉纤维里的肌球蛋白,血管里的弹性蛋白。功能性的蛋白质推动生物体内的机能与反应——帮助消化吸收的淀粉酶、脂肪酶,控制血糖的胰岛素,运输氧气的血红蛋白,存储铁的铁蛋白,传递信号的神经递质……一些蛋白质的大小对比。蛋白质分子的直径...

超越蛋白质结构,全面预测蛋白质与所有生命分子相互作用

这一最新模型能预测含有蛋白质数据库(ProteinDataBank)内几乎所有分子类型的复合物的结构,包括配体(小分子)、蛋白质、核酸(DNA和RNA)如何聚集在一起并相互作用,以及预测翻译后修饰和离子对这些分子系统的结构影响,从而帮助我们在原子水平上精确地观察生物分子系统的结构。这种用计算机解析蛋白质与其他分子复杂相互作...

AI精准预测蛋白质结构,结构生物学何去何从?颜宁等人点评

帮助解析了竞赛中涉及到的、实验多年没拿到的X射线晶体和cryo-EM冷冻电镜结构,比如T1058的膜蛋白是用了Alphafold2的预测模型之后,才跟原有晶体学数据综合成功解析了结构。AlphaFold2团队的JohnJumper报告表明,他们使用了基于注意机制的神经网络,动态调整网络中节点的顺序和链接;依靠的是端到端的优化整体构建结构,而不...

2024化学诺奖接力青睐AI,蛋白质结构预测新工具获一半奖项

它们控制并驱动所有化学反应,这些反应共同构成了生命的基础。蛋白质还作为激素、信号物质、抗体以及不同组织的构建模块发挥作用。“今年获得认可的发现之一是关于构建非凡的蛋白质;另一个则实现了一个50年来的梦想:从氨基酸序列预测蛋白质结构。这两项发现为未来开辟了广阔的可能性,”诺贝尔化学委员会主席Heiner...

诺奖得主David Baker学生沈浩署名文章:蛋白质设计究竟是什么?

未来,我的研究组将继续围绕蛋白质纤维展开,包括:设计蛋白质纳米导线、可控组装以及蛋白质机器等新型纳米材料等(www.e993.com)2024年11月8日。此外,还可以用于单分子检测的信号扩增、螺旋对称性辅助的冷冻电镜结构解析、碳纳米管纯化分离、功能分子排列、抗原呈递增强抗体生成、以及细胞生物学的研究。

AI概念大热!诺贝尔化学奖授予蛋白质结构预测领域科学家

郑鹏说,蛋白质是由氨基酸线性排列组合构成,但绝大部分蛋白质只有具备正确的三维结构才能行使功能,如何预测和得到蛋白的三维结构对科学家来说是一个很大的难题。而来自谷歌公司的戴米斯·哈萨比斯(DemisHassabis)和约翰·江珀(JohnM.Jumper)两位科学家,通过开发AlphaFold人工智能模型,实现了根据氨基酸序列准确预测蛋白质...

...丨2024年诺贝尔化学奖官方解读:他们通过计算和AI揭示“蛋白质...

图1.蛋白质可以由几十个到几千个氨基酸组成。一串串氨基酸折叠成三维结构,对蛋白质的功能起着决定性作用。(来源:ohanJarnestad)随后,研究人员主要使用X射线晶体学(通常需要付出大量努力)成功制作了约20万种不同蛋白质的图像,这为2024年诺贝尔化学奖奠定了基础。

AI再问鼎诺贝尔化学奖!48岁DeepMind创始人因蛋白质结构预测摘桂冠

蛋白质可由十几个到几千个氨基酸组成,氨基酸链会折叠成特定的三维结构,而这种结构决定了蛋白质的功能有些蛋白质成为生命体的基本单元,可以构建肌肉、角或羽毛,而其他的则可能成为激素或抗体。其中许多蛋白质会形成酶,以惊人的精确度驱动生命的各种化学反应。位于细胞表面的蛋白质同样重要,它们充当细胞与其周围环境之...

2024年诺贝尔化学奖官方解读:他们通过计算和AI揭示“蛋白质奥秘”

图1.蛋白质可以由几十个到几千个氨基酸组成。一串串氨基酸折叠成三维结构,对蛋白质的功能起着决定性作用。(来源:ohanJarnestad)随后,研究人员主要使用X射线晶体学(通常需要付出大量努力)成功制作了约20万种不同蛋白质的图像,这为2024年诺贝尔化学奖奠定了基础。