超越蛋白质结构,全面预测蛋白质与所有生命分子相互作用
AlphaFold3能够通过对药物分子(例如与蛋白质结合的配体和抗体)的预测,为药物设计赋能,从而改变人类健康和疾病过程中蛋白质的相互作用方式。AlphaFold3在预测药物相互作用方面达到了前所未有的准确度,包括蛋白质与配体的结合以及抗体与靶蛋白的结合。AlphaFold3在不使用任何结构信息的情况下,比最好的传统方法在PoseBusters...
10月18日外媒科学网站摘要:基因突变会增加生女儿几率
AlphaFold预测这三种精子蛋白质共同作用,形成一个复合体。其中两种蛋白质之前被认为对生育能力很重要。研究人员随后证实,第三种蛋白质对斑马鱼和老鼠的生育能力也至关重要,而且这三种蛋白质相互作用。研究小组还发现,在斑马鱼中,这三种精子蛋白质为卵子蛋白质创造了一个结合的地方,提供了一种机制,通过这种机制,两个细...
AI发现超16万种RNA病毒,中山大学、阿里云联合研究成果在国际顶刊...
AI与病毒学研究的结合正在突破这一难题。本篇论文提出了全新的深度学习模型“LucaProt”,它基于Transformer框架与大模型表征技术,结合蛋白质序列和内在结构性特征,在独立的测试数据集上表现优异,具有极高的准确性(假阳性率仅为0.014%)和特异性(假阴性率为1.72%)。据介绍,研究团队对来自全球生物环境样本的10...
AlphaFold为什么能精准预测蛋白质结构? | 返朴
蛋白质是美食的代名词,更是生命功能的物质基础,处处发挥作用:负责运送氧气的血红蛋白是蛋白质;帮助我们消化食物的消化酶是蛋白质;胰岛素、甲状腺素等激素是蛋白质;参加免疫反应的抗体也是蛋白质……据估计,人体内至少存在2万种不同类型的蛋白质,这些蛋白质的结构和功能千差万别,但构成它们的基本元素是一样的——由...
漩涡混合器(旋涡混匀振荡器)在核酸蛋白质提取、免疫学检测应用
4.核酸、蛋白质提取:在提取核酸、蛋白质等生物分子时,需要将不同浓度的溶液进行混合和分离。旋涡混合器能够快速、均匀地将溶液混合在一起,提高了提取效率和实验效果。5.免疫学检测:在免疫学检测中,旋涡混合器也发挥了重要作用。例如,在ELISA(酶联免疫吸附试验)中,需要将抗原、抗体与酶标抗体等试剂进行混匀,以...
靶向并摧毁tau蛋白缠结的新疗法是未来阿尔茨海默病治疗的希望所在
TRIM21特别适用于此任务,因为它具有一个特殊特征,一个被称为“RING”的蛋白质部分,该部分仅在两个或更多TRIM21蛋白质聚集在一起时才会被激活(www.e993.com)2024年10月18日。这意味着TRIM21蛋白质只有在与相邻的、聚集的tau蛋白质结合时才会激活并标记其目标进行破坏。小鼠大脑中的RING-诱饵(绿色)和tau蛋白(红色)...
AI 成功改写人类 DNA:全球首个基因编辑器开源,近 5 倍蛋白质宇宙...
Cas9蛋白,是CRISPR-Cas9基因编辑系统的核心组成部分,它是一种RNA引导的核酸酶,可以搜索人类基因组中的所有30亿个核苷酸,并在一个特定位点进行切割。这种核酸酶与单导RNA(sgRNA)复合在一起,sgRNA由一个在结构上与蛋白质相互作用的支架和一个间隔序列组成,后者可通过编程靶向基因组中的任何位点。
核酸药物研发加速 学科融合迫在眉睫
张礼和说,以前都是以蛋白质为靶点,是由于蛋白质来源于特定的mRNA。因此调节mRNA或mRNA前体的水平来治疗疾病,就成为药物化学家长远持续的追求。目前这已经成了一个新的领域。过去,药物研究领域的传统认识是寡聚核苷酸难以成药。于是,药物化学家的任务就是使它易于成药,包括如何使寡聚核苷酸药物更方便合成、使其在...
AlphaFold为什么能精准预测蛋白质结构?
Transformer的核心是一种被称为自注意力(Self-Attention)的机制,它使得模型能够学习出一段序列中每一个元素和其他元素的相关程度的高低。在语言模型的应用中,它能帮助模型学习到一句话中每一个词和其他词的相关性。在蛋白质结构预测的应用中,输入的氨基酸序列恰恰也是一种序列——氨基酸按顺序排列在一起,互相之间可以...
《自然·衰老》:阿尔兹海默病存在至少5种亚型,或可精准治疗
阿尔兹海默病的组织病理学定义为大脑中的β-淀粉样斑块和过磷酸化tau蛋白缠结。β-淀粉样蛋白是一种来自神经细胞脂肪膜内的大分子蛋白质,在患者脑内能够发现这些具有粘性的蛋白质聚集在一起并形成斑块,从而影响大脑功能。tau蛋白则是一种维持神经元轴突微管稳定性的蛋白质,而在阿尔兹海默病患者脑中,这种蛋白被发现...