微生物所科研团队揭示金针菇驯化过程中的基因组进化并识别菌盖...

研究表明,金针菇群体可以划分为与人工选择强度相对应的4个群体;栽培菌株的基因组较小,基因数目较少,遗传变异较低,基因表达多样性和杂合度也显著低于野生种群。进一步分析发现,驯化过程中,涉及β-内酰胺抗生素降解的基因和特定的MAPK信号通路基因发生丢失,使得栽培品种对病原菌的抗性减弱。通过基于PAV和SNP的GWAS和转录...

肇庆学院2025考研入学考试大纲:微生物学

通过学习,要求学生掌握相关微生物分类、形态、生理代谢、生长、遗传变异等基础理论知识,考查学生应用微生物学相关知识和技术分析和解决问题的能力。二、试卷结构1、考试形式:微生物学考试采用闭卷笔试形式,试卷满分为150分,考试时间为180分钟。2、试卷结构:考查题型:名词解释15分(5题),填空25分(25题),选择30分...

Science重磅综述:二十年的微塑料污染研究——我们学到什么?

微塑料的大小、形状、颜色和化学成分的多样性,以及微生物表面定居,影响生物对有机物的有效利用率以及不良效应的潜力。微塑料已经在1300多种水生和陆生物种中检测到,包括鱼类、哺乳动物、鸟类和昆虫(图3),其影响在生物组织的各个层次都是显而易见的,从亚细胞水平到食物网的稳定性。食入微塑料可能导致物理上的伤害,...

iMeta | 中科院微生物所王军组-MetaSVs:结合长、短reads用于宏...

结构变异(structuralvariants,SVs,包括大片段的插入、缺失、倒置和易位)显著影响微生物基因组中基因的功能,微生物组中的SVs与多种生物过程和人类疾病相关。随着测序和生物信息学技术的进步,越来越多的测序数据和分析工具已经被广泛用于微生物组SVs分析,导致对更专用的SVs分析工作流程的更高需求。此外,由于各种测序技术...

...赵方杰教授团队揭示诱发水稻“直穗病”空间变异的土壤微生物学...

arsM基因广泛分布于厌氧细菌中,并且部分微生物体携带的arsM基因在土壤Eh较低区域转录水平更高,具有arsM转录活性的宿主主要分布于18个不同的细菌门,这些微生物可能是导致水稻土中DMA积累差异的关键微生物类群,也是造成水稻“直穗病”空间变异的主要驱动者。

指南共识丨纳米孔测序在病原微生物检测中的应用专家共识

推荐意见3:针对新发突发传染病疫情防控,需要基于全长基因组进行病原微生物演化和变异分析时,推荐使用较长读长的纳米孔测序进行病原微生物全长基因组检测和分子溯源(www.e993.com)2024年11月20日。推荐意见4:对于需要区分高同源性的病原微生物亚型(例如结核分枝杆菌和非结核分枝杆菌)时,推荐使用较长读长的纳米孔测序以增加其特异性。

浅谈公共卫生管理中微生物实验室的安全保障

(一)新冠疫情中的微生物实验室。在新冠疫情期间,全球各地的微生物实验室发挥了关键作用。他们迅速开展新冠病毒的核酸检测,为病例的诊断和隔离提供了依据。同时,通过对病毒的基因测序,追踪病毒的变异情况,为疫情防控策略的调整提供了重要信息。(二)食源性疾病监测中的微生物实验室。微生物实验室对食品样本进行检测,能够...

从菌株之间的相互作用,解析控制着微生物群落的生态进化动态

基因组数据表明，同一物种的基因型变异，即菌株，共存，并且在天然微生物群落中丰富，然而，目前尚不清楚菌株在生态上是否等效，以及它们在什么特征遗传距离上可能表现出不同的相互作用和动态。我们通过在实验室中跟踪猪笼草Sarraceniapurpurea的10个分类学多样化的微生物群落来解决这个问题，超过300代，使用宏基因组测序，...

Cell | 泛癌多组学分析揭示转移性肿瘤中微生物组多样性与免疫治疗...

微生物群落与人体有着密不可分的联系,其在人体的多个生态位繁衍生息,同时也是宿主免疫系统和抗癌疗法应答的重要调节剂。微生物有助于免疫系统的发育,可维持粘膜屏障的完整性,已有研究揭示微生物组的组成、功能与癌症发生和治疗反应存在关系。特别地,肠道微生物组具有最大的微生物种类多样性,能够调节对免疫检查点阻断检...

易胖体质是因为“胖菌”?Nature Medicine最新研究揭示肠道微生物...

单核苷酸多态性(SNP)主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。全基因组关联研究(GWAS)是指通过扫描参与者基因组中数百万个单核苷酸多态性(SNPs),以寻找与疾病风险或其他性状相关的变异。这里则是将GWAS应用于人体微生物的基因变异与人体疾病的关联。