AlphaFold为什么能精准预测蛋白质结构? | 返朴
蛋白质是美食的代名词,更是生命功能的物质基础,处处发挥作用:负责运送氧气的血红蛋白是蛋白质;帮助我们消化食物的消化酶是蛋白质;胰岛素、甲状腺素等激素是蛋白质;参加免疫反应的抗体也是蛋白质……据估计,人体内至少存在2万种不同类型的蛋白质,这些蛋白质的结构和功能千差万别,但构成它们的基本元素是一样的——由...
复旦团队开发新型AI算法“看清”蛋白质精细结构,可与AlphaFold...
该算法不但能够成功地解析冷冻电子显微镜(Cryo-EM)结构解析技术中因传统方法无法分辨而缺损的生物大分子(比如蛋白质、核酸或蛋白质/核酸复合物等)结构,并且高效精准地分辨出柔性结构域在受测样品中的构象分布。这一新方法能有效建立高精度的生物大分子结构模型,帮助解决药物设计中因目标蛋白结构不准而导致的新药研...
科学家首次发现线粒体基因编码第14个蛋白质
作为唯一的呼吸链复合物III的线粒体编码基因,刘兴国团队针对CYTB,其信使核糖核酸出线粒体而使用胞质核糖体的标准遗传密码编码全新蛋白质进行分析,并制定了这一187个氨基酸长的新蛋白质的抗体。他们利用液相色谱串联质谱鉴定了CYTB-187AA的外源特征肽,在多株人、鼠的细胞中鉴定了多条匹配的内源特征肽。随后使用Moon...
小核酸药物:二次进化
siRNA则是一条长约21-23个碱基对的双链RNA,在细胞核中转录后,双链siRNA以及相关的蛋白质便会穿过核孔,并在核孔中由RNaseIII核酸酶裂解形成单链siRNA。如此形成的单链siRNA与Ago等蛋白质结合,用于和互补mRNA的识别,并作为切割的模板,形成的蛋白复合物称为沉默效应复合物(RISC)。两种小核酸药物...
新一代蛋白质预测模型登上《自然》杂志,让生物世界更“高清...
《自然》杂志日前发表了由谷歌DeepMind团队和AI药物研发团队IsomorphicLabs的合作研究,展示了全新的蛋白质预测模型——第三代“阿尔法折叠”(Alphafold3)。新模型不再局限于预测蛋白质或蛋白质—蛋白质复合物的结构,而是能够破解蛋白质与各种生物分子所形成的复合体结构及其相互作用。革命性进展、诺奖级发现……一时间...
陈玲玲:RNA有自己的特点,别把它当蛋白质来“玩” | 走近科学
值得强调的是,非编码RNA在发挥功能的过程中常常是和蛋白质密不可分的,它们的合成就依赖蛋白质,也需要和蛋白质相互作用形成复合物,才能折叠成具有功能的构象,进而发挥生物学功能(www.e993.com)2024年7月28日。另一方面,许多蛋白质同样要依赖非编码RNA作为其“分子伴侣”“脚手架”“适配体”等发挥功能。
...大佬手把手教授!|蛋白|蛋白质|多肽|核酸|大分子|复合物_网易订阅
这一最新模型能预测含有蛋白质数据库(ProteinDataBank)内几乎所有分子类型的复合物的结构,包括配体(小分子)、蛋白质、核酸(DNA和RNA)如何聚集在一起并相互作用,以及预测翻译后修饰和离子对这些分子系统的结构影响,从而帮助我们在原子水平上精确地观察生物分子系统的结构。
AlphaFold为什么能精准预测蛋白质结构?
AlphaFold3不仅仅能够预测蛋白质的三维结构,也能预测更广泛的生物分子复合物的结构(包括蛋白质、核酸、配体等),以及生物分子之间的相互作用。有趣的是,尽管AlphaFold3对于预测精度和广度都有提升,它自身的模型架构相比AlphaFold2却更加简化而且通用了。AlphaFold2虽然使用了Transformer这种通用的模型,但同时它也加入...
哈佛学者开发出下一代基因编辑技术——点击编辑!无需DNA双链断裂...
理想的ssDNA招募结构域应该对ssDNA模板具有特异性,编码序列较小,催化融合蛋白-DNA复合物的动力学快速,并且不需要任何专门的修饰。HUH核酸内切酶(HUHe)是满足这些标准的蛋白质家族。HUHe是一类小蛋白,在绝大多数物种中均有分布,并且执行各种ssDNA特异性活动,包括ssDNA病毒复制、偶联和转座等。
近岸蛋白2023年年度董事会经营评述
公司秉承“专注底层创新,赋能生物医药行业”的理念,专注于重组蛋白质技术与应用解决方案,致力于为下游客户提供及时、稳定、优质的产品及服务,以蛋白质工具和技术的创新,助力全球生物医药企业和研究机构的技术与产品创新升级。公司从下游客户的应用需求出发,专注各应用领域业务,夯实重组蛋白核心竞争力,全面整合公司7大综合性...