AI蛋白质折叠:在生命宇宙中漫游,远眺生物经济的流光
生产契合人类需求的蛋白质产品,如药物、食品、调味品、新材料、营养保健品、化妆品等,进而推动现有以高污染、高耗能的化工原料为基础的社会生产生活重心,向着新型的、绿色环保的、可持续发展的生物基社会转变,成为当下科学家和产业界孜孜不倦的追求。
生物化学研究用哪个厂家的高速离心机?FUP品牌运行稳定、效率高
FUP品牌高速离心机通过调节转速和离心时间,可以有效地将混合物中的蛋白质与其他成分分离,实现蛋白质的初步纯化。此外,其先进的控制系统和易于清洁的不锈钢离心腔,确保了实验结果的准确性和可重复性,为蛋白质的结构与功能研究奠定了坚实基础。3.核酸提取DNA和RNA等核酸分子是遗传信息的载体,其提取是基因工程和分子生...
超越AlphaFold3,OpenAI投资的AI生物初创,分子结构预测新SOTA
RoseTTAFoldAll-Atom和AlphaFold3等方法引入了可以预测各种蛋白质和核酸结构、其共价修饰以及小分子配体与这些复合物相互作用的模型。Chai-1是一种用于预测分子结构的多模态基础模型,可以完成与药物发现相关的各种任务。该模型遵循Abramson等人的架构并进行了一些关键添加,包括语言模型嵌入和约束特征等。虽然Cha...
IF: 50.5! NanoTemper 解密 Nature 顶刊蛋白质与核酸互作发文思路
对于蛋白可能需要形成多聚体,在溶液环境下,更能有效的体现蛋白与蛋白互作的真实情况。当蛋白质形成复合物后,进一步的功能探究,如蛋白复合物与核酸的相互作用,通过Monolith系列仪器进行的实验设计更为简便,能够直观地展示相互作用的结果,从而凸显您研究的分子功能。Monolith分子互作检测仪...
Science最新封面 | 用突破性技术建模蛋白复合物
RFAA表明,可以训练单个神经网络来精确建模包含多种非蛋白质成分的各种通用生物分子组装体;可以对蛋白质-小分子复合物进行高精度预测;它还可以为具有两个或多个非蛋白质分子的蛋白质复合物生成准确的模型。预测和设计结果表明,RFAA已经了解了蛋白质-小分子复合物的详细特征,应该可以用于蛋白质-小分子复合物的建模,特别...
科学家研发新型核酸检测系统,无需依赖昂贵蛋白质酶,单次材料成本...
受自然酶和核酸酶的启发,通过实施异构模块(如aptamer、toehold)来设计异构的DNAzyme生物传感器,可以通过小分子、蛋白质、核酸或细菌等,调节因子介导其催化活性(www.e993.com)2024年10月8日。传统的异构DNAzyme生物传感器通常被设计成多组分分子复合体,通过具有toehold的抑制链,来抑制并释放DNAzyme。
分子互作|蛋白与蛋白、核酸、小分子互作检测技术介绍、应用及资料...
Biacore技术是一种基于表面等离子共振(SPR)原理检测生物分子相互作用的技术,可以用来检测蛋白和蛋白,蛋白和核酸,蛋白和小分子,抗原和抗体等之间的相互作用。通常将两种相互作用的物质中的一种作为配体偶联在芯片上,另外一种作为分析物流经芯片表面,当分析物和配体结合时,会引起芯片表面SPR角的变化。通过仪器监测SPR角度的...
“阿尔法折叠3”来了,极大提升对蛋白质-分子结构的预测能力
阿尔法折叠3能预测蛋白质与其他蛋白质、核酸、小分子、离子、修饰蛋白质残基的复合物,以及抗体-抗原相互作用。预测准确性显著超过当前预测工具,包括阿尔法折叠-多聚体。研发团队认识到这一新方法还存在一些局限性,比如约4.4%的结构会出现不正确的手性(一种对称特性),或是幻觉导致“飘带”(一种常见的蛋白质二级结构...
陈玲玲:RNA有自己的特点,别把它当蛋白质来“玩” | NSR
值得强调的是,非编码RNA在发挥功能的过程中常常是和蛋白质密不可分的,它们的合成就依赖蛋白质,也需要和蛋白质相互作用形成复合物,才能折叠成具有功能的构象,进而发挥生物学功能。另一方面,许多蛋白质同样要依赖非编码RNA作为其“分子伴侣”“脚手架”“适配体”等发挥功能。
追问|蛋白质结构预测模型再升级,解锁新功能直接作用药物设计
常珊:最直接的应用是相互作用复合物结构预测。药物需要通过与体内的靶标,也就是蛋白质等生物大分子相互作用,因此,准确预测相互作用是药物研发的基础。首先,传统的药物筛选需要有明确的靶标,并确定靶标表面与药物小分子或配体小分子结合的部位,而新模型可以直接预测合适的靶标结合位置,即不需要事先指定结合配体的口...