IF: 50.5! NanoTemper 解密 Nature 顶刊蛋白质与核酸互作发文思路
对于分子互作亲和力的检测,Monolith系列仪器不依赖于分子量变化,蛋白用量少,是一种在溶液状态下表征分子互作的技术。对于蛋白可能需要形成多聚体,在溶液环境下,更能有效的体现蛋白与蛋白互作的真实情况。当蛋白质形成复合物后,进一步的功能探究,如蛋白复合物与核酸的相互作用,通过Monolith系列仪器进行的实验设计更为简便...
郑州轻工业大学白艳红教授等:蛋白质磷酸化和亚硝基化互作对宰后...
这表明蛋白质亚硝基化会促进肌间线蛋白的降解,而蛋白质磷酸化抑制肌间线蛋白的降解,且当二者共同存在时,蛋白质磷酸化抑制蛋白质亚硝基化修饰进程,而蛋白质亚硝基化相反可能会促进蛋白质磷酸化对肌间线蛋白降解的抑制作用。5.2肌钙蛋白-T降解肌钙蛋白-T降解是宰后肉嫩化和成熟的标志。由图7可知,在整个孵育过程...
...团队研究成果:利用深度学习方法揭秘疾病突变对蛋白质互作影响...
蛋白相互作用界面(PPIInterface)可以反应蛋白质复合体的结合情况。有趣的是,尽管蛋白交互作用界面的信息并没有被输入MIPPI模型,在对Transformer层中注意力头(AttentionHead)输出可视化的过程中,高权重的输出比低权重更倾向于富集在互作区域(统计性显著)。这说明MIPPI模型学习到对预测有帮助的功能区域,充分体现了整体...
中国水产科学研究院南海所在国际食品顶刊发表“蓝色食品中蛋白质...
核心提示:蓝色食品是人类营养的重要食物来源,在全球食品供应方面发挥着重要作用。基于食品组分互作理论实现蓝色食品精细结构设计与风味调控是目前食品科学研究领域的热点。因此,从蛋白质与风味组分互作的视角设计美味的高蛋白蓝色食品是未来现代食品科技发展的重要方向。……(世界食品网-shijieshipin)2024年5月1日...
蛋白质互作质谱分析:从样本到结果的全面质谱分析蛋白
蛋白质是生物体内最重要的分子之一,它们在细胞内发挥着各种重要的功能。而蛋白质之间的相互作用对于细胞的正常功能和调控起着至关重要的作用。因此,研究蛋白质之间的互作关系对于我们理解生物体内的生命过程具有重要意义。蛋白质互作质谱分析就是一种用于研究蛋白质相互作用的重要技术。
Nature Methods | 超过AlphaFold2精度,蛋白质互作结构预测新工具
作者分析,DMFold-Multimer之所以能够产生高质量互作模型的原因主要在于两方面:一是DeepMSA2-Multimer使用了新颖的MSA构建、排序、配对和选择机制;二是DeepMSA2-Multimer使用了作者创建的一个包含约400亿个蛋白质序列的宏基因组数据库(www.e993.com)2024年7月10日。进一步地,DMFold-Multimer主要能够在两个方面提升蛋白质复合物的精度:一是提升组成蛋...
AI设计出来的蛋白质,有什么用?
但是,该团队还能指导程序在去噪过程中根据特定设计要求来设计蛋白质,这个过程名为“条件反射”(conditioning)。比如,Baker的团队让RFdiffusion设计有特殊折叠结构或是能附在另一个分子表面(结合背后的互作机制)的蛋白质。Grigoryan的团队还开发了一个名为Chroma的扩散网络,通过条件反射让它设计形似26个英语大写字母和...
研究发现一氧化氮互作蛋白调控低糖诱导神经元凋亡的新机制
该研究开发了在活细胞内捕捉“气体信号分子NO—底物蛋白”相互作用并具有时空分辨功能的新探针,为气体信号分子NO调控低糖诱导的神经元凋亡提供了新见解。????葡萄糖是大脑的关键能量底物,对维持中枢系统功能发挥重要作用。如果血浆葡萄糖浓度降至3.9mmol/L以下,则被认为进入低血糖状态,会对大脑功能产生显著负面...
Nature Methods | 解码RNA与蛋白质相互作用的新视角:TREX技术的突破
数据分析与结果解释通过TREX技术得到的数据需要进行详细的分析和解释,以确保实验结果的准确性和可靠性。数据分析主要包括蛋白质鉴定的结果分析、相互作用网络的构建以及功能注释。使用专业的软件对质谱数据进行处理,识别出特定的蛋白质。根据蛋白质的鉴定结果,构建RNA与蛋白质之间的相互作用网络,分析这些相互作用在细胞中...
Naveni PLA原位蛋白互作技术常见FAQ
1.什么是PLA技术?答邻近连接技术(Proximityligationassay)是一种定位蛋白质检测技术。将两种一抗分别与位于一种蛋白质或两种邻近蛋白质上的目标表位结合,再使用Navenibodies(与专有oligo臂结合的精选抗体)与各自的一抗结合,当Navenibodies靠近时,附着的寡聚物能形成DNAcircle,再加入聚合酶,就会启动滚圆...